Ecologia Mediterranea

Résumés de thèses
laccases halotolérantes étaient susceptibles d’être produites
dans de tels milieux et qu’elles étaient également capables
d’oxyder certains HAPs in vitro, pouvant donc contribuer à
la biorémédiation des sols pollués par ces molécules aromatiques.
En outre, une résistance microbienne importante
a été démontrée puisque les activités enzymatiques ne sont
pas affectées par la présence de ce contaminant, illustrant
l’adaptabilité des communautés microbiennes associées à
la litière de pin d’Alep en zone littorale. La minéralisation
enzymatique microbienne des HAPs constitue donc une
voie de décontamination naturelle et contribue globalement
à la restauration de la qualité de ces environnements. Ces
résultats confirment le rôle des communautés fongiques
productrices d’enzymes lignolytiques (tels que les laccases)
en tant qu’acteurs clés de la détoxification des litières. Il
est important de noter également l’effet indirect de l’induction
de l’expression des laccases consécutivement à
l’apport expérimental d’HAP puisque la dégradation des
composés phénoliques naturels a été exacerbée dans ce
contexte. Par ailleurs, certaines des laccases induites par
l’anthracène ont pu être extraites des litières de pin d’Alep
et séquencées, ce qui constitue une approche nouvelle dans
l’étude des processus fonctionnels microbiens. Ainsi, des
recherches complémentaires pourraient s’attacher à développer
des approches méta-protéomiques ciblant spécifiquement
certaines fonctions enzymatiques en vue de
répondre à divers questionnements complémentaires :
(a) quelles enzymes sont responsables de la dégradation
d’un contaminant et plus en amont quels sont les microorganismes
qui les produisent ? (b) quels sont les profils
protéiques observables au cours de la dégradation des polluants
et en particulier voit-on apparaître de nouvelles isoformes
induites aux propriétés nouvelles ? (c) quels sont
les microorganismes capables de survivre et de demeurer
fonctionnellement actifs au sein des sols pollués ?
Par ailleurs, la diversité génétique et enzymatique qui
conduit à une pérennisation des fonctions peut aussi constituer
des « bioressources » potentiellement exploitables dans
le cadre de nouvelles applications biotechnologiques. Le
sol peut être considéré comme un hot spot de diversité
microbienne, diversité qui n’est pour l’instant que très partiellement
explorée. Un vaste travail d’identification de
nouvelles espèces microbiennes ainsi que de nouveaux
gènes et fonctionnalités d’intérêts subsiste.
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Renaud JAUNATRE 2011
Dynamique et restauration
d’une steppe méditerranéenne
après changements d’usages
(La Crau, Bouches-du-Rhône, France)
169 p. + annexes
Thèse soutenue le 7 décembre 2012 à l’université d’Avignon
et des Pays de Vaucluse (Institut universitaire de technologie).
Jury – Richard HOBBS (P r , université de Western Australia, Australie),
Martin ZOBEL (P r , université de Tartu, Estonie), rapporteurs. Rob
MARRS (P r , université de Liverpool, UK), Jonathan MITCHLEY (D r ,
université de Reading, UK) examinateurs. François MESLÉARD (directeur
de recherche, Tour du Valat, P r associé université d’Avignon et
des Pays du Vaucluse), président du jury. Élise BUISSON (maître de
conférences HDR, université d’Avignon et des Pays du Vaucluse),
directice. Thierry DUTOIT (directeur de recherche CNRS, université
d’Avignon et des Pays du Vaucluse), codirecteur.
Mots clés : biodiversité, communauté végétale, écologie de
la restauration, étrépage de sol, friches culturales, indicateurs,
ingénierie écologique, parcours méditerranéens, perturbation,
réhabilitation, résilience, richesse spécifique, semis d’espèces
nurses, succession végétale – transfert de foin, transfert de sol,
verger.
La restauration écologique a été identifiée comme une
approche permettant notamment de ralentir la perte de biodiversité
et de maintenir tous les biens et services issus de
cette biodiversité desquels dépend le bien-être de notre civilisation
actuelle. Cette restauration des écosystèmes se base
sur des connaissances provenant à la fois de l’écologie des
communautés et de l’écologie de la restauration. Les objectifs
de la thèse sont donc de comprendre la dynamique
d’une steppe méditerranéenne après changements d’usage
ainsi que la mise en œuvre de techniques qui pourraient
être appliquées à la restauration de cet écosystème après
une perturbation anthropique sévère. La thèse a pour objet
d’étude la steppe méditerranéenne de la plaine de Crau, et
notamment d’anciennes cultures, pour étudier la recolonisation
spontanée après perturbation et le projet de réhabilitation
à grande échelle de Cossure pour les expérimentations
sur les techniques de restauration. En ce qui concerne
la dynamique après une perturbation anthropique exogène
sévère, nous avons confirmé la faible résilience de la communauté
végétale steppique à la fois à moyen (30-40 ans)
et long terme (150 ans), tandis que les paramètres du sol et
le taux d’infestation des mycorhizes sont résilients sur le
long terme. En outre, nous avons confirmé le rôle joué par
les trois filtres dans la recolonisation des communautés
végétales. En ce qui concerne la steppe de la Crau, la recolonisation
est déterminée d’abord par le filtre abiotique,
puis par le filtre de dispersion et enfin par le filtre biotique.
Compte tenu de la faible résilience de la communauté, nous
avons testé plusieurs techniques de restauration appliquées
ecologia mediterranea – Vol. 38 (2) – 2012