caractérisation des enzymes bovines et étude préliminaire du rôle ...
caractérisation des enzymes bovines et étude préliminaire du rôle ... caractérisation des enzymes bovines et étude préliminaire du rôle ...
Résultats-Discussion : Annexe I __________________________________________________________________________________________ Intron1 ↓ Bos taurus ****S***** ********** ********** *******WDP AGYLLYCPCM GRFGNQADHF 54 Sus scrofa ***V-***** ********** ********** *******--- ---------- ---------- 54 Rattus norvegicus ****-***** ********** ********** *******--L ---------- ---------- 58 Mus musculus ****-***** ********** ********** *******--L ---------- ---------- 56 Canis familiaris ****-***** ********** ********** *******--- ---------- ---------- 54 Homo sapiens ****-***** ********** ********** *******--- ---------- ---------- 51 Pan troglodytes ****-***** ********** ********** *******--- ---------- ---------- 51 Pongo pygmaeus ****-***** ********** ********** *******--- ---------- ---------- 51 Xenopus tropicalis ********** ********** ********** *******--S S--I------ ---------- 43 Xenopus laevis ********** ********** ********** *******YNS N--IV----- ---------- 43 Gallus gallus ****-***** ********** ********** *******--T ---------- -------E-- 43 Danio rerio ATDVT***** ********** ********** *******--E N--I------ ------V--- 56 Oryzias latipes ****H***** ********** ********** *******--E N--V------ ---------- 56 Takifugu rubripes ****R***** ********** ********** *******--Q N--V------ ---------- 45 Tetraodon nigroviridis ****-***** ********** ********** *******--Q N--V------ ---------- 45 Ciona intestinalis ****E***** ********** ********** *******I-E N--IA----- ---------- 45 Ciona savignyi ****E***** ********** ********** *******Y-K N--VI----- ------V--- 45 Strongylocentrotus purpuratus *****NEGLV VTDEREDGVF SAGGAGLEVS QAAPKLE--- N--FTF---- -------E-Y 84 Caenorhabditis briggsae ****KNGT** ********** ********** ********-- N--IVF---- ------I-Q- 51 Caenorhabditis elegans *****NET** ********** ********** ********-- N--IVF---- ------V-Q- 48 Aedes aegypti ********** ********** ********** ********** ********** ---------- 10 Anopheles gambiae ****T***** ********** ********** *******V-E H--IM----- ---------- 42 Bombyx mori ****N***** ********** ********** *******PEK K--IA----- ---------- 43 Drosophila melanogaster ********** ********** ********** ********-- N---T----- ---------- 49 Drosophila pseudoobscura ********** ********** ********** ********-- N---T----- ---------- 49 Drosophila yakuba ********** ********** ********** ********-- N---T----- ---------- 49 Onchocerca volvulus ********** ********** ********** *********E T--VV----- ------ME-- 38 ** ***** ****** Intron 2 ↓ Bos taurus LGSLAFAKLL NRTLAVPPWI EYQHHKPPFT NV***HVSYQ KYFKLE*PLQ AYHRVISLED 110 Sus scrofa ---------- ---------- ---------- -L***----- ------*--- V--------- 110 Rattus norvegicus ---------- ---------- ---------- -L***----- ------*--- ---------- 114 Mus musculus ---------- ---------- ---------- -L***----- ------*--- -----V---- 112 Canis familiaris ---------- ---------- -----R---- -L***----- ------*--- ---------- 110 Homo sapiens ---------- ---------- ---------- -L***----- ------*--- ---------- 107 Pan troglodytes ---------- ---------- ---------- -L***----- ------*--- ---------- 107 Pongo pygmaeus ---------- ---------- ---------- -L***----- ------*--- ---------- 107 Xenopus tropicalis --------MV ----V----- V-N--R--Y- --***--P-E EF-Q--*--R QF-H---M-Q 99 Xenopus laevis --------MV ----V----- V-N--R--Y- --***--P-E EF-Q--*--R QF-Q---M-E 99 Gallus gallus --A----RA- ---------- --R--R--Y- -L***--P-E E-----*--- Q----L---Q 99 Danio rerio --------M- ---------- V-R--S---- --***--P-S E--Q--*--K Q----V---- 112 Oryzias latipes --------M- ---------- V-R--I--Y- --***--P-S EF-Q-D*V-S -----V---- 112 Takifugu rubripes --------M- ---------- V-R--V--Y- --***-IP-R DF-Q--*A-S -----V---- 101 Tetraodon nigroviridis --------M- ---------- V-R--A--YA --***--P-G EF-Q--*A-S -----V---- 101 Ciona intestinalis ----S---K- ----II---- VHGYRGYGD* DS***FIP-S RW-QVN*A-K P-----EMKE 100 Ciona savignyi ----S--RK- ----V----- THKYGRYDG* DS***FPP-N HW--VD*T-K S---I-EM-- 100 Strongylocentrotus purpuratus ------G-A- ---IIL--FR T-******** *I***NIPFT DW-QF-PM-E F-P-L-TM-T 132 Caenorhabditis briggsae --V-S---S- D---VL-NF- -FN**H-*E* TK***MIPFE VL-QVG*TVA K-T--VTMHE 103 Caenorhabditis elegans --V-----A- D---VL-NF- -FK**H-*E* TK***MIPFE FL-QVG*TVA K-T--VTMQE 100 Aedes aegypti --A-G--HG- ----VL---V --RKGAAN** S-***Q-PFD T--QVA*--T E-T---TM-N 64 Anopheles gambiae ---FG---A- ----VL---V --RKGEV*R* SI***Q-PFD T--QVG*--- -F----TM-N 96 Bombyx mori --V---S-AV ----IL---- --RYGE-*R* SI***Q-PFD T--NVD*K-L EFAN--TM-- 97 Drosophila melanogaster --------A- ----IL---V --RRGEL*R* SR***Q-PFN T--EV-*--K E-----TMA- 103 Drosophila pseudoobscura --------G- ----IL---V --RKGEM*R* SR***Q-PFN T--DV-*--K D-----LMS- 103 Drosophila yakuba --------A- ----IL---V --RRGEL*R* SR***Q-PFN T--EV-*--K E-----TMA- 103 Onchocerca volvulus --M-----S- ----VL--F- --***H-*E* KKQAIM-DFD T--LV-*--R NF-KM-VMR- 92 ** * ** * * 156
Résultats-Discussion : Annexe I __________________________________________________________________________________________ Intron 3 ↓ Bos taurus FMEKLAPTHW PPEKRVAYCF EVAA****** QRSPDKKTCP MKEGNPFGPF WDQFHVSFNK 164 Sus scrofa ---------- ---R------ ----****** ---------- ---------- ---------- 164 Rattus norvegicus -------F-- ---------- ----****** ---------- ---------- ---------- 168 Mus musculus ---N---S-- ---------- ----****** ---------- ---------- ---------- 166 Canis familiaris ---------- ---R------ ----****** ---------- ---------- ---------- 164 Homo sapiens ---------- ---------- ----****** ---------- ---------- ---------- 161 Pan troglodytes ---------- ---------- ----****** ---------- ---------- ---------- 161 Pongo pygmaeus ---------- ---------- ----****** ---------- ---------- ---------- 161 Xenopus tropicalis ---Q--SVL- --SR------ TA--****** -------S-- --D------- --H---N-IQ 153 Xenopus laevis ---Q---VL- --T--L---- TA--****** -------S-- --D------- --H---D-TQ 153 Gallus gallus ---Q---Q-- --GR------ -A--****** ---A--S--- --D------- ----K-D-D- 153 