caractérisation des enzymes bovines et étude préliminaire du rôle ...
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caractérisation des enzymes bovines et étude préliminaire du rôle ...

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Résultats-Discussion : Annexe I __________________________________________________________________________________________ Intron 5 ↓ Bos taurus EEHRPLQKYM VWSDE***MV RTGEAQIHAH LI*RPYVGIH LRIGSDWKNA CAMLKDGTAG 261 Sus scrofa ---------- -----***-- -------R-- --*------- ---------- ---------- 261 Rattus norvegicus ----E----- -----***-- -------ST- -V*------- ---------- ---------- 265 Mus musculus ----E----- -----***-- -----L-SS- -V*------- ---------- ---------- 263 Canis familiaris ---------V -----***-- -----H-LT- --*------- ---------- ---------- 261 Homo sapiens ---------- -----***-- K--------- -V*------- ---------- ---------- 258 Pan troglodytes ---------- -----***-- K--------- -V*------- ---------- ---------- 258 Pongo pygmaeus ---------- -----***-- KV-------Y -V*------- ---------- ---------- 258 Xenopus tropicalis ----S--R-V ---EK***I- -A--E--QSL -V*-----V- ---------- -K-------- 250 Xenopus laevis ----S--R-I ---EK***I- -E--E--RSL -V*------- --------D- -K-------- 250 Gallus gallus ------H--- -----***-- KK---Y--SL -V*------- ---------- -N-------- 250 Danio rerio ---IG--QFV ----K***I- QE--GH-RNL -N*------- -------Q-- -KL--T-DT- 263 Oryzias latipes ---VG--RLV ----R***-- TE--EH-A-M -T*---L--- -------QS- -RL-ES-D-- 263 Takifugu rubripes ---VG--R-- ---EK***-- EE-DGH-EKL -V*------- -------QT- -G--DS-DM- 252 Tetraodon nigroviridis G--VG--R-- ---EK***-- QE-DQH-RTL --*-----V- --L-V--QT- -G--AS-EV- 252 Ciona intestinalis -KDKQ--R-V Q-TK-***LE NSA-KL-DLK -K*K------ --N-M---K- -DHV-N-L** 249 Ciona savignyi AGD-S----V E-K--***IK NAANEV-KNK -Q*------- --N-M---R- -EHV---I** 249 Strongylocentrotus purpuratus ASN-VI-N-F K-NEG***LF AEAKHHMDHL FNGE------ --T-I--ERS -ETVEGMR** 286 Caenorhabditis briggsae GKVWSI---L R--SR***IT EQAKKY-TNN -Q*K-F-AV- --NDA--VRV -DHIDLEK** 251 Caenorhabditis elegans GKVWSI---L R--SR***IT EQAKKF-S-N -A*K-F-AV- --NDA--VRV -EHIDTT-** 248 Aedes aegypti I-N-E-H--L K--VT***IE NAARDF-RNS -PKGAFM--- --N-I--IR- -DHV-ESS** 219 Anopheles gambiae Q-NLL-HR-L R--VK***YE TGAKQF-RDT -PRGAFI-V- --N-I--VR- -EHV-ESS** 252 Bombyx mori K-NVDM---L K--ND***IE HRSKLF-KKN MSGGGFL--- --N-Q--VK- -QHV--SP** 248 Drosophila melanogaster L-NCK--R-L Q--QR***YR EASKDF-REQ -PRGAFL--- --N-I--VR- -EHV--SQ** 261 Drosophila pseudoobscura L-N-E---H- Q--AK***YR DAARDF-RKV -PRGAF---- --N-I--VR- -EHV--SQ** 