caractérisation des enzymes bovines et étude préliminaire du rôle ...

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Résultats-Discussion : Annexe I __________________________________________________________________________________________ Intron1 ↓ Bos taurus ****S***** ********** ********** *******WDP AGYLLYCPCM GRFGNQADHF 54 Sus scrofa ***V-***** ********** ********** *******--- ---------- ---------- 54 Rattus norvegicus ****-***** ********** ********** *******--L ---------- ---------- 58 Mus musculus ****-***** ********** ********** *******--L ---------- ---------- 56 Canis familiaris ****-***** ********** ********** *******--- ---------- ---------- 54 Homo sapiens ****-***** ********** ********** *******--- ---------- ---------- 51 Pan troglodytes ****-***** ********** ********** *******--- ---------- ---------- 51 Pongo pygmaeus ****-***** ********** ********** *******--- ---------- ---------- 51 Xenopus tropicalis ********** ********** ********** *******--S S--I------ ---------- 43 Xenopus laevis ********** ********** ********** *******YNS N--IV----- ---------- 43 Gallus gallus ****-***** ********** ********** *******--T ---------- -------E-- 43 Danio rerio ATDVT***** ********** ********** *******--E N--I------ ------V--- 56 Oryzias latipes ****H***** ********** ********** *******--E N--V------ ---------- 56 Takifugu rubripes ****R***** ********** ********** *******--Q N--V------ ---------- 45 Tetraodon nigroviridis ****-***** ********** ********** *******--Q N--V------ ---------- 45 Ciona intestinalis ****E***** ********** ********** *******I-E N--IA----- ---------- 45 Ciona savignyi ****E***** ********** ********** *******Y-K N--VI----- ------V--- 45 Strongylocentrotus purpuratus *****NEGLV VTDEREDGVF SAGGAGLEVS QAAPKLE--- N--FTF---- -------E-Y 84 Caenorhabditis briggsae ****KNGT** ********** ********** ********-- N--IVF---- ------I-Q- 51 Caenorhabditis elegans *****NET** ********** ********** ********-- N--IVF---- ------V-Q- 48 Aedes aegypti ********** ********** ********** ********** ********** ---------- 10 Anopheles gambiae ****T***** ********** ********** *******V-E H--IM----- ---------- 42 Bombyx mori ****N***** ********** ********** *******PEK K--IA----- ---------- 43 Drosophila melanogaster ********** ********** ********** ********-- N---T----- ---------- 49 Drosophila pseudoobscura ********** ********** ********** ********-- N---T----- ---------- 49 Drosophila yakuba ********** ********** ********** ********-- N---T----- ---------- 49 Onchocerca volvulus ********** ********** ********** *********E T--VV----- ------ME-- 38 ** ***** ****** Intron 2 ↓ Bos taurus LGSLAFAKLL NRTLAVPPWI EYQHHKPPFT NV***HVSYQ KYFKLE*PLQ AYHRVISLED 110 Sus scrofa ---------- ---------- ---------- -L***----- ------*--- V--------- 110 Rattus norvegicus ---------- ---------- ---------- -L***----- ------*--- ---------- 114 Mus musculus ---------- ---------- ---------- -L***----- ------*--- -----V---- 112 Canis familiaris ---------- ---------- -----R---- -L***----- ------*--- ---------- 110 Homo sapiens ---------- ---------- ---------- -L***----- ------*--- ---------- 107 Pan troglodytes ---------- ---------- ---------- -L***----- ------*--- ---------- 107 Pongo pygmaeus ---------- ---------- ---------- -L***----- ------*--- ---------- 107 Xenopus tropicalis --------MV ----V----- V-N--R--Y- --***--P-E EF-Q--*--R QF-H---M-Q 99 Xenopus laevis --------MV ----V----- V-N--R--Y- --***--P-E EF-Q--*--R QF-Q---M-E 99 Gallus gallus --A----RA- ---------- --R--R--Y- -L***--P-E E-----*--- Q----L---Q 99 Danio rerio --------M- ---------- V-R--S---- --***--P-S E--Q--*--K Q----V---- 112 Oryzias latipes --------M- ---------- V-R--I--Y- --***--P-S EF-Q-D*V-S -----V---- 112 Takifugu rubripes --------M- ---------- V-R--V--Y- --***-IP-R DF-Q--*A-S -----V---- 101 Tetraodon nigroviridis --------M- ---------- V-R--A--YA --***--P-G EF-Q--*A-S -----V---- 101 Ciona intestinalis ----S---K- ----II---- VHGYRGYGD* DS***FIP-S RW-QVN*A-K P-----EMKE 100 Ciona savignyi ----S--RK- ----V----- THKYGRYDG* DS***FPP-N HW--VD*T-K S---I-EM-- 100 Strongylocentrotus purpuratus ------G-A- ---IIL--FR T-******** *I***NIPFT DW-QF-PM-E F-P-L-TM-T 132 Caenorhabditis briggsae --V-S---S- D---VL-NF- -FN**H-*E* TK***MIPFE VL-QVG*TVA K-T--VTMHE 103 Caenorhabditis elegans --V-----A- D---VL-NF- -FK**H-*E* TK***MIPFE FL-QVG*TVA K-T--VTMQE 100 Aedes aegypti --A-G--HG- ----VL---V --RKGAAN** S-***Q-PFD T--QVA*--T E-T---TM-N 64 Anopheles gambiae ---FG---A- ----VL---V --RKGEV*R* SI***Q-PFD T--QVG*--- -F----TM-N 96 Bombyx mori --V---S-AV ----IL---- --RYGE-*R* SI***Q-PFD T--NVD*K-L EFAN--TM-- 97 Drosophila melanogaster --------A- ----IL---V --RRGEL*R* SR***Q-PFN T--EV-*--K E-----TMA- 103 Drosophila pseudoobscura --------G- ----IL---V --RKGEM*R* SR***Q-PFN T--DV-*--K D-----LMS- 103 Drosophila yakuba --------A- ----IL---V --RRGEL*R* SR***Q-PFN T--EV-*--K E-----TMA- 103 Onchocerca volvulus --M-----S- ----VL--F- --***H-*E* KKQAIM-DFD T--LV-*--R NF-KM-VMR- 92 ** * ** * * 156

