caractérisation des enzymes bovines et étude préliminaire du rôle ...
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Résultats-Discussion : Résultats complémentaires de la publication 1 __________________________________________________________________________________________ 1.2.2 Production d’anticorps anti-Pofut bovins Avant de déterminer les activités des O-fucosyltransférases bovines codées par les différents variants, et dans le but d’étudier l’expression de celles-ci dans différents tissus bovins ou autres, nous avons produit des anticorps spécifiquement dirigés contre ces enzymes. Les séquences codantes des transcrits Pofut1a et Pofut2b (uniques variants dont nous disposions à l’époque) ont été clonées de manière orientée dans le vecteur d’expression bactérien pET28c, grâce aux sites de restriction NdeI et XhoI. Le clonage des séquences bovines a nécessité, au préalable, leur amplification avec des couples d’amorces apportant les sites de restriction enzymatique et permettant de conserver le cadre de lecture avec le vecteur pET28c qui apporte le codon d’initiation de la traduction. Les couples d’amorces utilisés sont répertoriés dans le tableau 3. Tableau 3 : Couples d’amorces utilisés pour les clonages en vecteur d’expression procaryote pET28c.Les sites de restrictions sont soulignés. Amorces Séquences Pofut1-NdeI/5’ 5’-CATATGGGCGCCGCCGCG-3’ Pofut1-XhoI/3’ 5’-CTCGAGGAATTCATCCCGCAGCTG-3’ Pofut2-NdeI/5’ 5’-CATATGGCGGCGCTTGCCGTCGTC-3’ Pofut2-XhoI/3’ 5’-CTCGAGGTATGCAATCCTCCAATG-3’ Les amplifiats ainsi obtenus sont d’abord clonés dans le plasmide TOPO2.1. Puis, les séquences d’intérêt sont isolées grâce à la double digestion du plasmide par les enzymes de restriction NdeI et XhoI. Elles sont ensuite introduites aux mêmes sites dans le vecteur pET28c, préalablement digéré. Ce vecteur porte le promoteur du bactériophage T7 et l’opérateur lacUV5 pour le contrôle de l’expression du gène d’intérêt. Les constructions, pET28c-Pofut1a et pET28c-Pofut2b, sont transformées dans la souche Escherichia coli BL21(DE3) qui porte dans son génome le gène codant l’ARN polymérase T7 (lysogène λDE3) sous la dépendance du promoteur lacUV5, inductible par un galactoside. En présence de l’inducteur, un βgalactoside, le gène de l’ARN polymérase présent sur le chromosome bactérien s’exprime. L’absence de répression permet à cette polymérase d’initier la transcription du gène d’intérêt. 134
Résultats-Discussion : Résultats complémentaires de la publication 1 __________________________________________________________________________________________ L’expression de chaque protéine est induite pendant 4 heures à 37°C par l’addition d’IPTG à une concentration de 1mM. L’analyse, par électrophorèse en gel d’acrylamide à 10,5% en conditions dénaturantes, des fractions protéiques totales avant (Fig.41., pistes 1) et après induction (Fig.41., Pistes 2) permet de mettre en évidence l’expression des deux enzymes. Celles-ci sont ensuite purifiées (Fig.41., Pistes 3) sur résine de Nickel grâce à la présence de six résidus histidine à chacune de leurs extrémités (Fig.42.). Les tailles attendues pour les protéines taggées et non glycosylées, car exprimées dans la bactérie, sont pour Pofut1A de 46,9 KDa et pour Pofut2B de 52 KDa. Figure 41 : Analyse par SDS-PAGE 10,5% de l’expression des enzymes recombinantes bovines Pofut1A et Pofut2B. Pistes 1, protéines bactériennes avant induction; pistes 2, protéines bactériennes après induction; pistes 3, 1µg des fractions protéiques purifiées. La