Support du cours LS3-2 (G.DECOCQ)

INTRODUCTION À LA 

MYCOLOGIE 

Mycologie = science qui étudie les champignons 

Mycologie : domaine de compétence du 

pharmacien : 

- reconnaissance de macromycètes 

- biotechnologies fongiques 

- industrie pharmaceutique 

- biologie médicale (parasitologie) 

- phytopathologie 

Mycologie = science fondamentale pour 

l’appréhension de la parasitologie humaine, la 

pharmacognosie et la mycologie appliquée

Qu’est-ce qu’un champignon ? (= fungus ou mycète) mycète 

---> une plante primitive ou dégénérée ? (règne 

végétal --> thallophytes cryptogames, cryptogames sans pigment 

assimilateur) 

---> un organisme appartenant à un ensemble original 

= règne fongique (vision du monde vivant à 5 règnes: 

Procaryotes, Protistes, Végétaux, Animaux, Champignons) 

---> un organisme inclus dans un ensemble artificiel, artificiel 

polyphylétique, d’organismes présentant un certain 

nombre de caractères communs « pratiques » 

4 caractères fondamentaux (ex-« règne fongique ») 

1- Organismes eucaryotes 

2- Mode de vie hétérotrophe 

3- Appareil végétatif ramifié, diffus et tubulaire 

4- Reproduction par des spores 

+ 3 caractères supplémentaires (champignons 

«vrais» ou Eumycètes) Eumycètes 

5- nutrition par absorption 

6- spores non flagellées (exceptionnellement 

uniflagellées) 

7- paroi cellulaire chitineuse

CHAMPIGNONS 

EUMYCÈTES 

-544 MA 

? 

-400 MA 

-380 MA 

-438 MA 

-460 MA 

LIGNÉE VERTE 

CHAMPIGNONS 

CHOANO-ORGANISMES 

CHOANO ORGANISMES 

Straménopiles 

Haptophytes 

Ciliés 

Dinophytes 

Mycétozoaires 

Euglénobiontes 

Rhizopodes 

Chlorarachniophytes 

MICROSPORIDIES 

BASIDIOMYCÈTES 

ASCOMYCÈTES 

ZYGOMYCÈTES 

CHYTRIDIOMYCÈTES

STRAMÉNOPILES 

MYCÉTOZOAIRES 

? 

BLASTOCYSTEA 

PROTEROMONADEA 

OPALINIDEA 

BICOECEA 

LABYRINTHULOMYCÈTES 

HYPHOCHYTRIOMYCÈTES 

OOMYCÈTES 

BIGYROMONADAE 

OCHROPHYTA 

ACRASIOMYCÈTES 

MYXOMYCÈTES 

ARCHÉAMIBES

mais traditionnellement, la mycologie étudie les 

organismes se rapportant au règne fongique sous son 

ancienne définition : 

- Champignons (Microsporidies et Eumycètes) 

- une partie des Straménopiles (Oomycètes, 

Labyrinthulomycètes, Hyphochytriomycètes) 

- une partie des Mycétozoaires (Myxomycètes, 

Acrasiomycètes) 

Actuellement, plus de 70 000 espèces connues 

(mais environ 1 700 nouvelles espèces décrites 

chaque année !) 

--> estimation : 1,5 millions d ’espèces

LES MYCÉTOZOAIRES 

I. POSITION SYSTÉMATIQUE 

II. CARACTÈRES GÉNÉRAUX 

III. LES MYXOMYCÈTES 

IV. LES ACRASIOMYCÈTES 

V. ECOLOGIE 

VI. INTÉRÊT DES MYCÉTOZOAIRES


le phyllum des Mycétozoaires regroupe : 

- les Acrasiomycètes = « myxomycètes à cellules » ou 

Dictyosteliomycota 

- les Myxomycètes (stricto sensu) ou Myxomycota 

- les Archéamibes ? (ex: Entamoeba histolytica) 

lignée différenciée il y a environ 1 milliard 

d’années à partir des protistes (un millier d ’espèces ?, 

160 connues en France) 

Acrasiomycètes + Myxomycètes = Myxostelidae 

ou Gymnomycota (champignons-animaux) 

MYCÉTOZOAIRES 

? 

ACRASIOMYCÈTES 

MYXOMYCÈTES 

ARCHÉAMIBES


eucaryotes non photosynthétiques à forme libre 

amiboïde (= myxamibe) myxamibe 

masses gélatineuses de taille millimétrique à 

décimétrique 

organismes saprotrophes, parfois parasites 

III. LES MYXOMYCÈTES 

Appareil végétatif (= plasmode) plasmode plurinucléé (= 

coenocyte), sans paroi externe ni cloison, comprenant 2 

régions distinctes : 

- l’endoplasme, l’endoplasme interne, incluant de nombreux 

noyaux à divisions synchrones 

- l’ectoplasme, l’ectoplasme externe, constamment soumis à 

des déformations, à l’origine du déplacement par reptation 

sur les substrats (protéine contractile = myxomyosine), luimême 

entouré d ’une gaine de bactéries symbiotiques du 

genre Bacillus (Bacillus subtilis +++) 

Au cours de ses déplacements, le plasmode englobe des 

particules organiques et les digère (phagocytose)

Lorsque les conditions deviennent défavorables : 

immobilisation du plasmode, condensation en zoosporange 

(en qq heures), générateur de zoospores 

plasmode 

En présence d’eau : 

gonflement du capillitium et 

éclatement du zoosporange 

--> dissémination des zoospores 

Germination des spores 

--> cellules nageuses flagellées 

Multiplication puis fusion 

en myxamibes 

Fusion des myxamibes 

(plasmogamie puis caryogamie) 

--> plasmode 

stipe 

Zoosporange entouré du peridium (= paroi 

glucidique souvent ornementée de CaCO3 )

IV. LES ACRASIOMYCÈTES 

Appareil végétatif = pseudo-plasmode (« troupeau » de 

myxamibes) myxamibes ; ni cellules flagellées, ni vrai plasmode (pas 

de fusion) 

Lorsque les conditions deviennent défavorables : 

agrégation en zoosporange (AMPc !), grâce à un ciment 

cellulosique 

zoosporange fixé par un disque basal 

(sécrété par des myxamibes abortives) et 

porté par un pédoncule cellulosique. Seules 

certaines myxamibes survivent et 

s ’enkystent en zoospores

V. ÉCOLOGIE 

Organismes le plus souvent saprotrophes, vivant dans les 

endroits humides, sur de la matière organique en 

décomposition (bois mort, feuilles mortes, excréments, etc.). 