261 Drosophila yakuba L-NCK--R-L H--QR***YR DASKDF-REQ -PRGAFL--- --N-I--VR- -EHV--SQ** 261 Onchocerca volvulus WPDHF-FCRN LSIGPKRAI- KEANKYVAES -K*--FI--- --NDV--E-L -R-D-KTKLR 255 * ** ** * Bos taurus AH**FMASPQ CVG***YSRH TTAPLTMTMC LPDLKEIRRA LKLWVTAL** *****NAQSV 309 Sus scrofa --**------ ---***---- -A-------- ---------- --------** *****S---- 309 Rattus norvegicus S-**------ ---***---S -AT---T--- -------Q-- V----R--** *****D-R-- 313 Mus musculus S-**------ ---***---S -AT------- -------Q-- VT---R--** *****--R-- 311 Canis familiaris S-**------ ---***---S -A-------- ---------- V----E--** *****----- 309 Homo sapiens S-**------ ---***---S -A-------- -------Q-- V----RS-** *****D---- 306 Pan troglodytes S-**------ ---***---S -A-------- -------Q-- V----RS-** *****D---- 306 Pongo pygmaeus S-**------ ---***-G-S -A-------- -------Q-- V----RS-** *****D---- 306 Xenopus tropicalis S-**------ ---***-DKY RA-----E-- ------M--- -T---ERS** *****K-R-- 298 Xenopus laevis S-**V---A- --C***-D-Y RAG----D-- ------M--- -T---ERS** *****K-R-- 298 Gallus gallus S-**------ ---***-D-S -AV----D-- -------K-- --V--KKT** *****V-K-I 298 Danio rerio P-**------ ---***-D-Q -AL----N-- ----T----- V----KNT** *****G---- 311 Oryzias latipes P-**------ ---***---Q -AL------- ----A----- V----KKI** *****S-R-- 311 Takifugu rubripes P-**------ ---***-E-Q -AL---A--- ----G--L-- V-V--KKT** *****S-R-- 300 Tetraodon nigroviridis P-**------ ---***-E-Q -AL---PA-- ----Q--L-- V----EKT** *****SSR-- 300 Ciona intestinalis *DYP--S--- -T-***-Q-S -SKRF-YE-- Y-S-NTVKSH VLSL-KES** *****-SN-L 298 Ciona savignyi *DYP--S--- -T-***-K** **GRF-YE-- F-SDNTVKTH VLHVAK-I** *****G-N-L 294 Strongylocentrotus purpuratus *Q**M----- -HKVG**Q** **E-V-KA-- Y-TKEMVLEE TRAA-EKY** *****KTKH- 330 Caenorhabditis briggsae *NRPLF--E- -L-EGHHQ** **GQ---E-- I-NKQQ-VDM IVEK-GSI** *****G-K-- 299 Caenorhabditis elegans *NRPLF--E- -L-EGHHL** **GT--KEI- S-SKQQ-LEQ IVEK-GSI** *****G-K-- 296 Aedes aegypti *N**LFS--- -L-YRNEK** **GS--LE-- --SKEI-I-Q I-RQIKNHKE AYKNNEIK-- 272 Anopheles gambiae *N**LFS--- -L-YRNEH** **GQ--AEL- M-GRDT-I-Q --RQIKLHRE AAPDNPIRA- 305 Bombyx mori *M**LF-A-- ---YRNER** **G----S-- --KPS--LKR -FSRQIKRVI K*KLSDIKYI 300 Drosophila melanogaster *-**LF---- -L-YKNER** **GA-YPEL- M-SKEA-I-Q --RTIKNVRQ TQPDNEIK-- 314 Drosophila pseudoobscura *-**LF---- -L-YKNER** **GS-YPEL- MQTKES-V-Q --RTIKNVRQ TQPNNEIK-- 314 Drosophila yakuba *-**LF---- -L-YKNER** **GA-YPEL- M-SKEA-I-Q --RTIKNVRQ TQPDNEIK-- 314 Onchocerca volvulus NYLVQRFVLV ********** -AIN--VE-- --S-ET-IKD IMKKASD-** *****KVR-- 298 * 158