Danio rerio ---H---K-- -HGQ-I---- -S--****** H--Q---S-- --D------- --HIG-D-DR 166 Oryzias latipes ---------- --GQ-R---- -T--****** ---A---S-- --D------- --YVG-N-D- 166 Takifugu rubripes ---T---RY- -AGQ-R---- -T--****** --TA---S-- --D------- --YVN-D-DE 155 Tetraodon nigroviridis ---A------ -SGQ-R---- -A--****** ---E---S-- ---------- --HVN-D-DQ 155 Ciona intestinalis --LEI--SI- L----YI--H -STF****** K--E---S-- A-S------- --N-KID-PA 154 Ciona savignyi --TN---SI- --N--KI--H -I-F****** S--D---S-- A-S-----A- --N-K-E-IA 154 Strongylocentrotus purpuratus ---E---KY- -ENE-RG--W LYLNSDAQ** ********-E --R------- --G-GIN-AE 182 Caenorhabditis briggsae -TK-IMSK-F AGT******* *PRKAIYD** **TDAEPG-H A--------Y ---IG---VG 151 Caenorhabditis elegans -TK-IM---F VGT******* *PRQAIYD** **KSAEPG-H S--------Y ---ID---VG 148 Aedes aegypti --SN---SL- ---E-ISF-Y TERMG*LD** **GSTGGG-N A-S------- --T-KID-V- 119 Anopheles gambiae --KT---SL- --AE-ISF-Y TERMG*LD** **GSTGHG-N A-S------- --T-E-E-AG 151 Bombyx mori --REI---V- -I----SF-Y TQRTGEI*** *****QNS-N A-S------- --TYNID--R 149 Drosophila melanogaster --WH--DDI- -ESE--SF-Y KERYS*LQQE KND---PN-H A-D------- --T--ID-VR 162 Drosophila pseudoobscura --WH--DDI- -ESE--SF-Y MERKS*LQQE KNN--QPN-H A-D------- --TYNID-V- 162 Drosophila yakuba --WH--DDI- -ES---SF-Y KERYS*LQQE KND---PN-H A-D------- --T--ID-VR 162 Onchocerca volvulus -IKEI--NI- -LD--K-F-W QPRQSILD** **TRKSSG-H A-------SI LGL-KCN-YW 148 * * * ***** * Intron 4 ↓ Bos taurus SELFAG*IS* *FSASY**** *K****DQW* ******IQRF SPEEHPVLAL PGAPAQFPVL 205 Sus scrofa ------*--* *-----**** *-****---* ******---- --K------- ---------- 205 Rattus norvegicus ----T-*--* *-----**** *-****E--* ******---- P-K------- ---------- 209 Mus musculus ----T-*--* *-----**** *-****E--* ******T--- PAK------- ---------- 207 Canis familiaris -K--S-*--* *-----**** *-****---* ******---- --K------- ---------- 205 Homo sapiens ----T-*--* *-----**** *R****E--* ******S--- --K------- ---------- 202 Pan troglodytes ----T-*--* *-----**** *R****E--* ******S--- --K------- ---------- 202 Pongo pygmaeus ----T-*--* *-----**** *R****E--* ******S--- --K------- ---------- 202 Xenopus tropicalis ----D-*-T* *---Y-**** *-****-V-* ******NS-- P-SQ---I-- ---------- 194 Xenopus laevis ----D-*-T* *---Y-**** *-****-V-* ******-S-- P-SQ---I-- ---------- 194 Gallus gallus ----K-*--* *--SA-**** *R****-H-* ******---- P-S------- ---------- 194 Danio rerio -V--G-*L-* *--SY-**** *Q****PH-* ******-K-- P-K------- ---------- 207 Oryzias latipes -V--G-*L-* *--SYH**** *Q****L--* ******MKK- P-S------- ---------M 207 Takifugu rubripes -V--G-*-Y* *---Y-**** *Q****P--* ******MKK- P-SQ----V- ---------S 196 Tetraodon nigroviridis -V--G-*-Y* *--S--**** *Q****P--* ******MKK- P-SQ------ -----L---Q 196 Ciona intestinalis --G-PTHLH* *-HS****S* *-****KE-* ******DSVY PATI-----F M----SY--N 195 Ciona savignyi --G-P-NLN* *YHS****S* *-****TS-* ******DHAY PS-T-L---F M----AY--K 195 Strongylocentrotus purpuratus EIK-EIFSHA DL-NTQDMEK I-****EH-* ******DRS- PVKD------ K----P--MR 231 Caenorhabditis briggsae D-Y-GE*-PG G-ET-QMGS* *R****KK-* ******LEK- G---F----F -S---A--SK 197 Caenorhabditis elegans D-Y-GD*-PG G-DLNQM*** ***GSRKK-* ******LEK- PS--Y----F SS---P--SK 194 Aedes aegypti --F-GPKLN* *YDVYH**** *HD*MANK-* ******AE-Y PSDKW--I-F T----S--IQ 164 Anopheles gambiae --F-GPKLN* *YDIHH**** *GDSMARR-* ******SE-Y PAAKW----F T----A---Q 197 Bombyx mori --FY-P*LN* *YD-QN**** *EK*ILE--* ******KI-Y PVDKW----F T----S---Q 193 Drosophila melanogaster --FY-P*LH* *-DVHHS*** ***NEAAK-* ******QTKY PA-SY----F T----S---Q 206 Drosophila pseudoobscura --FYGP*LH* *-DVHHS*** ***SMATK-* ******QSKY PADSW----F T----S---Q 206 Drosophila yakuba --FY-P*LH* *-DVHHS*** ***NEAAK-* ******QAKY PA-SY----F T----S---Q 206 Onchocerca volvulus RW-LRF*RI* *-LKHI**** *L****LA-Q ACQKNGMRN- QLI-IQF--V HFP--A-SR- 196 * ** 157
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Résultats-Discussion : Annexe I<br />
__________________________________________________________________________________________<br />
Intron 3<br />
↓<br />
Bos taurus FMEKLAPTHW PPEKRVAYCF EVAA****** QRSPDKKTCP MKEGNPFGPF WDQFHVSFNK 164<br />
Sus scrofa ---------- ---R------ ----****** ---------- ---------- ---------- 164<br />
Rattus norvegicus -------F-- ---------- ----****** ---------- ---------- ---------- 168<br />
Mus musculus ---N---S-- ---------- ----****** ---------- ---------- ---------- 166<br />
Canis familiaris ---------- ---R------ ----****** ---------- ---------- ---------- 164<br />
Homo sapiens ---------- ---------- ----****** ---------- ---------- ---------- 161<br />
Pan troglodytes ---------- ---------- ----****** ---------- ---------- ---------- 161<br />
Pongo pygmaeus ---------- ---------- ----****** ---------- ---------- ---------- 161<br />
Xenopus tropicalis ---Q--SVL- --SR------ TA--****** -------S-- --D------- --H---N-IQ 153<br />
Xenopus laevis ---Q---VL- --T--L---- TA--****** -------S-- --D------- --H---D-TQ 153<br />
Gallus gallus ---Q---Q-- --GR------ -A--****** ---A--S--- --D------- ----K-D-D- 153<br />
Danio rerio ---H---K-- -HGQ-I---- -S--****** H--Q---S-- --D------- --HIG-D-DR 166<br />
Oryzias latipes ---------- --GQ-R---- -T--****** ---A---S-- --D------- --YVG-N-D- 166<br />
Takifugu rubripes ---T---RY- -AGQ-R---- -T--****** --TA---S-- --D------- --YVN-D-DE 155<br />
T<strong>et</strong>raodon nigroviridis ---A------ -SGQ-R---- -A--****** ---E---S-- ---------- --HVN-D-DQ 155<br />
Ciona intestinalis --LEI--SI- L----YI--H -STF****** K--E---S-- A-S------- --N-KID-PA 154<br />
Ciona savignyi --TN---SI- --N--KI--H -I-F****** S--D---S-- A-S-----A- --N-K-E-IA 154<br />
Strongylocentrotus purpuratus ---E---KY- -ENE-RG--W LYLNSDAQ** ********-E --R------- --G-GIN-AE 182<br />
Caenorhabditis briggsae -TK-IMSK-F AGT******* *PRKAIYD** **TDAEPG-H A--------Y ---IG---VG 151<br />
Caenorhabditis elegans -TK-IM---F VGT******* *PRQAIYD** **KSAEPG-H S--------Y ---ID---VG 148<br />
Ae<strong>des</strong> aegypti --SN---SL- ---E-ISF-Y TERMG*LD** **GSTGGG-N A-S------- --T-KID-V- 119<br />
Anopheles gambiae --KT---SL- --AE-ISF-Y TERMG*LD** **GSTGHG-N A-S------- --T-E-E-AG 151<br />