Organismes hétérotrophes ingérant par phagocytose des 

bactéries et des particules en décomposition 

Arcyria carnea Ceratiomyxa fructiculosa 

Physarum cinereum 

Hemitrichia calyculata 

Stemonitis splendens 

Badhamia affinis 

Diachaea splendens 

Diderma floriforme

Hemitrichia serpula 

Arcyria cinerea 

Tubifera ferruginosa 

Craterium leucocephalum 

Lycogala epidendron 

Craterium aureum 

Perichaena depressa 

Arcyria cinerea 

Didymium perforatum 

VI. INTÉRÊT DES MYXOMYCÈTES 

Agents phytopathogènes 

- Plasmodiophora brassicae : agent de la hernie du 

chou

- Spongospora subterranea : agent de la galle poudreuse de la 

pomme de terre 

Modèle 

- Physarum polycephalum : cultivable in vitro, matériel 

de choix pour l’étude de la mitose

LES OOMYCÈTES 



III. SAPROLÉGNIALES 

IV. PÉRONOSPORALES 

V. INTÉRÊTS


Oomycètes = Mastigomycota ou Phycomycètes 

(champignons-algues) : 

phylum des Straménopiles (= Hétérochontes) qui 

regroupe notamment les Diatomées et les algues 

brunes, jaunes et dorées 

lignée différenciée il y a environ 700 millions 

d’années à partir des Vauchériales = algues brunes 

siphonées (> 2 000 espèces) 


BLASTOCYSTEA 

PROTEROMONADEA 

OPALINIDEA 

BICOECEA 

LABYRINTHULOMYCÈTES 

HYPHOCHYTRIOMYCÈTES 

OOMYCÈTES 

BIGYROMONADAE 

OCHROPHYTA


Eucaryotes à mode de vie aquatique, souvent 

saprotrophes, parfois parasites 

Multiplication asexuée dominante assurée par des 

planospores (cellules nageuses biflagellées hétérochontes) 

ou zoospores, produites au sein de sporocystes 

Reproduction sexuée sans libération de gamètes : 

fécondation directe d ’un gamétocyste femelle (= oogone) oogone 

par un gamétocyste mâle (= spermatocyste) spermatocyste grâce à des 

tubes copulateurs, copulateurs aboutissant à un zygote = oospore 

--> oogamie siphonogame 

Cycle majoritairement diploïde 

Appareil végétatif = thalle à siphons 

paroi cellulaire constituée de microfibrilles de ß1-> 3,ß1-> 

6 glucanes et de cellulose (ß1-> 4 glucanes) enrobées dans un 

ciment de gluco-, xylo-, galacto-mannoprotéines 

2 lignées : 

- Saprolégniales : moisissures aquatiques 

- Péronosporales : parasites des végétaux supérieurs 

terrestres

III. SAPROLÉGNIALES 

champignons filamenteux très commun dans l’eau, sur les 

déchets organiques, les cadavres de petits animaux, etc. 

IV. PÉRONOSPORALES 

Passage du saprophytisme au parasitisme occasionnel, 

puis au parasitisme strict, qui s ’accompagne d ’une 

adaptation de plus en plus marquée à la vie aérienne 

Thalle (2n) : 

intracellulaire chez les espèces primitives (mode de 

vie aquatique), intercellulaire chez les espèces évoluées 

(mode de vie terrestre), qui émettent des suçoirs ou 

haustoriums à l ’intérieur des cellules de l ’hôte

Multiplication asexuée : 

Sporocystes isolés ou groupés à l’extrémité de 

sporocystophores ramifiés, qui s ’extériorisent de l’hôte par 

les stomates. 

Après dispersion par le vent : 

- libération de planospores biflagellées chez les espèces 

archaïques (Pythium spp.) ; 

- libération de planospores en milieu humide ou production 

d’un siphon en milieu sec chez certains genres (Phytophtora spp.) ; 

- formation systématique d ’un siphon chez les genres les plus 

évolués (Peronospora spp.). 

Reproduction sexuée 

(oogamie oogamie siphonogame) siphonogame : 

Application du 

spermatocyste contre 

l’oogone et perforation de 

la paroi par un tube 

copulateur qui véhicule le 

ou les gamètes mâles 

jusqu’à l’oosphère, souvent 

unique (les autres noyaux 

--> périplasme) 

périplasme

Classification : 3 familles 

• Pythiacées 

saprotrophes sur débris organiques ou parasites de 

petits animaux et végétaux 

• Péronosporacées 

parasites obligatoires des végétaux 

• Albuginacées 

parasites obligatoires des végétaux à sporocystophores 

groupés en sores sous les épidermes inférieurs des feuilles 

Saprolégniales 

parasites de poissons 

Saprolegnia thuretii 

V. INTÉRÊTS 

Péronosporales 

Pythiacées 

Pythium baryanum : agent de la maladie de la 

fonte des semis

Phytophtora faberi : parasite de nombreuses cultures 

tropicales (hévéa, cacaoyer, cocotier, etc.) 

Phytophtora cambivora : agent de la maladie de 

« l ’encre du châtaignier » 

Phytophtora infestans : agent du mildiou de la pomme 

de terre 

Plasmopara viticola : agent du mildiou de la vigne

Albuginacées 

Albugo candida : agent de la « rouille blanche des 

Brassicacées » (choux, radis, navets…)

LES CHAMPIGNONS 


II. MICROSPORIDIES 

III. EUMYCÈTES 

1- Le thalle 

2- Caractères cytologiques 

3- Nutrition 

4- Ecologie 

5- Cycle de développement


Champignons = lignée monophylétique « sœur » de celle 

des Choano-organismes, qui se sont différenciées à partir 

d’un ancêtre commun (protiste flagellé), proche des actuels 

Choanoflagellés, il y a au moins 544 millions d’années 

n ’ont jamais incorporé de système plastidial 

--> hétérotrophie totale vis-à-vis du carbone 

(= consommateurs) 

EUCARYOTES 

CHAMPIGNONS 


EUMYCÈTES 

MICROSPORIDIES 

CHOANOFLAGELLÉS 

MÉTAZOAIRES

Deux lignées évolutives : 

- Eumycètes = véritables champignons 

- Microsporidies = champignons unicellulaires 

parasites, probablement issus d ’eumycètes ayant subi 

une simplification cellulaire due à la vie parasitaire 

intracellulaire 

II. MICROSPORIDIES 

Eucaryotes unicellulaires 

parasites intracellulaires 

obligatoires ayant 

secondairement perdu leurs 

mitochondries 

Environ 800 espèces, hôtes 

très variés, principalement 

vertébrés et arthropodes 

ni plastes, ni mitochondrie, 

ni cil ou flagelle

à un moment de son cycle, la cellule = spore résistante à 

paroi chitineuse contenant un appareil d’extrusion (Golgi !) 