Résultats-Discussion : Annexe I __________________________________________________________________________________________ Intron 3 ↓ Bos taurus FMEKLAPTHW PPEKRVAYCF EVAA****** QRSPDKKTCP MKEGNPFGPF WDQFHVSFNK 164 Sus scrofa ---------- ---R------ ----****** ---------- ---------- ---------- 164 Rattus norvegicus -------F-- ---------- ----****** ---------- ---------- ---------- 168 Mus musculus ---N---S-- ---------- ----****** ---------- ---------- ---------- 166 Canis familiaris ---------- ---R------ ----****** ---------- ---------- ---------- 164 Homo sapiens ---------- ---------- ----****** ---------- ---------- ---------- 161 Pan troglodytes ---------- ---------- ----****** ---------- ---------- ---------- 161 Pongo pygmaeus ---------- ---------- ----****** ---------- ---------- ---------- 161 Xenopus tropicalis ---Q--SVL- --SR------ TA--****** -------S-- --D------- --H---N-IQ 153 Xenopus laevis ---Q---VL- --T--L---- TA--****** -------S-- --D------- --H---D-TQ 153 Gallus gallus ---Q---Q-- --GR------ -A--****** ---A--S--- --D------- ----K-D-D- 153 Danio rerio ---H---K-- -HGQ-I---- -S--****** H--Q---S-- --D------- --HIG-D-DR 166 Oryzias latipes ---------- --GQ-R---- -T--****** ---A---S-- --D------- --YVG-N-D- 166 Takifugu rubripes ---T---RY- -AGQ-R---- -T--****** --TA---S-- --D------- --YVN-D-DE 155 Tetraodon nigroviridis ---A------ -SGQ-R---- -A--****** ---E---S-- ---------- --HVN-D-DQ 155 Ciona intestinalis --LEI--SI- L----YI--H -STF****** K--E---S-- A-S------- --N-KID-PA 154 Ciona savignyi --TN---SI- --N--KI--H -I-F****** S--D---S-- A-S-----A- --N-K-E-IA 154 Strongylocentrotus purpuratus ---E---KY- -ENE-RG--W LYLNSDAQ** ********-E --R------- --G-GIN-AE 182 Caenorhabditis briggsae -TK-IMSK-F AGT******* *PRKAIYD** **TDAEPG-H A--------Y ---IG---VG 151 Caenorhabditis elegans -TK-IM---F VGT******* *PRQAIYD** **KSAEPG-H S--------Y ---ID---VG 148 Aedes aegypti --SN---SL- ---E-ISF-Y TERMG*LD** **GSTGGG-N A-S------- --T-KID-V- 119 Anopheles gambiae --KT---SL- --AE-ISF-Y TERMG*LD** **GSTGHG-N A-S------- --T-E-E-AG 151 Bombyx mori --REI---V- -I----SF-Y TQRTGEI*** *****QNS-N A-S------- --TYNID--R 149 Drosophila melanogaster --WH--DDI- -ESE--SF-Y KERYS*LQQE KND---PN-H A-D------- --T--ID-VR 162 Drosophila pseudoobscura --WH--DDI- -ESE--SF-Y MERKS*LQQE KNN--QPN-H A-D------- --TYNID-V- 162 Drosophila yakuba --WH--DDI- -ES---SF-Y KERYS*LQQE KND---PN-H A-D------- --T--ID-VR 162 Onchocerca volvulus -IKEI--NI- -LD--K-F-W