these - Université de Franche-Comté

2.1.5.3 Techniques moléculaires d’identification
L’identification phénotypique des streptocoques est parfois compliquée
par la variabilité importante des réactivités métaboliques des souches
au sein d’une même espèce ou par la similitude des profils
biochimiques de souches appartenant à des espèces différentes.
Des méthodes génotypiques ont donc été proposées pour différencier
des espèces proches grâce à l’utilisation de sondes
oligonucléotidiques, ou pour identifier les espèces différentes d’un
genre, d’un ensemble ou d’un sous-ensemble par l’amplification de
séquences nucléotidiques spécifiques.
Ainsi, l’identification précise des souches de streptocoques est
effectuée par :
comparaison des profils de restriction des gènes codant pour les
ARNr (ribotypie),
comparaison des séquences nucléotidiques,
l’éléctrophorèse en champ pulsé (pour les streptocoques pyogènes
et les entérocoques essentiellement),
le typage moléculaire, pour les streptocoques du groupe A.
L’ARNr 16S et son gène sont présents dans toutes les bactéries et
comportent des séquences de nucléotides hautement conservées,
aussi bien que des séquences plus variables. Ces dernières permettent
d’identifier les souches et espèces [4].
10