= tube polaire, polaire enroulé en spirale 

Inoculation du sporoplasme interne à la cellule hôte grâce 

au tube polaire protractile 

dans les cellules parasitées : mitoses et production de 

plasmes multinucléés (= syncytium plasmodial), plasmodial puis 

sporulation 

sexualité inconnue mais présumée 

importance : 

- Ichthyosporidium hoferi = parasite de poissons 

- Nosema bombycis = agent de la pébrine du ver à 

soie 

- Glugea spp. = agent responsable de tumeurs ; chez 

l ’homme, néfastes uniquement chez les individus 

immunodéprimés (infection opportuniste au cours du SIDA)

III. EUMYCÈTES 

Eumycètes ou Eumycota ou Fungi = « règne 

fongique », défini par 7 caractères fondamentaux : 

1- organismes eucaryotes 

2- mode de vie hétérotrophe 

3- appareil végétatif ramifié, diffus et tubulaire 

4- reproduction par des spores 

5- nutrition par absorption 

6- spores non flagellées (exceptionnellement 

uniflagéllées : Chytridiomycètes) 

7- paroi cellulaire chitineuse, sans cellulose 

très grande diversité morphologique : de la simple cellule 

(ex: levure) aux thalles atteignant plusieurs milliers 

d ’hectares (ex: armillaires) 

ni développement embryonnaire, ni véritable 

différenciation tissulaire 

organismes essentiellement terrestres, à thalle filamenteux 

(parfois unicellulaires : levures) 

existence d ’une voie métabolique de biosynthèse de la 

lysine totalement originale (synapomorphie)

ZYGOMYCÈTES 

CHYTRIDIOMYCÈTES 

-544 MA 

-400 MA 

ASCOMYCÈTES 

-460 MA 

-438 MA 

1- Le thalle 

BASIDIOMYCÈTES 

-380 MA 

thalle = mycélium, mycélium constitué d’hyphes hyphes = tubes (Ø= 1- 

15µm) plus ou moins ramifiés, divisés en cellules par des 

parois transverses (= cloisons) cloisons comportant un pore central 

(cloisons quasi absentes, limitées à certaines parties du 

mycelium --> siphons coenocytiques) 

coenocytiques

croissance des hyphes par leur apex ; bourgeonnements à 

l’arrière de l’apex --> ramifications (= nouveaux axes à 

croissance linéaire) ; maillage de l ’ensemble grâce à des 

anastomoses 

les anastomoses se produisent entre filaments d ’un même 

individu ou entre filaments d ’individus différents, mais de la 

même espèce --> permet le développement synchrone 

à partir d ’un point central : front de croissance circulaire 

assurant une surface maximale de contact avec le substrat 

(1g de mycelium = 0,5 m2 ) ; croissance très rapide en 

conditions non limitantes (jusqu’à plus d’1 km en 24 h !) 

croissance centrifuge du mycelium --> épuisement du 

substrat du centre vers la périphérie, entrainant la 

dégénérescence des filaments de la zone centrale 

--> espace annulaire (ronds de sorcière !)

en général : croissance bidimensionnelle à l ’interface air 

(O 2)-substrat (carbone organique) ; parfois croissance 

tridimensionnelle en sphère (milieux poreux) 

croissance limitée à l’apex, concomitante de l’absorption 

l’extension du mycelium conditionne la survie de 

l’organisme (= trophophase) 

trophophase 

en cas de pénurie alimentaire : arrêt de la croissance et 

passage en idiophase --> mise en réserve des aliments (C--> 

glycogène ou oléosomes ; N--> acides aminés ou protéïnes ; 

P--> polyphosphates) 

un déséquilibre alimentaire induit généralement la phase 

reproductive : mobilisation des réserves, survenue de 

processus d’agrégation simulant des organes (haustories, 

rhizomorphes, stroma, etc.), différenciation d’organes organes de 

dispersion et de reproduction 

Simplicité structurelle liée à l’absence de contrôle 

hormonal connu ; des gamones (terpènes) interviennent dans 

les processus de reproduction ; absence d ’hormones animales

2- Caractères cytologiques 

cellule eucaryote typique, mais : 

- petit génome (107 paires de bases) 

- présence de plasmides chez certaines espèces, codant 

pour des métabolites secondaires 

- absence de centriole, remplacés par des corpuscules 

polaires 

- persistance de l’enveloppe nucléaire lors des mitoses 

- formation des cloisons indépendante de la mitose 

- dictyosomes remplacés par des nappes réticulaires 

- absence totale de plastes 

- carbone stocké en oléosomes ou glycogène en rosette 

paroi glucidique = une seule strate de microfibrilles 

constituées de chitine dispersées dans une matrice de 

glucanes : 

- chitine = « cellulose » à gpt N-acétylamine, liaison ß1->4 

souvent accompagnée de chitosanes (= « chitine 

désacétylée) 

- glucanes = glucoses reliés en ß1->4 formant une arête sur 

laquelle se branchent en 3 des chaînes latérales en ß1->3 

associés à des mannanes dont les unités sont associées 

en α1->6 (ramifications en α1->2 et α1->3) --> couche 

amorphe mucilagineuse favorisant la progression des hyphes 

associés à des glycoprotéïnes 

NB: mannanes et glycoprotéïnes = antigènes

3- Nutrition 

Nutrition par absorption 

Ingestion ou assimilation impossibles : nécéssiter 

d’absorber des substances organiques et minérales à l’état 

dissous, dissous généralement après exodigestion 

---> possible grâce à l’apex des hyphes = structure 

viscoélastique comprenant : 

-le dôme apical : permet l’extension du mycelium 

(apport continu de chitine et de glucanes provenant des 

vésicules d ’exocytose) 

-la zone d’absorption : permet la dégradation et 

l’absorption des nutriments (sortie par exocytose d’enzymes 

hydrolysantes, qui restent accrochées à la couche amorphe 

mucilagineuse. 

entrée des nutriments : cotransport avec des protons 

(pompe ATPase H + /K + !) 

--> gradient de H + entre l’hyphe et le substrat pouvant 

atteindre un facteur 1000 (3 unités pH !) 

besoins nutritionnels : 

- eau, sels minéraux (phosphates, nitrates, sulfates…), 

ions (Mg2+ , K + …), oligo-éléments (Fe, Cu…) ; 

- carbone organique (sucres, acides organiques, parfois 

des acides aminés) 

- parfois : vitamines, stérols, acides gras, purines 

--> besoins spécifiques = critères d’identification en mycologie médicale

nutrition carbonée : source variable pour de nombreuses 

espèces ; d ’autres ne sont capables d ’utiliser que certains 

sucres (perméabilité sélective de la paroi, aptitude 

enzymatique réduite) 

nutrition azotée : nitrates +++, sels ammoniacaux, 

peptides, acides aminés, urée 

--> système glutamine synthétase (GS)/glutamate 

synthase (GOGAT) et système glutamate deshydrogénase 

(GDH), selon la source d’azote 

4-Ecologie 

l ’hétérotrophie conditionne le mode de vie, qui peut être de 

3 types : 

- saprotrophie 

- parasitisme 

- symbiose 

certaines espèces peuvent adopter plusieurs modes de vie 

Ex : armillaire = parasite facultatif ou opportuniste 

--> saprotrophe sur souches mortes 

--> parasite sur arbres affaiblis 

tricholome terreux 

--> symbiotique (mycorhizien) sous conifères 

--> saprotrophe sous feuillus

a-Saprotrophie 

Saprotrophie (= saprophytisme) : développement aux dépens 

de matières organiques mortes (animale, végétale, etc.) 

concerne essentiellement des champignons terrestres 

champignons aérobies (exception : commensaux de 

la panse des ruminants), dont certains sont capables de vivre 

en anaérobiose (fermentation : levures, Mucor spp.) 

