caractérisation des enzymes bovines et étude préliminaire du rôle ...

Résultats-Discussion : Résultats complémentaires de la publication 1
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pour les nématodes Caenorhabditis sp. et Strongyloides ratti, pour l’Insecte Homalodisca
coagulata et pour le cnidaire Acropora millepora (pour ces trois dernières espèces, les
séquences de Pofut1 sont partielles). La portion d’alignement des séquences de Pofut1 chez
les Animaux où sont situés les sites de N-glycosylation conservés chez les Mammifères, est
présentée dans la publication 2. En ce qui concerne Pofut2, les deux premiers sites potentiels
de N-glycosylation sont retrouvés à des positions conservées chez les Ostéichthyens. Le site 2
est aussi présent chez les Urochordés (Ciona) et chez Caenorhabditis sp.. Le site 3 semble
moins conservé puisque à l’heure actuelle, il n’est présent que chez les Mammifères, les
Téléostéens et l’Insecte, Anopheles gambiae.
Grâce au logiciel smart (http://smart.embl-heidelberg.de/), nous avons identifié les
peptides signaux potentiels des protéines Pofut1 et Pofut2 de toutes les espèces choisies (Voir
annexes I et II). Le fait que ces peptides soient présents à l’extrémité N-terminale de
pratiquemment toutes les séquences analysées (sauf pour Pofut1 et Pofut2 du poisson zèbre
Danio rerio) ainsi que la démonstration faite de la localisation des enzymes Pofut1 et Pofut2
humaines (Luo et Haltiwanger, 2005; Luo, Nita-Lazar et al., 2006), suggèrent une localisation
réticulaire des O-fucosyltransférases chez toutes les espèces. Ceci est appuyé par les résultats
obtenus par le logiciel Predotar (http://urgi.infobiogen.fr/predotar/french.html) qui prédit une
localisation réticulaire pour l’ensemble des protéines étudiées ici.
L’analyse et la comparaison de toutes ces séquences nous ont amené à établir les
organisations génomiques de Pofut1 et Pofut2 dans la majorité des espèces étudiées. Certaines
de ces organisations sont déjà présentées dans la figure 7 de la publication 1. Les figures 49 et
50 incluent, en plus des organisations génomiques présentées dans l’article, celles des gènes
Pofut1 et Pofut2 d’autres organismes pour lesquels nous possédons des informations sur les
CDS et sur les séquences génomiques. Ces représentations tiennent compte uniquement des
exons codant la forme potentiellement active des enzymes; seuls les CDS sont indiqués.
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