Résultats-Discussion : Annexe I __________________________________________________________________________________________ Intron 6 ↓ Bos taurus YIATDSESYL PEIQQLFKG* **KVKVVSL* KPEVAQIDLY ILGQADHFIG NCVSSFTAFV 365 Sus scrofa ---------- ---------* **-------* ---------- ---------- ---------- 365 Rattus norvegicus ---------V S-------E* **-------* ---------- ---------- ---------- 369 Mus musculus ---------V S-------D* **--R----* ---------- ---------- ---------- 367 Canis familiaris ---------V ----E----* **-------* --D------- ---------- ---------- 365 Homo sapiens -V-------V --L------* **-------* ------V--- ---------- ---------- 362 Pan troglodytes -V-------V --L------* **-------* ------V--- ---------- ---------- 362 Pongo pygmaeus -V-------V --L------* **-----N-* ------V--- ---------- ---------- 362 Xenopus tropicalis ------T-HT E---AFLGD* **--R--C-* Q-----M--- ---------- ---------- 354 Xenopus laevis ------P--T A---AFLGN* **E-R--C-* Q--------- --A------- ---------- 354 Gallus gallus -------P-T K----F-Q-* **-I-----* Q--------- ----S----- ---------- 354 Danio rerio --------HT T---K----* **-------* Q-DT--V--- ---------- ------S--- 367 Oryzias latipes ------VAHR ED-EK--E-* **-------* H-DW--T--- ---------- ------S--- 367 Takifugu rubripes --------HS GD-E---N-* **-------* R--L--M--- ---K------ ------S--- 356 Tetraodon nigroviridis ------K-HS GD-EK--R-* **-------* Q--S--T--- V-RK------ ---W--S--- 356 Ciona intestinalis F----AS--E N-FNNM--EA GLD-SI-K-* ENDELMM--A L-IES-R--- S-G--V---- 357 Ciona savignyi F----AK-FE E-FKTW--DA GLNIDIIK-* QKDELN---A V-IE--T--- S-G--VS--- 353 Strongylocentrotus purpuratus F----KF--Q K-LKEM-GD* **E---HH-* D-HMP----I ----SEF--- -------S-- 386 Caenorhabditis briggsae FV-S-KDHMI D--NEAL-PY E**IEAHRQ* EVDDMYTS-A -M-RS-L--- ----T-SHI- 356 Caenorhabditis elegans FV-S-KDHMI D--NEAL-PY E**IEAHRQ* E-DDMYTS-A -M-R--L-V- ----T-SHI- 353 Aedes aegypti FV-S-NNHMI HDLNEAL-RM D**IT--K-* PENNPHL--A ---MSN---- -----YS--- 329 Anopheles gambiae FV-S--NHM- G-LNDAL-RM D**-T--RH* PDGNPHL--A ---R-N---- --I--YS--- 362 Bombyx mori FV-S--NHMI E-LNAGLRRP E**I-ILKFQ PSSNPHL--A -----NY--- -----YS--- 358 Drosophila melanogaster FV-S--NHMI G-LNTALSRM G**IS-HK-* PEDDPYL--A ----SN---- --I--YS--E 371 Drosophila pseudoobscura FV-S-ANHMI G-LNAALSRM G**IS-HR-* PEDDPYL--A ----SN---- --I--YS--- 371 Drosophila yakuba FV-S--NHMI G-LNTALSRM G**IS-HK-* PEDDPYL--A ----SN---- --I--YS--- 371 Onchocerca volvulus FVSS-RNH-I D-LK-KLASL Q**IV-ERR* Y--NLH-N-A --SI------ ----TLS--I 355 * * * * * Bos taurus KRERDLHGRP ***SSFFGMD RPPQLRDEF* ********** *** 391 Sus scrofa ------Q--L ***------- ---------* ********** *** 391 Rattus norvegicus ---------- ***------- --S------* ********** *** 395 Mus musculus ---------Q ***------- --S------* ********** *** 393 Canis familiaris ------Q--L ***------- K--------* ********** *** 391 Homo sapiens ------Q--- ***------- ---K-----* ********** *** 388 Pan troglodytes ------Q--- ***------- ---K-----* ********** *** 388 Pongo pygmaeus ------Q--- ***------- ---K-----* ********** *** 388 Xenopus tropicalis -----V---- ***------- S-GAVQ--L* ********** *** 380 Xenopus laevis --D--V---- ***------- S-GVVQ--L* ********** *** 380 Gallus gallus -----V--K- ***------- H--R-----* ********** *** 380 Danio rerio ----NI---- ***-----L- Y-GKKNRNEE L********* *** 395 Oryzias latipes -----V---S ***------- --RKANAKEE L********* *** 395 Takifugu rubripes --Q--VQ-L- ***------- T-GN--VREE L********* *** 384 Tetraodon nigroviridis -----V--L- ***------- T-GRVNAREE L********* *** 384 Ciona intestinalis S-K-EVL--- ***NEY--AS DKHNEA-RSE L********* *** 385 Ciona savignyi S-K-KVLD-- ***NE---NL GNQNNA-HTE L********* *** 381 Strongylocentrotus purpuratus -----GN-K- ***-T-WSIG V********* ********** *** 404 Caenorhabditis briggsae -----HT-QS PRP-A---VR SARRHI-L** ********** *** 384 Caenorhabditis elegans -----HA-QS PRP-A---IR AVKRHI-L** ********** *** 381 Aedes aegypti -----AK-F- ***-T-WAFP A*EKHMSKSA KAAAGGSVTH EEL 368 Anopheles gambiae -----AN-F- ***---WAFP P*EKPGAKVK GG**GSSPQH EEL 399 Bombyx mori -----MK-L- ***-E-WSFP Q*RKKNKHEE L********* *** 385 Drosophila melanogaster -----V--F- ***-Y-W-FP K*EKD-KHTN V********H EEL 402 Drosophila pseudoobscura -----S--F- ***-Y-WSFP K*EKD-QQSK A********H EEL 402 Drosophila yakuba -----V--F- ***-Y-W-FP K*EKD-KHSN V********H EEL 402 Onchocerca volvulus Y-Q-KYTSNV ARP----AQN YFIENK--L* ********** *** 384 * * 159