= organismes détritivores 

synthèse de substances osmotiques particulières : tréhalose 

(ose), mannitol (polyol), proline (acide aminé) 

--> maintien d’une forte pression osmotique 

intravacuolaire 

synthèse de substances protectrices des UV : anthocyanes 

et mélanines 

mais faible résistance à la sécheresse (paroi mince, absence 

de cuticule) 

--> organismes des milieux humides (sauf en cas de 

symbiose lichénique)

synthèse de nombreuses exoenzymes, exoenzymes souvent inductibles : 

glycoprotéïnes riches en mannose +++ (invertase, phosphatase 

acide, asparaginase, α-glucosidase…) 

rôle majeur dans la nature : dégradation de l’humus, 

minéralisation de l’azote dans les sols acides 

--> seuls organismes (avec les bactéries) capables de 

dégrader la cellulose (« pourritures brunes ») 

--> seuls organismes capables de dégrader la lignine en 

acides humiques (Basidiomycètes +++ : « pourritures 

blanches ») 

synthèse et libération de substances antibiotiques (ex: 

pénicilline) pour éliminer ses compétiteurs = allélopathie 

Application : antibiotiques utilisés en thérapeutique 

synthèse de métabolites secondaires, peu nombreux mais 

spécifiques : 

- (poly)peptides : amanitines, pénicillines, 

cyclosporines, ergométrine, psilocine, etc. 

- polycétones : aflatoxines

-Parasitisme 

parasites « obligatoires » ≠ parasites « facultatifs » ou 

« opportunistes » (--> cas de nombreux agents de mycoses humaines !) 

voies d’entrée chez l’hôte : 

- voies naturelles : stomates (plantes), cavités (animaux) 

- voies occasionnelles : blessures (plantes et animaux) 

- effraction : synthèse de cutinases attaquant l’épiderme végétal 

relations hôte-parasite souvent complexes (co-évolution !) 

--> interaction gène à gène 

hôte : gène de résistance codant pour un récepteur membranaire 

parasite : gène d ’avirulence codant pour un éliciteur 

c-Symbiose 

2 principales formes : mycorhizes et lichens 

MYCORHIZES 

= association étroite, à bénéfices réciproques, entre un 

eumycète et une plante vasculaire 

--> symbiose très ancienne à l’origine de la vie terrestre, 

qui concerne environ 90% des espèces végétales terrestres

énéfices pour la plante : 

- amplification de la surface de contact entre les racines 

et la solution du sol (x 50) 

- excrétion d’antibiotiques dans la rhizosphère 

bénéfices pour le champignon : 

- nutrition carbonée facilitée (en forêt 30 à 35% des 

photosynthétats sont utilisés par les mycorhizes) 

2 types fondamentaux de mycorhizes : 

- ectomycorhizes : le mycelium du champignon (un 

macromycète) entoure les racines (qui perdent leurs poils 

absorbants) d’un manteau macroscopique et s ’insinue dans 

les espaces intercellulaires 

--> apparues récemment, au Crétacé (Gymnospermes) 

--> symbioses peu spécifiques

- endomycorhizes : le mycelium du champignon (une 

Endogonacées-Zygomycètes) reste microscopique (pas de 

manteau), forme un réseau explorant le sol et un autre réseau 

qui pénètre à l ’intérieur des cellules racinaires, où il se 

différencie en arborescences : les arbuscules (= organes 

d ’échanges) et les vésicules (= organes de réserve) 

--> apparue très anciennement, au Silurien (Fougères) 

--> symbioses non spécifiques 

- Cas particuliers : 

• Rhizoctonia spp., endomycorhizes en pelotons, 

spécifiques des espèces d’Orchidacées 

• Endomycorhizes éricoïdes, spécifiques des espèces 

d ’Ericacées 

• Ectoendomycorhizes : présence à la fois d ’un manteau 

externe et d’organes intracellulaire (ex: Betula spp.)

LICHENS 

= association étroite, à bénéfices réciproques, entre un 

champignon et une algue, à l’origine d ’une nouvelle 

biomorphose (organisme chimérique !) : 

- champignon = mycosymbiote 

--> apporte la reproduction sexuée 

- algue = photosymbiote 

--> apporte l’autotrophie 

Plus de 20% des espèces de champignons connues sont 

lichénisées ! 

- pour la plupart des Ascomycètes (99% !) 

- exceptionnellement (1% !) des Basidiomycètes (50 

sp), des Deutéromycètes (200 sp) ou un oomycète (1 sp) 

Le photosymbiote est 

- le plus souvent une algue verte (90% des lichens) 

- parfois une cyanobactérie (10 %) 

- 2 ou 3 exceptions connues !

La symbiose s ’accompagne de spécialisations : 

- modifications anatomiques, morphologiques et 

ultrastructurales (pyrénoglobules, corps concentriques) 

- nouvelles voies de biosynthèse : acides lichéniques 

- modification de l’amplitude écologique 

5- Cycle de développement 

Reproduction et multiplication assurées par des spores, spores 

produites soit par voie sexuée, sexuée soit par voie asexuée, asexuée 

immobiles (sauf Chytridiomycètes), sèches et très petites 

(dispersion !) 

absence de production de spores chez certaines espèces = 

Deutéromycètes ou Fungi imperfecti 

reproduction et multiplication uniquement possibles en 

milieu aérien, induites par la lumière (radiations bleues de 

courte λ --> riboflavine couplée à un cytochrome b)

a- Multiplication asexuée 

Spores produites : 

- soit dans des sporanges (= sporocystes) 

sporocystes 

- soit par des cellules conidiogènes --> spores isolées 

ou en chapelets = conidies 

- soit par simple fragmentation des hyphes 

b- Reproduction sexuée 

caractéristique des différents embranchements : 

- zygospore --> Zygomycètes 

- ascospore --> Ascomycètes Progrès évolutifs 

- basidiospore --> Basidiomycètes 

progrès évolutif = recul de la sexualité : 

- gamètes généralement absentes, mâles et femelles de même 

aspect (= isogamètes), isogamètes produits par les gamétanges (= gamétocystes) 

gamétocystes 

- gamètes souvent remplacés par les noyaux eux-mêmes 

- perte de la sexualité contrebalancée par l’hétérothallisme 

hétérothallisme : la 

fécondation fait intervenir des hyphes provenant de thalles différents, 

différant par 1 ou plusieurs couples des gènes (distincts des gènes 

codant pour l ’expression de la sexualité) --> autoincompatibilité

superposition possible de la sexualité et de 

l’hétérothallisme 

reproduction sexuée avec passage de la trophophase à 

l’idiophase déclenchés par un stress : appauvrissement en 

nutriments, baisse de la T° ou de l’humidité 

3 phases avec fécondation en 2 temps : 

- fusion des cytoplasmes = plasmogamie 

- fusion des noyaux haploïdes = caryogamie 

--> souvent retardée de quelques heures (Zygomycètes) 

à plusieurs années (Basidiomycètes) --> dicaryon, dicaryon les 2 noyaux 

haploïdes continuant à se diviser simultanément --> mycelium 

secondaire = mycelium dicaryotique 

--> stade zygote = spore spécialisée (zygospore, 

ascospore ou basidiospore) 

- méiose zygotique 

--> très rapprochée de la caryogamie 

--> mycelium primaire haploïde 

--> cycle de développement haplophasique

c- Parasexualité 

fusions asexuelles entre des myceliums d ’individus 

différents ou à l ’intérieur d ’un même mycelium 

--> hétérocaryons = articles plurinucléés à mitoses 

non synchrones, avec cohabitation possible de noyaux 

haploïdes, diploïdes et aneuploïdes et recombinaisons 

possibles au moment de la mitose 

= réassortiments chromosomiques asexuels 

concerne surtout les Deutéromycètes

LES CHYTRIDIOMYCÈTES 

Champignons essentiellement aquatiques (790 

espèces), uni- ou multicellulaires, coenocytiques 

Position systématique encore incertaine 

--> anciennement Phycomycètes ou Mastigomycota 

--> actuellement considérés comme des Eumycètes 

primitifs (proches de leur ancêtre : un protiste flagellé)

Thalle à développement restreint, souvent 

endocellulaire, sans siphon typique, ancré par des 

rhizomorphes 

Multiplication asexuée dominante assurée par 

des planospores (ou zoospores) uniflagellées, 

produites dans des sporocystes 

Reproduction sexuée assurée par des 

planogamètes uniflagellés formés dans des 

gamétocystes 

CLASSIFICATION - IMPORTANCE 

Chytridiales 

espèces parasites d’algues, protozoaires, 

oomycètes, plantes, etc. 

