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ange. The comparisons of fruit and seed traits revealed a major difference on diaspore between Arenaria species. In fact, Arenaria species produce, in general, many very small light seeds, which are dispersed from open dry capsules. However, the diaspore of A. provincialis is an indehiscent ovoid capsule containing one heavy seed. This specific diaspore allows A. provincialis to find free spaces between gravels and to reach down lower layers of fine substrate, and its young seedlings to quickly develop deep roots using the large reserve of its heavy seeds. The evolution of this specific type of capsule and seed is likely the result of a past isolation event of its ancestor in steep scree slopes and lapiaz of the southern Provence hills, considered as refuges during the climatic changes of Pleistocene. The restricted distribution of A. provincialis is probably due to the past isolation event in early Pleistocene and to its specialised diaspore which limited dispersal capacity. This thesis provides new knowledge on the endemism in Arenaria genus and the ecology, biology and conservation of plants in rocky habitats. Aboura RÉDDA 2011 Contribution à l’étude des Atriplexaies en Algérie occidentale, aspects physionomiques et phytodynamiques Thèse soutenue le 22 septembre 2011 à l’université Aboubakr Belkaid, Tlemcen (Algérie). Jury – Mohamed BOUAZZA (P r , université Abou-bakr Belkaid, Tlemcen), président. Djamel BENMANSOUR (MCA, université Abou-bakr Belkaid, Tlemcen), examinateur. Khelladi MEDERBEL (P r , université de Mascara), examinateur. MOULAY Belkhodja (P r , université Es- Sénia, Oran), examinateur. Seghir HADJADJ AOUL (P r , université Es- Sénia, Oran), examinateur. Noury BENABADJI (P r , université Aboubakr Belkaid, Tlemcen), directeur. Mots clés : Atriplexaies, analyse factorielle des correspondances, dynamique végétale, cartographie végétale, nord de Tlemcen, Chott El Gharbi, Oranie (Algérie). L ’intérêt grandissant que suscitent les groupements à Atriplex halimus (Atriplexaies) nous a incités à apporter notre contribution à travers ce présent travail. Après un examen du milieu physique de notre région d’étude qui est une partie de l’Oranie, l’étude bioclimatique a révélé un gradient pluviométrique qui décroît du nord vers le sud. L’étude floristique a mis en évidence la diversité de nos Atriplexaies. L’analyse factorielle des correspondances réalisée à l’aide du logiciel Minitab 15 nous a permis de mettre en exergue les paramètres écologiques qui gèrent la composition floristique de ces dernières. À Messerghine, les paramètres édaphiques (humidité, matière organique et ecologia mediterranea – Vol. 38 (1) – 2012 Résumés de thèses salinité) expliquent en grande partie l’information apportée par les deux premiers axes (41 %). À Béni-Saf, en s’éloignant de la Sebkha d’Oran, le facteur humain explique la grande part de l’information (plus de 55 %). Pour la station d’El-Kasdir (domaine steppique), c’est à la fois le paramètre édaphique (salinité) et surtout le paramètre anthropique qui explique l’information apportée par les deux premiers axes (61,13 %). Notre travail comprend aussi un aperçu sur la dynamique régressive des halophytes steppiques, c’est une étude diachronique réalisée dans la station de Hassi-Mellah à partir des relevés floristiques réalisés en 1991 et 2005. Enfin un chapitre a été consacré à la cartographie, il s’agit de la conception de cinq espaces visualisés qu’on appelle fenêtres physionomiques (trois au nord et deux au sud) qui illustrent la physionomie et l’hétérogénéité des formations végétales et plus particulièrement les peuplements halophytes. On remarque d’autre part que les peuplements purs à Atriplex halimus ne couvrent actuellement que 3 % de la surface totale dans les cinq fenêtres. Les surfaces agricoles dominent la fenêtre d’El- Malah (64,69 %) alors que les pelouses et les matorrals occupent presque 50 % de la surface des fenêtres de Zenata et Emir Abdelkader. Peganum harmala envahit les Atriplexaies du Chott El Gharbi en marquant sa présence, plutôt sa dominance sur 50 % de la surface totale des fenêtres établies au niveau de cette zone. Jérémy MIGLIORE 2011 Empreintes des changements environnementaux sur la phylogéographie du genre Myrtus en Méditerranée et au Sahara 249 p. Thèse soutenue le 3 octobre 2011 à l’université Paul Cézanne (Aix-Marseille 3), IMEP, Technopôle de l’environnement Arbois-Méditerranée, Bâtiment Villemin, BP 80, avenue Louis Philibert, 13545 Aix-en-Provence cedex 04, France. Jury – Gonzalo NIETO FELINER (P r , CSIC, Real Jardín Botánico de Madrid, Espagne), président. Daniel JEANMONOD (P r , université/ Conservatoire et jardin botaniques de Genève, Suisse), rapporteur. Guillaume BESNARD (D r , CNRS, UMR EDB, Toulouse), rapporteur. Hans Peter LINDER (P r , University/Institute of Systematic Botany of Zurich, Suisse). Frédéric MÉDAIL (P r , université Paul Cézanne, UMR IMEP, Aix-Marseille), directeur. Alex BAUMEL (Maître de conférences, université Paul Cézanne, UMR IMEP, Aix-Marseille), codirecteur. Mots clés : biogéographie, changements climatiques, conservation, datations moléculaires, génétique des populations, insularité, modélisation bioclimatique, Myrtaceae, paléoécologie, phylogéographie. 97