Résultats-Discussion : Annexe I<br />

__________________________________________________________________________________________<br />

Intron 6<br />

↓<br />

Bos taurus YIATDSESYL PEIQQLFKG* **KVKVVSL* KPEVAQIDLY ILGQADHFIG NCVSSFTAFV 365<br />

Sus scrofa ---------- ---------* **-------* ---------- ---------- ---------- 365<br />

Rattus norvegicus ---------V S-------E* **-------* ---------- ---------- ---------- 369<br />

Mus musculus ---------V S-------D* **--R----* ---------- ---------- ---------- 367<br />

Canis familiaris ---------V ----E----* **-------* --D------- ---------- ---------- 365<br />

Homo sapiens -V-------V --L------* **-------* ------V--- ---------- ---------- 362<br />

Pan troglodytes -V-------V --L------* **-------* ------V--- ---------- ---------- 362<br />

Pongo pygmaeus -V-------V --L------* **-----N-* ------V--- ---------- ---------- 362<br />

Xenopus tropicalis ------T-HT E---AFLGD* **--R--C-* Q-----M--- ---------- ---------- 354<br />

Xenopus laevis ------P--T A---AFLGN* **E-R--C-* Q--------- --A------- ---------- 354<br />

Gallus gallus -------P-T K----F-Q-* **-I-----* Q--------- ----S----- ---------- 354<br />

Danio rerio --------HT T---K----* **-------* Q-DT--V--- ---------- ------S--- 367<br />

Oryzias latipes ------VAHR ED-EK--E-* **-------* H-DW--T--- ---------- ------S--- 367<br />

Takifugu rubripes --------HS GD-E---N-* **-------* R--L--M--- ---K------ ------S--- 356<br />

T<strong>et</strong>raodon nigroviridis ------K-HS GD-EK--R-* **-------* Q--S--T--- V-RK------ ---W--S--- 356<br />

Ciona intestinalis F----AS--E N-FNNM--EA GLD-SI-K-* ENDELMM--A L-IES-R--- S-G--V---- 357<br />

Ciona savignyi F----AK-FE E-FKTW--DA GLNIDIIK-* QKDELN---A V-IE--T--- S-G--VS--- 353<br />

Strongylocentrotus purpuratus F----KF--Q K-LKEM-GD* **E---HH-* D-HMP----I ----SEF--- -------S-- 386<br />

Caenorhabditis briggsae FV-S-KDHMI D--NEAL-PY E**IEAHRQ* EVDDMYTS-A -M-RS-L--- ----T-SHI- 356<br />

Caenorhabditis elegans FV-S-KDHMI D--NEAL-PY E**IEAHRQ* E-DDMYTS-A -M-R--L-V- ----T-SHI- 353<br />