QPRQSILD** **TRKSSG-H A-------SI LGL-KCN-YW 148 * * * ***** * Intron 4 ↓ Bos taurus SELFAG*IS* *FSASY**** *K****DQW* ******IQRF SPEEHPVLAL PGAPAQFPVL 205 Sus scrofa ------*--* *-----**** *-****---* ******---- --K------- ---------- 205 Rattus norvegicus ----T-*--* *-----**** *-****E--* ******---- P-K------- ---------- 209 Mus musculus ----T-*--* *-----**** *-****E--* ******T--- PAK------- ---------- 207 Canis familiaris -K--S-*--* *-----**** *-****---* ******---- --K------- ---------- 205 Homo sapiens ----T-*--* *-----**** *R****E--* ******S--- --K------- ---------- 202 Pan troglodytes ----T-*--* *-----**** *R****E--* ******S--- --K------- ---------- 202 Pongo pygmaeus ----T-*--* *-----**** *R****E--* ******S--- --K------- ---------- 202 Xenopus tropicalis ----D-*-T* *---Y-**** *-****-V-* ******NS-- P-SQ---I-- ---------- 194 Xenopus laevis ----D-*-T* *---Y-**** *-****-V-* ******-S-- P-SQ---I-- ---------- 194 Gallus gallus ----K-*--* *--SA-**** *R****-H-* ******---- P-S------- ---------- 194 Danio rerio -V--G-*L-* *--SY-**** *Q****PH-* ******-K-- P-K------- ---------- 207 Oryzias latipes -V--G-*L-* *--SYH**** *Q****L--* ******MKK- P-S------- ---------M 207 Takifugu rubripes -V--G-*-Y* *---Y-**** *Q****P--* ******MKK- P-SQ----V- ---------S 196 Tetraodon nigroviridis -V--G-*-Y* *--S--**** *Q****P--* ******MKK- P-SQ------ -----L---Q 196 Ciona intestinalis --G-PTHLH* *-HS****S* *-****KE-* ******DSVY PATI-----F M----SY--N 195 Ciona savignyi --G-P-NLN* *YHS****S* *-****TS-* ******DHAY PS-T-L---F M----AY--K 195 Strongylocentrotus purpuratus EIK-EIFSHA DL-NTQDMEK I-****EH-* ******DRS- PVKD------ K----P--MR 231 Caenorhabditis briggsae D-Y-GE*-PG G-ET-QMGS* *R****KK-* ******LEK- G---F----F -S---A--SK 197 Caenorhabditis elegans D-Y-GD*-PG G-DLNQM*** ***GSRKK-* ******LEK- PS--Y----F SS---P--SK 194 Aedes aegypti --F-GPKLN* *YDVYH**** *HD*MANK-* ******AE-Y PSDKW--I-F T----S--IQ 164 Anopheles gambiae --F-GPKLN* *YDIHH**** *GDSMARR-* ******SE-Y PAAKW----F T----A---Q 197 Bombyx mori --FY-P*LN* *YD-QN**** *EK*ILE--* ******KI-Y PVDKW----F T----S---Q 193 Drosophila melanogaster --FY-P*LH* *-DVHHS*** ***NEAAK-* ******QTKY PA-SY----F T----S---Q 206 Drosophila pseudoobscura --FYGP*LH* *-DVHHS*** ***SMATK-* ******QSKY PADSW----F T----S---Q 206 Drosophila yakuba --FY-P*LH* *-DVHHS*** ***NEAAK-* ******QAKY PA-SY----F T----S---Q 206 Onchocerca volvulus RW-LRF*RI* *-LKHI**** *L****LA-Q ACQKNGMRN- QLI-IQF--V HFP--A-SR- 196 * ** 157