- Olpidium brassicae = agent de la brûlure du chou 

- Synchytrium endobioticum = agent de la galle verruqueuse de 

la pomme de terre 

- Physoderma maydis = taches brunes du maïs 

- Physoderma alfalfae = tumeurs marbrées de la luzerne

Blastocladiales 

espèces saprophytes à cycle de développement 

complexe 

- Allomyces javanicus : modèle largement étudiée en laboratoire 

Monoblépharidales 

espèces saprophytes à planogamètes différenciés 

(oosphère unique ayant perdu son flagelle)

LES ZYGOMYCÈTES 

I. CARACTÈRES GÉNÉRAUX 

II. EXEMPLE DES MUCORALES 

III. AUTRES ORDRES 

IV. IMPORTANCE DES ZYGOMYCÈTES


Zygomycètes = eumycètes inclus dans la lignée des 

Zygomycota, avec les Trichomycètes 

champignons microscopiques, souvent saprotrophes 

mais parfois parasites, à thalle siphoné 

reproduction sexuée assurée par une zygospore 

environ 1 060 espèces connues 

II. EXEMPLE DES MUCORALES 

1- Mycelium 

- Mycelium fortement ramifié, se différenciant localement en 

rhizoïdes qui s’enfoncent dans le substrat 

- Propagation à la surface du substrat grâce à des « stolons » 

- Siphons à paroi mince et à vacuole centrale importante, 

rejetant les noyaux à la périphérie 

- Les régions âgées du mycelium présentent un début de 

cloisonnement qui les isole des plus récentes 

--> chez certaines espèces : épaississement des parois : 

chlamydospores

2- Multiplication asexuée 

sur les filaments rampants : différenciation d ’axes dressés 

à parois épaisses (= sporocystophores) sporocystophores à l’extrémité 

desquels se forme un sporocyste 

le sporocyste présente une fine paroi incrustée de cristaux 

en aiguilles. L’intérieur contient de très nombreuses spores 

haploïdes plurinuclées, qui seront libérées par gélification de 

la paroi du sporocyste. 

Sporocyste 

Sporocystophore 

Siphon coenocytique 

Rhizoïdes 

Spore 

3- Reproduction sexuée 

rare dans la nature ; apparaît dans un milieu pauvre en 

éléments nutritifs 

hétérothallisme obligatoire (2 spores à polarités 

compatibles), pas de différenciation de gamètes 

induite par des substance chimiques à rôle hormonal 

= gamones (ex: acide trisporique), émises par le mycelium 

aboutit à la formation d ’une zygospore capable 

d ’entrer en vie ralentie. A la germination : méiose et 

libération de spores haploïdes.

plusieurs étapes : 

- rapprochement de 2 filaments qui entrent en contact 

par leurs extrémités 

- isolement des parties terminales, grâce à une cloison, 

qui jouent le rôle de gamétocystes plurinucléés 

- fusion des gamétocystes (plasmogamie 

plasmogamie) : formation 

d’un coenozygote à 2 noyaux haploïdes (stade stade dicaryotique) 

dicaryotique 

- divisions des noyaux dont certains dégénèrent, puis 

caryogamie et formation de la zygospore à noyaux diploïdes 

Cycle majoritairement haploïde

III. AUTRES ORDRES 

Endogonales 

Espèces primitives endomycorhiziennes 

Entomophthorales 

Espèces parasites d’algues et d’animaux, parfois de 

l’homme 

IV. IMPORTANCE DES ZYGOMYCÈTES 

 

Moisissures 

- Mucorales = moisissures très répandues dans 

l’environnement, saprotrophes des déchets organiques 

(humification, pourriture et altération des produits 

alimentaires, etc.) ;

champignons parasites agents de mycoses humaines 

- Mucor 

- Entomophthora coronata, Basidiobolus haptosporus 

--> basidiobolomycose (maladie de l ’hommehippopotame) 

; rhinoentomophthoromycose 

Applications industrielles 

espèces riches en enzymes capables de dégrader 

l’amidon en anaérobiose 

--> utilisation en industrie de la fermentation : 

fabrication d ’alcool de grains (riz), de tubercules (pomme de 

terre) 

--> utilisation occasionnelle dans la fabrication de 

whiskies, vodkas, schnaps, etc. 

espèces utilisées en industrie pour la production 

d ’acides aminés (Mucor glutamicus), d ’acide lactique 

(Rhizopus oryzae), de présure (Mucor miehei), de vitamine A 

(Blakeslea trispora), pour la bioconversion de stéroïdes

espèces utilisées dans la confection de certains 

aliments : affinage de fromages (Cantal et Mucor fuscus), 

préparation du tempeh à partir de galettes de soja, etc. 

Lutte biologique 

Entomophthora conglomerata, E. tetrasperma = 

parasites de moustiques et de chenilles

LES ASCOMYCÈTES 


II. APPAREIL VÉGÉTATIF 

III. REPRODUCTION SEXUÉE 

IV. MULTIPLICATION ASEXUÉE 

V. CLASSIFICATION


Caractéristique fondamentale : différenciation de 

sporocystes spécialisés au cours de la reproduction 

sexuée = asque, asque produisant des ascospores 

Champignons moyennement évolués (32 000 sp) : 

- multiplication asexuée dominante (sauf en fin de phylum) 

- nombreuses formes imparfaites (= anamorphes --> 

Deutéromycètes) 

- majorité de micromycètes 

- sporophore (= ascome) ascome contenant les asques uniquement chez 

les plus évolués 

- nombreux caractères algaux (fécondation !) 