Résumés de thèses Une meilleure compréhension de l’origine et de l’évolution de la diversité du vivant nécessite de développer des approches biogéographiques basées sur la phylogéographie. En effet, la phylogéographie étudie les principes et les phénomènes gouvernant la distribution géographique des lignées génétiques d’une même espèce ou entre espèces apparentées. D’une part, les généticiens et biogéographes étudient la répartition actuelle des lignées d’espèces végétales, témoignage d’une mise en place passée, mais dont ils ont des difficultés pour déterminer la dynamique dans l’espace et au cours des temps géologiques. D’autre part, l’approche paléobotanique ne possède qu’un faible pouvoir de résolution taxonomique et ne peut appréhender les flux migratoires que dans leur globalité. La phylogéographie est alors appliquée à différentes échelles spatiales, en intégrant à la biogéographie, la phylogénétique mais aussi la paléoécologie, pour examiner la généalogie du vivant à travers un cadre spatio-temporel précis. La région méditerranéenne représente l’un des trentequatre points chauds de biodiversité de notre planète, tant par la richesse des communautés végétales que par son niveau élevé d’endémisme. Cette biodiversité est associée à une grande diversité d’écosystèmes et de paysages, forgée par un relief tourmenté, des climats contrastés et une histoire biogéographique complexe (persistance sur le long terme, multiples zones refuges…). Le rôle de carrefour biogéographique du bassin méditerranéen a souvent été avancé pour expliquer la biodiversité remarquable qu’il abrite. Toutefois, la majorité des approches phylogéographiques menées jusqu’à présent se sont limitées à l’étude d’espèces végétales endémiques, spatialement restreintes, sans intégrer des taxons distribués en Méditerranée mais aussi dans des régions biogéographiques adjacentes. Ce travail de thèse considère ainsi la structure phylogéographique du Myrte commun (Myrtus communis L., Myrtaceae), plante caractéristique et commune des matorrals de l’ensemble de la Méditerranée, et ses liens de parenté avec le Myrte de Nivelle (Myrtus nivellei Batt. & Trab.), endémique des montagnes du Sahara central. Un des objectifs consiste à examiner plus particulièrement l’influence de la paléogéographie et des changements climatiques sur la diversité génétique de ces deux taxons. La démarche choisie se veut intégrative, en combinant données génétiques (séquençage et génotypage multiloci) et paléobotaniques, modélisation de l’évolution moléculaire, modélisation de la niche bioclimatique, polymorphisme et héritabilité de la croissance en conditions contrôlées. L’analyse de 173 populations de Myrte commun et de 23 populations de Myrte de Nivelle a révélé un fort signal phylogéographique. Le cadre spatio-temporel provient de la datation des divergences et de la reconstruction des aires ancestrales au sein des phylogénies moléculaires (ADN chloroplastique et nucléaire), à partir des méthodes bayésiennes d’analyse phylogénétique. Trois résultats principaux peuvent être présentés. 1) À partir d’une origine remontant au début du Miocène, l’histoire du genre Myrtus se résume à deux périodes de 98 diversification associées aux changements environnementaux survenus à la transition Miocène/Pliocène, et au cours du Pléistocène. Le rôle de la mise en place progressive du climat méditerranéen, de la crise de salinité du Messinien et des oscillations climatiques du Pléistocène est alors discuté pour interpréter les patrons phylogéographiques obtenus. Si un phénomène de vicariance ancien a conduit à l’isolement d’une lignée est-méditerranéenne, des phénomènes récents de diversification ont été détectés à l’ouest avec migration en retour vers l’est de la Méditerranée, mais aussi vers la Macaronésie et vers le Sahara. 2) Au cœur des montagnes-refuges du Sahara central, l’alternance des périodes humides et arides serait à l’origine de l’isolement des populations de Myrte de Nivelle par massif et d’une forte érosion génétique. Cette forte différenciation régionale s’accompagne de flux de gènes au sein des massifs, et de multiplication végétative. Retracer les trajectoires évolutives des populations de Myrte implique donc à la fois de mieux comprendre l’empreinte laissée par la succession des changements environnementaux, mais aussi l’écologie et les capacités de dispersion des taxons analysés, avec pour le Myrte le rôle non négligeable de l’ornitochorie. 3) Enfin, l’absence de divergence des populations insulaires méditerranéennes comme la Corse contraste avec la persistance sur le long terme de lignées aux Açores et à Madère, et avec la spéciation au Sahara du Myrte de Nivelle. Trois types d’insularité (îles continentales, océaniques et montagneuses), trois histoires évolutives distinctes, qui peuvent être analysées à la lumière du degré d’isolement de ces îles, mais aussi de leur stabilité au cours des temps géologiques et de l’impact des activités anthropiques. En parallèle, les scénarios évolutifs mis en évidence précédemment ont été confrontés à des modélisations bioclimatiques dans l’actuel et au dernier maximum glaciaire de l’aire de distribution du Myrte commun. Suivant une approche plus mécaniste, nous avons également examiné l’héritabilité des paramètres morphologiques de croissance des populations de Myrte commun collectées de part et d’autre d’un gradient climatique régional en Provence- Alpes-Côte d’Azur et soumises à un stress hydrique sous conditions contrôlées. La discussion de ces résultats s’ouvre sur de nouvelles perspectives en phylogéographie comparative, en génomique et en biogéographie de la conservation. ecologia mediterranea – Vol. 38 (1) – 2012
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Pr Thierry DUTOIT Éditeur en chef
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