présence de deux étiquettes histidine, à la fois en N et C-terminal, sur chaque protéine permet d’augmenter le rendement des étapes de purification sur résine de nickel (Ni 2+ ). Figure 42 : Représentation schématique des protéines Pofut1A et Pofut2B bovines produites dans le système bactérien. Le peptide signal est en rose, les motifs conservés entre les α2-, α6- et les O-fucosyltransférases en orange, le DXD en violet, le KDEL-like de Pofut1 en vert. Les acides aminés, au nombre de 51, rajoutés par le vecteur sont en jaune et les étiquettes histidine sont en bleu foncé. 135
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1.2.2 Pro<strong>du</strong>ction d’anticorps anti-Pofut bovins<br />
Avant de déterminer les activités <strong>des</strong> O-fucosyltransférases <strong>bovines</strong> codées par les<br />
différents variants, <strong>et</strong> dans le but d’étudier l’expression de celles-ci dans différents tissus<br />
bovins ou autres, nous avons pro<strong>du</strong>it <strong>des</strong> anticorps spécifiquement dirigés contre ces <strong>enzymes</strong>.<br />
Les séquences codantes <strong>des</strong> transcrits Pofut1a <strong>et</strong> Pofut2b (uniques variants dont nous<br />
disposions à l’époque) ont été clonées de manière orientée dans le vecteur d’expression<br />
bactérien pET28c, grâce aux sites de restriction NdeI <strong>et</strong> XhoI. Le clonage <strong>des</strong> séquences<br />
<strong>bovines</strong> a nécessité, au préalable, leur amplification avec <strong>des</strong> couples d’amorces apportant les<br />
sites de restriction enzymatique <strong>et</strong> perm<strong>et</strong>tant de conserver le cadre de lecture avec le vecteur<br />
pET28c qui apporte le codon d’initiation de la tra<strong>du</strong>ction. Les couples d’amorces utilisés sont<br />
répertoriés dans le tableau 3.<br />
Tableau 3 : Couples d’amorces utilisés pour les clonages en vecteur d’expression procaryote<br />
pET28c.Les sites de restrictions sont soulignés.<br />
Amorces Séquences<br />
Pofut1-NdeI/5’ 5’-CATATGGGCGCCGCCGCG-3’<br />
Pofut1-XhoI/3’ 5’-CTCGAGGAATTCATCCCGCAGCTG-3’<br />
Pofut2-NdeI/5’ 5’-CATATGGCGGCGCTTGCCGTCGTC-3’<br />
Pofut2-XhoI/3’ 5’-CTCGAGGTATGCAATCCTCCAATG-3’<br />
Les amplifiats ainsi obtenus sont d’abord clonés dans le plasmide TOPO2.1. Puis, les<br />
séquences d’intérêt sont isolées grâce à la double digestion <strong>du</strong> plasmide par les <strong>enzymes</strong> de<br />
restriction NdeI <strong>et</strong> XhoI. Elles sont ensuite intro<strong>du</strong>ites aux mêmes sites dans le vecteur<br />
pET28c, préalablement digéré. Ce vecteur porte le promoteur <strong>du</strong> bactériophage T7 <strong>et</strong><br />
l’opérateur lacUV5 pour le cont<strong>rôle</strong> de l’expression <strong>du</strong> gène d’intérêt. Les constructions,<br />
pET28c-Pofut1a <strong>et</strong> pET28c-Pofut2b, sont transformées dans la souche Escherichia coli<br />
BL21(DE3) qui porte dans son génome le gène codant l’ARN polymérase T7 (lysogène<br />
λDE3) sous la dépendance <strong>du</strong> promoteur lacUV5, in<strong>du</strong>ctible par un galactoside. En présence<br />
de l’in<strong>du</strong>cteur, un βgalactoside, le gène de l’ARN polymérase présent sur le chromosome<br />
bactérien s’exprime. L’absence de répression perm<strong>et</strong> à c<strong>et</strong>te polymérase d’initier la<br />
transcription <strong>du</strong> gène d’intérêt.<br />
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