Résultats-Discussion : Annexe I<br />

__________________________________________________________________________________________<br />

Intron 3<br />

↓<br />

Bos taurus FMEKLAPTHW PPEKRVAYCF EVAA****** QRSPDKKTCP MKEGNPFGPF WDQFHVSFNK 164<br />

Sus scrofa ---------- ---R------ ----****** ---------- ---------- ---------- 164<br />

Rattus norvegicus -------F-- ---------- ----****** ---------- ---------- ---------- 168<br />

Mus musculus ---N---S-- ---------- ----****** ---------- ---------- ---------- 166<br />

Canis familiaris ---------- ---R------ ----****** ---------- ---------- ---------- 164<br />

Homo sapiens ---------- ---------- ----****** ---------- ---------- ---------- 161<br />

Pan troglodytes ---------- ---------- ----****** ---------- ---------- ---------- 161<br />

Pongo pygmaeus ---------- ---------- ----****** ---------- ---------- ---------- 161<br />

Xenopus tropicalis ---Q--SVL- --SR------ TA--****** -------S-- --D------- --H---N-IQ 153<br />

Xenopus laevis ---Q---VL- --T--L---- TA--****** -------S-- --D------- --H---D-TQ 153<br />

Gallus gallus ---Q---Q-- --GR------ -A--****** ---A--S--- --D------- ----K-D-D- 153<br />

Danio rerio ---H---K-- -HGQ-I---- -S--****** H--Q---S-- --D------- --HIG-D-DR 166<br />

Oryzias latipes ---------- --GQ-R---- -T--****** ---A---S-- --D------- --YVG-N-D- 166<br />

Takifugu rubripes ---T---RY- -AGQ-R---- -T--****** --TA---S-- --D------- --YVN-D-DE 155<br />

T<strong>et</strong>raodon nigroviridis ---A------ -SGQ-R---- -A--****** ---E---S-- ---------- --HVN-D-DQ 155<br />

Ciona intestinalis --LEI--SI- L----YI--H -STF****** K--E---S-- A-S------- --N-KID-PA 154<br />

Ciona savignyi --TN---SI- --N--KI--H -I-F****** S--D---S-- A-S-----A- --N-K-E-IA 154<br />

Strongylocentrotus purpuratus ---E---KY- -ENE-RG--W LYLNSDAQ** ********-E --R------- --G-GIN-AE 182<br />

Caenorhabditis briggsae -TK-IMSK-F AGT******* *PRKAIYD** **TDAEPG-H A--------Y ---IG---VG 151<br />

Caenorhabditis elegans -TK-IM---F VGT******* *PRQAIYD** **KSAEPG-H S--------Y ---ID---VG 148<br />

Ae<strong>des</strong> aegypti --SN---SL- ---E-ISF-Y TERMG*LD** **GSTGGG-N A-S------- --T-KID-V- 119<br />

Anopheles gambiae --KT---SL- --AE-ISF-Y TERMG*LD** **GSTGHG-N A-S------- --T-E-E-AG 151<br />

Bombyx mori --REI---V- -I----SF-Y TQRTGEI*** *****QNS-N A-S------- --TYNID--R 149<br />

Drosophila melanogaster --WH--DDI- -ESE--SF-Y KERYS*LQQE KND---PN-H A-D------- --T--ID-VR 162<br />

Drosophila pseudoobscura --WH--DDI- -ESE--SF-Y MERKS*LQQE KNN--QPN-H A-D------- --TYNID-V- 162<br />

