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totale, claire et bien limitée (β-hémolyse) ; partielle et verdâtre à bords mal limités (α-hémolyse) ou absente (γ-hémolyse). β-hémolyse α-hémolyse 3) La présence ou non d'un antigène lié à un polysaccharide de paroi et spécifique de groupe. Parmi les groupes antigéniques désignés par Rebecca Lancefield, les groupes A, B, C ou G caractérisent les espèces de streptocoques β-hémolytiques les plus pathogènes. Les streptocoques α-hémolytiques ou non hémolytiques appartiennent à d'autres groupes ou sont non groupables, et sont habituellement commensaux. 4) Un ensemble de caractères biochimiques. En effet, quelques tests suffisent à compléter l'identification des espèces β-hémolytiques des groupes A, B, C ou G, et celle des pneumocoques. Une galerie complète de tests est nécessaire pour identifier les autres espèces. 5) La sensibilité aux antibiotiques. La pénicilline G est active sur les streptocoques, mais à des degrés divers selon les espèces. Certaines souches de pneumocoques ont acquis une résistance relative aux pénicillines. 9
2.1.5.3 Techniques moléculaires d’identification L’identification phénotypique des streptocoques est parfois compliquée par la variabilité importante des réactivités métaboliques des souches au sein d’une même espèce ou par la similitude des profils biochimiques de souches appartenant à des espèces différentes. Des méthodes génotypiques ont donc été proposées pour différencier des espèces proches grâce à l’utilisation de sondes oligonucléotidiques, ou pour identifier les espèces différentes d’un genre, d’un ensemble ou d’un sous-ensemble par l’amplification de séquences nucléotidiques spécifiques. Ainsi, l’identification précise des souches de streptocoques est effectuée par : comparaison des profils de restriction des gènes codant pour les ARNr (ribotypie), comparaison des séquences nucléotidiques, l’éléctrophorèse en champ pulsé (pour les streptocoques pyogènes et les entérocoques essentiellement), le typage moléculaire, pour les streptocoques du groupe A. L’ARNr 16S et son gène sont présents dans toutes les bactéries et comportent des séquences de nucléotides hautement conservées, aussi bien que des séquences plus variables. Ces dernières permettent d’identifier les souches et espèces [4]. 10
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