II. CARACTÈRES VÉGÉTATIFS 

Hyphes cloisonnées 

--> parois plus minces, pression intravacuolaire plus élevée 

Cloisons (= septums) septums se mettant en place 

indépendamment de la division des noyaux, de la périphérie 

vers le centre, laissant un pore central (ø = 300-400 nm) 

--> permet le passage de cytosol, mitochondries, petits noyaux 

--> pas de véritable structure cellulaire 

Obturation des pores par des bouchons de glucanes dans 

les parties âgées du mycelium (qui disparaissent 

progressivement) 

--> individualisation d’articles articles

Différenciation du mycelium en pseudo-tissus 

pseudo tissus 

(champignons supérieurs !) : 

- stromas = articles devenant globuleux, à 

plectenchyme 

- sclérotes = organes de résistance à paroi dure et 

imperméable, colorés par des anthocyanes 

- rhizomorphes = cordons mycéliens à hyphes 

spécialisées dans le transfert de liquide 

- sporophores et appareils conidiogènes 

III. REPRODUCTION SEXUÉE 

Chez les espèces primitives : individualisation de 

gamètes mâles = spermaties, spermaties captés par un filament capteur 

(= trichogyne) trichogyne surmontant les gamétocystes femelles 

Chez la plupart des espèces : fusion du trichogyne avec 

le spermatocyste = trichogamie ; passage direct des noyaux 

mâles dans le gamétocyste femelle

par regression : les noyaux du gamétocyste femelle 

s’apparient en dicaryons = autogamie ou parthénogénèse ; 

le spermatocyste conserve un rôle trophique (= trophogone) 

trophogone 

et disparaît complètement (ex: Penicillium) 

par surévolution : plus de formation d’organes sexuels 

ni de sexualité ; reproduction sexuée limitée à la fusion de 2 

filaments haploïdes issus de spores distinctes 

(hétérothallisme) en un filament dicayotique = perittogamie 

exemple d ’une espèce homothallique : 

1) germination d’une ascospore --> fins filaments + 

primordium des sporophores groupés en rosettes ; chaque 

rosette comprend : 

- des filaments basaux 

- des gamétocystes femelles (= ascogones) ascogones coiffés chacun d’un 

trichogyne 

- des gamétocystes mâles (= spermatocystes) 

spermatocystes 

2) accolement du spermatocyste au trichogyne et 

injection des noyaux fécondants mâles ; résorption de la 

cloison entre trichogyne et ascogone --> plasmogamie

3) rapprochement sans fusion des noyaux mâles et 

femelles --> dicaryons 

4) mitoses successives --> zygote plurinucléé 

dicaryotique = coenozygote 

5) après une phase de maturation : germination du 

coenozygote, qui émet des filaments à l’intérieur desquels 

migrent les dicaryons ; 

simultanément : multiplication des hyphes haploïdes 

du pied de l’ascogone --> filaments à rôle nutritifs (= 

paraphyses) paraphyses + enveloppe protectrice (= ascothèque) 

ascothèque 

6) à l’intérieur de l’ascothèque : allongement des 

filaments et mitoses conjuguées des dicaryons --> hyphes 

dicaryotiques, selon un mécanisme complexe faisant intervenir 

des hyphes à crochets = hyphes dangeardiennes ou 

dangeardies 

7) l’extrémité de certaines dangeardies devient une 

cellule ascogène où les 2 noyaux fusionnent (caryogamie caryogamie) ; la 

cellule diploïde résultante s’alonge en asque terminal 

8) méiose et mitoses --> 8 noyaux haploïdes, qui 

s’entourent de cytoplasme puis d ’une paroi --> 8 ascospores

9) apparition d ’une valve en clapet au sommet de 

l ’asque = opercule 

10) à maturité : brusque augmentation de la pression 

osmotique du cytosol (hydrolyse du glycogène !) --> 

expulsion des ascospores par l’opercule 

à maturité le sporophore ou ascome inclut : 

- l’ascothèque (n) = enveloppe externe de nature 

stromatique, souvent en forme de coupe 

- les hyphes ascogènes (n+n) surmontées des asques 

(2n) entre lesquelles sont insérées les paraphyses (n), 

l ’ensemble formant l’hymenium hymenium

IV. MULTIPLICATION ASEXUÉE 

reste dominante par rapport à la reproduction sexuée sauf 

en fin de phylum ; parfois seule forme de multiplication 

existante (anamorphes 

anamorphes --> Deutéromycètes) 

réalisée par des spores uninuclées (= conidies) conidies issues du 

bourgeonnement illimité de sporocystes spécialisés (= 

phialides), phialides souvent groupées à l’extrémité d’un pédoncule 

(= conidiophore) 

conidiophore 

par régression : simple bourgeonnement de cellules du 

thalle --> blastospores (ex: levures) 

parfois fragmentation du mycelium en articles à parois 

épaisses = chlamydospores, chlamydospores arthrospores, arthrospores etc. 

grande diversité des appareils conidiogènes : 

- directement insérés sur le mycelium --> mucédies 

(moisissures +++, ex: Penicillium) 

- insérés sur un stroma +/- épais , localisé sous un 

épiderme ou une écorce --> acervules et sporodochies 

(phytopathogènes +++, ex: Nectria) 

- érigés en faisceaux --> corémies et synémies 

(ex: Aspergillus) 

- entouré d’une épaisse enveloppe stromatique en 

forme d ’urne ou de bouteilles --> pycnide 

(ex: Black rot)

V. CLASSIFICATION 

PLECTOMYCÈTES 

LABOULBÉNIOMYCÈTES 

HYMÉNOASCOMYCÈTES 

Trichogamie 

HÉMIASCOMYCÈTES 

Asques ordonnées 

en hyménium 

Perte du sporophore 

Thalle à structure cladomienne ; reproduction par 

Gamètes ; espèces parasites d’arthropodes 

? 

?

LES 

ACARPOASCOMYCÈTES 


II. ENDOMYCÉTALES 

III. TAPHRINALES


Acarpoascomycètes (= Hémiascomycètes) : 

champignons longtemps considérés comme 

Ascomycètes archaïques, mais plutôt évolution régressive à 

partir des Pézizales (Hyménoascomycètes) en s’adaptant à 

des conditions de vie particulière (parasitisme +++) 

Ascomycota dépourvus de sporophore : asques disposés 

au hasard sur le mycelium 

libération des ascospores par déchirure ou résorption des 

parois = « asques évanescentes » 

2 ordres : Endomycétales et Taphrinales 

II. ENDOMYCÉTALES 

champignons vivant en saprophytes dans les jus sucrés et 

à la surface des fruits 

filaments mycéliens tendant à se désarticuler en 

arthrospores ou à se multiplier par bourgeonnement en 

« levures » (milieu liquide +++) 

reproduction sexuée : ascogone rudimentaire sans 

trichogyne et spermatocyste distincts ou non

2 familles importantes : 

III. TAPHRINALES 

Exoascacées 

--> champignons parasites des végétaux 

supérieurs, induisant des déformations et des hypertrophies 

Saccharomycétacées 

--> champignons levuriformes saprophytes 

1- EXOASCACÉES 

à l ’état saprophyte : simples cellules levuriformes 

capables de fusionner --> zygote = levure à dicaryon 

infestation d’un hôte nécessaire au développement du 

zygote : filament mycélien dicaryotique se propageant dans 

le parenchyme (--> hyperplasie des cellules végétales) et 

produisant des asques à 4+4 ascospores sous la cuticule 

(hétérothallisme)

exemples : 

- Exoascus deformans (= Taphrina deformans) 

--> agent de la « cloque du pêcher » 

- Taphrina pruni 

--> agent de la « pochette du prunier » 

- Taphrina cerasi 

--> provoque les « balais de sorcière » sur les cerisiers 

2- SACCHAROMYCÉTACÉES 

famille de la plupart des levures (du latin levare, rendre 

léger), probablement polyphylétique 

présentes en hiver dans le sol (vie ralentie) ; dispersées 

par le vent et les insectes en été 

thalle globuleux unicellulaire de 4-6 x 5-8 µm se 

multipliant continuellement par bourgeonnement (= 

blastospores, blastospores de taille très variable), pouvant former des 

chapelets 

en milieu pauvre : arrêt du bourgeonnement et apparition 

d’asques contenant jusqu ’à 4 ascospores

si reproduction sexuée inconnue : levures anascosporées 

(--> Deutéromycètes) 

Ex : Candida kefyr = forme imparfaite de Kluyveromyces marxianus 

champignons capables de métaboliser des sucres en 

alcool et CO2 en anaérobiose (fermentation 

fermentation) 

au niveau nucléaire : 50 à 100 exemplaires d’un ADN 

circulaire de 2 µm (analogue au plasmide bactérien), capable 

d ’incorporer des fragments de gène de 400 kb et + ; 16 

chromosomes entièrement séquencés (1 er eucaryote !)