Drosophila yakuba --WH--DDI- -ES---SF-Y KERYS*LQQE KND---PN-H A-D------- --T--ID-VR 162<br />

Onchocerca volvulus -IKEI--NI- -LD--K-F-W QPRQSILD** **TRKSSG-H A-------SI LGL-KCN-YW 148<br />

* * * ***** *<br />

Intron 4<br />

↓<br />

Bos taurus SELFAG*IS* *FSASY**** *K****DQW* ******IQRF SPEEHPVLAL PGAPAQFPVL 205<br />

Sus scrofa ------*--* *-----**** *-****---* ******---- --K------- ---------- 205<br />

Rattus norvegicus ----T-*--* *-----**** *-****E--* ******---- P-K------- ---------- 209<br />

Mus musculus ----T-*--* *-----**** *-****E--* ******T--- PAK------- ---------- 207<br />

Canis familiaris -K--S-*--* *-----**** *-****---* ******---- --K------- ---------- 205<br />

Homo sapiens ----T-*--* *-----**** *R****E--* ******S--- --K------- ---------- 202<br />

Pan troglodytes ----T-*--* *-----**** *R****E--* ******S--- --K------- ---------- 202<br />

Pongo pygmaeus ----T-*--* *-----**** *R****E--* ******S--- --K------- ---------- 202<br />

Xenopus tropicalis ----D-*-T* *---Y-**** *-****-V-* ******NS-- P-SQ---I-- ---------- 194<br />

Xenopus laevis ----D-*-T* *---Y-**** *-****-V-* ******-S-- P-SQ---I-- ---------- 194<br />

Gallus gallus ----K-*--* *--SA-**** *R****-H-* ******---- P-S------- ---------- 194<br />

Danio rerio -V--G-*L-* *--SY-**** *Q****PH-* ******-K-- P-K------- ---------- 207<br />

Oryzias latipes -V--G-*L-* *--SYH**** *Q****L--* ******MKK- P-S------- ---------M 207<br />

Takifugu rubripes -V--G-*-Y* *---Y-**** *Q****P--* ******MKK- P-SQ----V- ---------S 196<br />

T<strong>et</strong>raodon nigroviridis -V--G-*-Y* *--S--**** *Q****P--* ******MKK- P-SQ------ -----L---Q 196<br />

Ciona intestinalis --G-PTHLH* *-HS****S* *-****KE-* ******DSVY PATI-----F M----SY--N 195<br />

Ciona savignyi --G-P-NLN* *YHS****S* *-****TS-* ******DHAY PS-T-L---F M----AY--K 195<br />

Strongylocentrotus purpuratus EIK-EIFSHA DL-NTQDMEK I-****EH-* ******DRS- PVKD------ K----P--MR 231<br />

Caenorhabditis briggsae D-Y-GE*-PG G-ET-QMGS* *R****KK-* ******LEK- G---F----F -S---A--SK 197<br />

Caenorhabditis elegans D-Y-GD*-PG G-DLNQM*** ***GSRKK-* ******LEK- PS--Y----F SS---P--SK 194<br />

Ae<strong>des</strong> aegypti --F-GPKLN* *YDVYH**** *HD*MANK-* ******AE-Y PSDKW--I-F T----S--IQ 164<br />

Anopheles gambiae --F-GPKLN* *YDIHH**** *GDSMARR-* ******SE-Y PAAKW----F T----A---Q 197<br />

Bombyx mori --FY-P*LN* *YD-QN**** *EK*ILE--* ******KI-Y PVDKW----F T----S---Q 193<br />

Drosophila melanogaster --FY-P*LH* *-DVHHS*** ***NEAAK-* ******QTKY PA-SY----F T----S---Q 206<br />

Drosophila pseudoobscura --FYGP*LH* *-DVHHS*** ***SMATK-* ******QSKY PADSW----F T----S---Q 206<br />

Drosophila yakuba --FY-P*LH* *-DVHHS*** ***NEAAK-* ******QAKY PA-SY----F T----S---Q 206<br />

Onchocerca volvulus RW-LRF*RI* *-LKHI**** *L****LA-Q ACQKNGMRN- QLI-IQF--V HFP--A-SR- 196<br />

* **<br />

157

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