Ecologia Mediterranea

enlargement of this bioclimatic envelope towards the north
and west of France. We therefore studied the temporal
dynamics from EID’s daily interventions’ database over the
period 2004-2009. At this local scale (3,105 ha) and taking
into account inter-and intra-annual meteorological variability,
we then developed a binary logistic model of occurrences
of daily hatching outbreaks. The resulting model
showed that the type of land use, firstly in interaction with
minimum temperature, photoperiod, temperature amplitude
and to a lesser extent precipitation and their variability secondly,
are the main factors explaining the occurence of
Aedes caspius outbreaks. Climate anomalies were applied
to the sequence of weather conditions observed over the
period 2004 to 2009. The corresponding projections of
hatching occurrences and hatching were obtained. Different
scenarii show an increase in the annual activity period
up to a maximum for the geographical area in question.
Leila QASEMIAN 2012
Caractérisation du potentiel de
dégradation de matières organiques
naturelle (litière) et anthropique (HAP)
par les communautés microbiennes
issues du milieu littoral méditerranéen
125 p.
Thèse d’université soutenue le 2 février 2012 à l’université
d’Aix-Marseille, IMBE, UMR CNRS 7263 – IRD 237, faculté des
sciences de Saint-Jérôme, avenue Escadrille Normandie-
Niémen, Boîte 441, 13397 Marseille cedex 20, France.
Jury – Jean Michel SAVOIE (CR INRA, HDR, UR MYCSA, Bordeaux
Aquitaine), président. François BUSCOT (P r , UFZ université de Leipzig,
Allemagne), rapporteur. Sylvie RECOUS (D r , INRA, UMR FARE,
Reims), rapporteur. Antonio BISPO (ingénieur, ADEME, Angers).
Daniel GUIRAL (D r , IRD, UMR CNRS 7263 IMBE, université d’Aix-
Marseille), codirecteur. Anne-Marie FARNET (maître de conférences,
HDR, université d’Aix-Marseille, UMR CNRS 7263 IMBE), directeur.
Mots clés : anthracène, calanques de Marseille, écologie
microbienne, laccases, Pinus halepensis, RMN du solide 13 C,
stress halin.
Les écosystèmes méditerranéens littoraux sont soumis à
divers stress environnementaux naturels (notamment
les stress hydrique et halin) et anthropiques susceptibles de
s’intensifier dans les prochaines décennies dans le contexte
de changements globaux. Ainsi, le fonctionnement des
communautés microbiennes, encore très peu étudié dans
de tels milieux, semblait important à préciser. L’effet de
l’empreinte littorale sur la transformation de la matière
organique dans la litière de pin d’Alep issue des calanques
de Marseille a été estimé ainsi que le potentiel de biodé-
ecologia mediterranea – Vol. 38 (2) – 2012
Résumés de thèses
gradation d’un polluant ubiquiste, l’anthracène, un hydrocarbure
aromatique polycyclique (HAP). Différentes
approches intégratives in situ, ex situ et in vitro ont été utilisées
en associant plusieurs méthodes permettant d’estimer
l’état fonctionnel du milieu (activités enzymatiques,
respirométrie, diversité fonctionnelle microbienne et évolution
chimique de la matière organique par RMN du solide
du 13 C).
Dans le cadre de cette thèse, en recourant à des approches
in situ via les litter bags, le rôle primordial de certains facteurs
environnementaux, édaphiques et bioclimatiques, ont
pu être mis en évidence dans la structuration et le fonctionnement
microbien, et en conséquence, sur les modalités
et les cinétiques des processus de décomposition de la
matière organique. En particulier il a été possible de montrer
que l’évolution des activités microbiennes était fortement
dépendante des saisons. Température et humidité correspondent
donc à des facteurs majeurs de structuration
microbienne et influent donc aussi sur la diversité des fonctions
assurées par ces communautés et, plus encore, sur les
intensités et les cinétiques des processus enzymatiques qui
concourent collectivement au fonctionnement durable de
l’ensemble de l’écosystème.
En outre, dans un contexte méditerranéen déjà contraint, la
proximité du trait de côte et donc des influences marines
(source d’apport de sels ou de polluants via les embruns)
était supposée constituer une contrainte supplémentaire
comparativement aux milieux continentaux. Les résultats
obtenus infirment cette hypothèse. En effet, l’empreinte littorale
ne s’accompagne pas au plan microbien de déséquilibres
fonctionnels. Ce constat suggère que, par leur localisation
et donc la permanence de leur exposition à ce
facteur de stress, s’est opérée sur la durée une sélection de
communautés microbiennes et des fonctions exprimées par
celles-ci. Ainsi, les communautés microbiennes issues de
ces milieux plus contraints apparaissent paradoxalement
plus robustes.
La présence croissante de polluants divers au sein des sols
et des litières en zone périurbaine comme dans le cas du
littoral marseillais, liée à une intensification des activités
anthropiques, suscite aujourd’hui de fortes inquiétudes
compte tenu du danger que ces poly-contaminations peuvent
représenter pour l’équilibre des écosystèmes naturels.
Parmi les différents types de pollutions, nous nous sommes
focalisés sur les pollutions chroniques. Moins spectaculaires
que des pollutions de type accidentel, elles sont souvent
négligées, alors que leurs impacts sur la durée peuvent
tout aussi gravement nuire à l’intégrité fonctionnelle
des écosystèmes. Les HAPs, contaminants atmosphériques
récurrents, correspondent à un ensemble de molécules
toxiques très diverses dont la faible solubilité dans l’eau
contribue à leur persistance dans l’environnement. Dans ce
cadre, en recourant à des expérimentations ex situ et in
vitro, il a été possible de démontrer clairement un fort
potentiel des communautés microbiennes présentes au sein
des litières de pin d’Alep en zone littorale pour la décontamination
de ces milieux, en utilisant l’anthracène comme
HAP modèle. Nous avons pu en effet montrer, à partir de
nouvelles souches fongiques isolées de ces litières, que des
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