Importance des levures : 

1) Agents de fermentation 

- brassage de la bière : Saccharomyces cerevisiae, S. 

carlsbergensis 

- vinification : S. ellipsoideus et S. pasteurianus 

- obtention du cidre : S. apiculatus 

- panification : S. cerevisiae, S. minor 

- fabrication du vinaigre : Mycoderma aceti 

--> levure aérobie transformant l’alcool en acide 

acétique, puis en eau + CO2 - obtention du cacao, du thé, du café, etc. : Saccharomyces 

spp., Hansenula spp., Pichia spp. 

- laits fermentés (kéfir, leben…) : levures + bactéries 

(streptocoques et Bacillus caucasicus) 

2) Obtention de protéines à partir de dérivés du pétrole, du petit lait, 

des résidus des industries sucrière et papetière : Saccharomyces spp., 

Candida spp., Torula spp., Hansenula spp. 

3) Génie génétique 

NB : génome de Saccharomyces cerevisiae entièrement 

séquencé 

--> obtention de gènes artificiels utilisés pour séquencer le 

génome humain 

--> fabrication d’un vaccin anti-hépatite B, d’insuline 

4) Thérapeutique 

Traitement adjuvant préventif ou curatif des complications de 

l’antibiothérapie : Saccharomyces boulardi (Ultra-levure®)

LES PLECTOMYCÈTES 


II. EUROTIALES 

III. ONYGÉNALES 

III. OPHIOSTOMATALES


Sporophores sphériques réduits à un lacis 

d’hyphes ou présentant une paroi différenciée mais 

sans ouverture (= cléistothèces) 

cléistothèces 

Asques rudimentaires disposées de manière 

anarchique dans le cléistothèce (= cléistothèce 

plectasé) plectasé et se désagrégeant à maturité pour libérer 

les ascospores 

II. EUROTIALES 

1 famille majeure : Eurotiacées (= Aspergillacées) : 

--> moisissures extrêmement communes sur les substrats 

organiques les plus variés 

reproduction sexuée exceptionnelle : nombreuses 

anamorphes (ex: genres Aspergillus et Penicillium = formes 

imparfaites, conidiennes, du genre Eurotium) 

champignons essentiellement saprotrophes, parfois 

parasites (10 Aspergillus sur les 300 connus) 

important arsenal enzymatique

eproduction sexuée par autogamie, autogamie mais avec 

suppression du stade des hyphes dangeardiennes 

(cloisonnement puis fécondation par caryogamie) ; 

persistance d’un trophogone chez certaines espèces 

multiplication asexuée dominante : production de 

nombreux filaments conidiogènes dressés à partir du 

mycelium rampant. Appareil conidiogène évolué : 

production de conidies à partir des phialides, phialides issues du 

bourgeonnement d’articles intermédiaires = métules 

--> critères d’identification des espèces 

importance : 

1) Affinage de certains fromages 

--> transformation du lactose du lait en lactate + 

caséine (précipitée par la présure --> « caillé »), puis de la 

caséine en peptones, favorisant le développement des 

bactéries responsables du bouquet du fromage 

- roquefort : Penicillium roqueforti 

- bleus (bleu d’Auvergne, Gorgonzola…) : Penicillium glaucum 

- camemberts : Penicillium caseicolum

2) Confection de certains produits alimentaires 

- pâte soy (miso) : fermentation du soja par Aspergillus oryzae 

- sauce soy : fermentation du soja par Aspergillus oryzae, A. 

soyae et différentes bactéries lactiques 

- saké : brassage initial avec Aspergillus oryzae 

3) Production industrielle de certains composés : 

- acide citrique (E330) : Aspergillus niger, Penicillium 

citrinum et div. sp. 

- acides gluconique, oxalique, fumarique, gallique : 

Aspergillus niger 

- dextranes : Penicillium lilacinum 

- amylases : Aspergillus niger 

- pénicilline G : Penicillium notatum (1943) 

- griséofulvine : Penicillium griseofulvum 

- urate oxydase : Aspergillus flavus

4) Industrie textile : 

- Trichoderma spp. (enzymes dégradant la cellulose) 

--> jeans « délavés » 

--> lessives et détergents 

5) Agents de pourriture : 

- pourritures « verte » et « bleue » des agrumes : Penicillium 

digitatum et P. italicum

6) Agents de mycoses humaines : 

- aspergilloses (poumon +++, œil, sphère ORL) : Aspergillus 

fumigatus, A. flavus, A. niger, A. nidulans 

7) Agents de mycotoxicoses : 

--> intoxications alimentaires provoquées par des 

aliments dans lesquels des micromycètes ont sécrété des 

substances toxiques = mycotoxines 

- aflatoxines (plus puissant carcinogène connu !) : Aspergillus 

flavus, A. parasiticus, A. niger (arachide, céréales, etc.) 

- patuline (neurotoxine) : Penicillium expansum, Aspergillus 

clavatus 

- toxine T-2 (trichothécènes) : agent de l ’Aleucie toxique 

alimentaire (ATA) : Fusarium tricinctum, F. sporotrichioides

III. ONYGÉNALES 

champignons vivant sur les tissus riches en kératine 

(peau et phanères) = dermatophytes 

reproduction sexuée exceptionnelle 

2 modes de vie différents : 

- champignons saprotrophes commensaux des plumes 

d’oiseaux vivants ou morts (genres Ctenomyces et 

Gymnoascus) 

- champignons parasites de l’homme et des 

mammifères, agents des teignes et des dermatophyties 

(genres Trichophyton, Microsporum et Epidermophyton) 

Teignes : mycoses en régression (sauf teigne de l’enfant : 

chats +++) : Microsporum canis, Trichophyton tonsurans, T. 

violaceum, T. mentagrophytes 

Onychomycoses : mycoses fréquentes

Dermatophyties : mycoses en extension 

- Trichophyton rubrum, T. mentagrophytes et 

Epidermophyton floccosum 

--> agents de l’herpès circiné, des intertrigos (ex: pied 

d’athlète), du kérion de Celse 

Histoplasmose américaine (Histoplasma capsulatum) 

--> infection opportuniste au cours du SIDA +++ 

NB: à l’état parasitaire, aspect levuriforme = champignon 

dimorphique

Remarque : la reproduction sexuée étant exceptionnelle, beaucoup 

d ’Acarpoascomycètes parasites sont connues sous leur anamorphes (- 

-> Deutéromycètes), d’où une double dénomination, par exemple : 

Anamorphe Téléomorphe 

Trichophyton sp. Arthroderma sp. 

