caractérisation des enzymes bovines et étude préliminaire du rôle ...

Résultats-Discussion : Annexe II
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Alignement des séquences protéiques de Pofut2 des différentes espèces
choisies pour l’étude phylogénétique.
Les séquences sont alignées par rapport à la séquence de Bos taurus qui sert ici de
référence. Les insertions et délétions sont symbolisées par * et les acides aminés identiques à
la séquence de référence, par -. Sous l’alignement, sont repérés par (*) les positions où l’acide
aminé est strictement conservé. Les portions de l’alignement surlignées en gris ne sont pas
prises en compte pour l’analyse phylogénétique (alignement délicat du aux degrés de
divergence entre séquences, insertions spécifiques, séquences partielles). Les motifs I, II et III
communs avec les α2- et α6-fucosyltransférases sont respectivement surlignés en bleu, rose et
vert. Les sites potentiels de N-glycosylation sont surlignés en jaune. Les acides aminés
définissant le peptide signal sont notés en gras et rouge, les motifs DXD sont notés en jaune et
surlignés en bleu. Les positions des introns chez le bovin sont repérées par une flèche (↓). Les
numéros d’accès des séquences dans Genbank sont référencés dans la publication 1.
Bos taurus MAALA***** ********** VVFLLLWAAS WPSAS***** ********AF GEE**FW*** 27
Rattus norvegicus ----S***** ********** --C---A--- -RPV-***** ********-S ---**--*** 27
Mus musculus ----S***** ********** --C---A--- -RPV-***** ********-S ---**--*** 27
Homo sapiens --T-S***** ********** F-----G-V- --P--***** ********-S -Q-**--*** 27
Pan troglodytes --T-S***** ********** F-----G-V- --P--***** ********-S -Q-**--*** 27
Gallus gallus ---HHPG*** ********** ***--MLLLL VLATL***** ********-- LPPAAA***Q 28
Xenopus tropicalis -AV******* ********** ********-- -RPRLLLLLG VCLSLLPR-C -D-GQ-S*** 32
Danio rerio --TNRGTAVS VHLHHILGYI T--IFVILS- KS-SA***** ********SE DDA**-R*** 42
Oryzias latipes ********** ********** *****FFLSI FAAFA***** ********-V KS-NV-S*** 19
Takifugu rubripes ********** ********** ********** ********** ********** ********** 0
Ciona intestinalis -SNC-L**** ********YF ILN-VFILL- YNY-V***** ********CE DAK******* 28
Ciona savignyi --KII***** ********** FC-I-ITLL- YNLVL***** ********CD NNNSK***** 27
Caenorhabditis briggsae -H******** ********** ***-PFLLLV LG-SV***** ********-L RSKVDQHHKV 26
Caenorhabditis elegans -H******** ********FF PIQ--VLFFA EKI-F***** ********-E NSDQ*T***V 27
Anopheles gambiae -NR******* ********** ******TVY- LLLLA***** ********FS QIVHT***** 19
Bombyx mori -K******** ********** *LISTIFFNL ILINA***** ********-I NT-NGYC*** 25
Drosophila melanogaster -RGSWPRLG* ********** ****FPALLL LLHLL***** ********TG SDAAVR***N 29
Drosophila pseudoobscura -HKMHRWRGS G********* *LR---VLLL L--SI***** ********-I ADRPAT***R 34
Drosophila yakuba -RGSWPRLG* ********** ****-PALLL LLHLL***** ********TV ADANFR***N 29
Plasmodium berghei -I******** ********** YNLISISLY- LIIIL***** ********TD IYAKT***** 24
Plasmodium falciparum -K******** *********F IIV---FFFF KVIDR***** ********VI CVTPQK**** 26
Plasmodium vivax -KGR-HIWVA L********* ********** ***LL***** ********-C LPPRFR***N 22
Cryptosporidium hominis -INFLYSILF SCILN***** **VR--FFIF IVVNA***** ********-N NSDQ*C***I 36
Cryptosporidium parvum -TNFLYPILL SCILN***** **IR--FFIF TVANA***** ********-N NSDQ*C***I 36
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