Ae<strong>des</strong> aegypti FV-S-NNHMI HDLNEAL-RM D**IT--K-* PENNPHL--A ---MSN---- -----YS--- 329<br />

Anopheles gambiae FV-S--NHM- G-LNDAL-RM D**-T--RH* PDGNPHL--A ---R-N---- --I--YS--- 362<br />

Bombyx mori FV-S--NHMI E-LNAGLRRP E**I-ILKFQ PSSNPHL--A -----NY--- -----YS--- 358<br />

Drosophila melanogaster FV-S--NHMI G-LNTALSRM G**IS-HK-* PEDDPYL--A ----SN---- --I--YS--E 371<br />

Drosophila pseudoobscura FV-S-ANHMI G-LNAALSRM G**IS-HR-* PEDDPYL--A ----SN---- --I--YS--- 371<br />

Drosophila yakuba FV-S--NHMI G-LNTALSRM G**IS-HK-* PEDDPYL--A ----SN---- --I--YS--- 371<br />

Onchocerca volvulus FVSS-RNH-I D-LK-KLASL Q**IV-ERR* Y--NLH-N-A --SI------ ----TLS--I 355<br />

* * * * *<br />

Bos taurus KRERDLHGRP ***SSFFGMD RPPQLRDEF* ********** *** 391<br />

Sus scrofa ------Q--L ***------- ---------* ********** *** 391<br />

Rattus norvegicus ---------- ***------- --S------* ********** *** 395<br />

Mus musculus ---------Q ***------- --S------* ********** *** 393<br />

Canis familiaris ------Q--L ***------- K--------* ********** *** 391<br />

Homo sapiens ------Q--- ***------- ---K-----* ********** *** 388<br />

Pan troglodytes ------Q--- ***------- ---K-----* ********** *** 388<br />

Pongo pygmaeus ------Q--- ***------- ---K-----* ********** *** 388<br />

Xenopus tropicalis -----V---- ***------- S-GAVQ--L* ********** *** 380<br />

Xenopus laevis --D--V---- ***------- S-GVVQ--L* ********** *** 380<br />

Gallus gallus -----V--K- ***------- H--R-----* ********** *** 380<br />

Danio rerio ----NI---- ***-----L- Y-GKKNRNEE L********* *** 395<br />

Oryzias latipes -----V---S ***------- --RKANAKEE L********* *** 395<br />

Takifugu rubripes --Q--VQ-L- ***------- T-GN--VREE L********* *** 384<br />

T<strong>et</strong>raodon nigroviridis -----V--L- ***------- T-GRVNAREE L********* *** 384<br />

Ciona intestinalis S-K-EVL--- ***NEY--AS DKHNEA-RSE L********* *** 385<br />

Ciona savignyi S-K-KVLD-- ***NE---NL GNQNNA-HTE L********* *** 381<br />

Strongylocentrotus purpuratus -----GN-K- ***-T-WSIG V********* ********** *** 404<br />

Caenorhabditis briggsae -----HT-QS PRP-A---VR SARRHI-L** ********** *** 384<br />

Caenorhabditis elegans -----HA-QS PRP-A---IR AVKRHI-L** ********** *** 381<br />

Ae<strong>des</strong> aegypti -----AK-F- ***-T-WAFP A*EKHMSKSA KAAAGGSVTH EEL 368<br />

Anopheles gambiae -----AN-F- ***---WAFP P*EKPGAKVK GG**GSSPQH EEL 399<br />

Bombyx mori -----MK-L- ***-E-WSFP Q*RKKNKHEE L********* *** 385<br />

Drosophila melanogaster -----V--F- ***-Y-W-FP K*EKD-KHTN V********H EEL 402<br />

Drosophila pseudoobscura -----S--F- ***-Y-WSFP K*EKD-QQSK A********H EEL 402<br />

Drosophila yakuba -----V--F- ***-Y-W-FP K*EKD-KHSN V********H EEL 402<br />

Onchocerca volvulus Y-Q-KYTSNV ARP----AQN YFIENK--L* ********** *** 384<br />

* *<br />

159

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