Bombyx mori --REI---V- -I----SF-Y TQRTGEI*** *****QNS-N A-S------- --TYNID--R 149<br />
Drosophila melanogaster --WH--DDI- -ESE--SF-Y KERYS*LQQE KND---PN-H A-D------- --T--ID-VR 162<br />
Drosophila pseudoobscura --WH--DDI- -ESE--SF-Y MERKS*LQQE KNN--QPN-H A-D------- --TYNID-V- 162<br />
Drosophila yakuba --WH--DDI- -ES---SF-Y KERYS*LQQE KND---PN-H A-D------- --T--ID-VR 162<br />
Onchocerca volvulus -IKEI--NI- -LD--K-F-W QPRQSILD** **TRKSSG-H A-------SI LGL-KCN-YW 148<br />
* * * ***** *<br />
Intron 4<br />
↓<br />
Bos taurus SELFAG*IS* *FSASY**** *K****DQW* ******IQRF SPEEHPVLAL PGAPAQFPVL 205<br />
Sus scrofa ------*--* *-----**** *-****---* ******---- --K------- ---------- 205<br />
Rattus norvegicus ----T-*--* *-----**** *-****E--* ******---- P-K------- ---------- 209<br />
Mus musculus ----T-*--* *-----**** *-****E--* ******T--- PAK------- ---------- 207<br />
Canis familiaris -K--S-*--* *-----**** *-****---* ******---- --K------- ---------- 205<br />
Homo sapiens ----T-*--* *-----**** *R****E--* ******S--- --K------- ---------- 202<br />
Pan troglodytes ----T-*--* *-----**** *R****E--* ******S--- --K------- ---------- 202<br />
Pongo pygmaeus ----T-*--* *-----**** *R****E--* ******S--- --K------- ---------- 202<br />
Xenopus tropicalis ----D-*-T* *---Y-**** *-****-V-* ******NS-- P-SQ---I-- ---------- 194<br />
Xenopus laevis ----D-*-T* *---Y-**** *-****-V-* ******-S-- P-SQ---I-- ---------- 194<br />
Gallus gallus ----K-*--* *--SA-**** *R****-H-* ******---- P-S------- ---------- 194<br />
Danio rerio -V--G-*L-* *--SY-**** *Q****PH-* ******-K-- P-K------- ---------- 207<br />
Oryzias latipes -V--G-*L-* *--SYH**** *Q****L--* ******MKK- P-S------- ---------M 207<br />
Takifugu rubripes -V--G-*-Y* *---Y-**** *Q****P--* ******MKK- P-SQ----V- ---------S 196<br />
T<strong>et</strong>raodon nigroviridis -V--G-*-Y* *--S--**** *Q****P--* ******MKK- P-SQ------ -----L---Q 196<br />
Ciona intestinalis --G-PTHLH* *-HS****S* *-****KE-* ******DSVY PATI-----F M----SY--N 195<br />
Ciona savignyi --G-P-NLN* *YHS****S* *-****TS-* ******DHAY PS-T-L---F M----AY--K 195<br />
Strongylocentrotus purpuratus EIK-EIFSHA DL-NTQDMEK I-****EH-* ******DRS- PVKD------ K----P--MR 231<br />
Caenorhabditis briggsae D-Y-GE*-PG G-ET-QMGS* *R****KK-* ******LEK- G---F----F -S---A--SK 197<br />
Caenorhabditis elegans D-Y-GD*-PG G-DLNQM*** ***GSRKK-* ******LEK- PS--Y----F SS---P--SK 194<br />
Ae<strong>des</strong> aegypti --F-GPKLN* *YDVYH**** *HD*MANK-* ******AE-Y PSDKW--I-F T----S--IQ 164<br />
Anopheles gambiae --F-GPKLN* *YDIHH**** *GDSMARR-* ******SE-Y PAAKW----F T----A---Q 197<br />
Bombyx mori --FY-P*LN* *YD-QN**** *EK*ILE--* ******KI-Y PVDKW----F T----S---Q 193<br />
Drosophila melanogaster --FY-P*LH* *-DVHHS*** ***NEAAK-* ******QTKY PA-SY----F T----S---Q 206<br />
Drosophila pseudoobscura --FYGP*LH* *-DVHHS*** ***SMATK-* ******QSKY PADSW----F T----S---Q 206<br />
Drosophila yakuba --FY-P*LH* *-DVHHS*** ***NEAAK-* ******QAKY PA-SY----F T----S---Q 206<br />
Onchocerca volvulus RW-LRF*RI* *-LKHI**** *L****LA-Q ACQKNGMRN- QLI-IQF--V HFP--A-SR- 196<br />
* **<br />
157