Microsporum sp. Nannizia sp. 

Histoplasma sp. Emmonsiella sp. 

IV. OPHIOSTOMATALES 

Ophiostoma ulmi (anamorphe = Ceratocystis ulmi) - 

famille des Ophiostomatacées 

--> agent de la graphiose de l’Orme (« maladie hollandaise 

des Ormes ») = gommose vasculaire responsable de la 

régression/disparition de plusieurs espèces du genre Ulmus au stade 

adulte en Europe occidentale

LES 

HYMÉNOASCOMYCÈTES 


II. ÉRYSIPHOMYCÉTIDÉES 

III. LOCULOASCOMYCÉTIDÉES 

IV. PYRÉNOMYCÉTIDÉES 

V. PÉZIZOMYCÉTIDÉES 

VI. LÉCANORAMYCÉTIDÉES


Ascomycota dont les asques sont ordonnés en 

hyménium 

Paroi de l’asque initialement formée de 2 feuillets 

= asque bituniqué) bituniqué : 

- endoascus, endoascus interne et hydrophile 

- exoascus, exoascus externe et hydrophobe 

… qui évolue vers un asque unituniqué par 

fusion des 2 feuillets 

parallèlement, évolution du mode de déhiscence : 

- chez les asques bituniqués : appareil apical en 

forme de nasse (réseau chitineux) --> type nassascé 

complété chez les espèces lichénisantes par un 

système d ’anneaux --> type archaeascé 

- chez les asques unituniqués : appareil apical 

en forme d’anneau (sphincter) --> type annelascé 

qui devient un opercule chez les espèces les 

plus évoluées --> type operculé

II. ÉRYSIPHOMYCÉTIDÉES 

1 seul ordre d’espèces ectoparasites : Erysiphales 

sporophores noirs et ornementés de type cléistothèce, cléistothèce à 

structure simplifiée (parfois 1 seul asque) et à hyménium 

dépourvu de paraphyses, possédant des appendices (= 

fulcres) fulcres 

asque dépourvus d’appareil apical, contenant 2 ascospores 

multiplication asexuée dominante ; conidies réduites à des 

phialides atypiques 

mycelium émettant de courts suçoirs dans les cellules 

épidermiques de l ’hôte 

importance : champignons phytopathogènes agents 

des oïdiums ou « blancs » 

Exemple : Oïdium de la vigne (Uncinula necator) 

champignon parasite obligatoire introduit sous sa forme imparfaite 

de Californie en France au XIXe s 

ectoparasite dont le mycelium forme un feutrage blanchâtre à odeur 

de moisi sur les feuilles (2 faces !), rameaux et grains de raisin, 

induisant des troubles de la croissance (épiderme +++) 

passe l ’hiver sous forme de chlamydospores sur les rameaux

III. LOCULOASCOMYCÉTIDÉES 

sporophore : urnes ou bouteilles ouvertes à leur sommet par 

un ostiole = périthèces 

sporophore provenant du seul écartement des filaments 

mycéliens haploïdes du thalle associés en un stroma, stroma créant de 

petites logettes = locules 

--> sporophore ascoloculaire 

asques bituniqués 

principaux ordres : Dothidéales, Pléosporales, Myrangiales 

importance : nombreux parasites de végétaux 

supérieurs 

- tavelure du pommier (T: Venturia inaequalis, A: Spilocaea 

dentritica) 

- tavelure du poirier (T: Venturia pirina, A: Fusicladium 

virescens) 

- black-rot de la vigne (T: Guignardia bidwellii) 

- pourriture des fruits (T: Pleospora herbarum, A: 

Stemphylium botryosum)

IV. PYRÉNOMYCÉTIDÉES 

Sous-classe la plus importante des Ascomycota, pour la 

plupart parasites de végétaux supérieurs 

sporophore = périthèce (stroma) à ascothèque et à 

paraphyses (hyphes haploïdes se différenciant en même 

temps que les asques, l’ensemble formant l’hyménium) 

--> sporophore ascohyménial 

asques unituniqués 

multiplication asexuée dominante (parfois exclusive --> 

Deutéromycètes) grâce à des conidies 

1. Hypocréales (=Nectriales) 

champignons parasites de végétaux, induisant une 

prolifération cellulaire et une nécrose locale (« chancres ») 

exemples : 

- Nectria galligena : agent 

de chancres 

- Hypomyces perniciosus : agent de la môle 

du champignon de couche 

- Gibberella fujikuroi : agent du bakanae (gibbérelline !)

2. Sordariales 

champignons saprotrophes de l’humus et du fumier 

exemples : 

- Neurospora crassa et Neurospora tetrasperma : modèle 

largement utilisé en génétique moléculaire 

3. Xylariales 

2 types de champignons : 

- macromycètes saprotrophes très communs sur les bois 

morts 

exemples : Xylaria 

- micromycètes parasites agents des « pourridiés » ou 

«blancs» 

exemple : Rosellinia necatrix : agent du pourridié des racines d’arbres fruitiers (pêcher, 

prunier, vigne, etc.)

4. Clavicipitales 

champignons parasites de Poacées et de Cypéracées 

exemple : l’ergot de seigle, Claviceps purpurea 

(Clavicipitacées) 

- infestation au printemps par les ascospores : 

germination et émission d ’un filament mycélien attaquant les 

jeunes ovaires du seigle, 

- les ovaires s’entourent d’une couche stromatique 

portant des conidiophores et exsudent un liquide sucré 

visqueux contenant beaucoup de conidies (insectes !) 

--> « miellée » du seigle 

- à l’intérieur de l’ovaire : 

condensation du mycelium en 

sclérote (= ergot), qui finit par se 

séparer et tomber de l ’épi 

- au printemps suivant : 

germination du sclérote, qui émet 

des masses stromatiques rougespourpres 

pédicellées contenant de 

nombreux périthèces, à l’intérieur 

desquels se forment les asques et 

les ascospores 

- à maturité : libération des 

ascospores

sclérote riche en substances de nature indolique, 

pharmacologiquement actives : ergotamine, ergométrine… 

--> utilisées en thérapeutique comme vasoconstricteurs 

--> à l’origine d ’intoxications au Moyen Âge : « mal 

des ardents » ou « feu de Saint-Antoine » = ergotisme 

espèces voisines : Cordiceps spp., parasites des insectes 

--> produise une substance antibiotique : la cordycépine 

V. PÉZIZOMYCÉTIDÉES 

= Discomycètes : clade le plus évolué des Ascomycota : 

environ 1000 espèces, pour la plupart saprotrophes 

sporophores en forme de coupe = apothécies, apothécies qui 

possèdent leur propre paroi (= ascothèque), ascothèque parfois réduite à 

une marge (= parathecium) parathecium entourant l ’hyménium 

apothécies regroupées sur des stromas très développés pour 

former des sporophores (= ascomes) ascomes de la taille de ceux des 

Basidiomycètes, sessiles ou portées par un stipe 

asques unituniqués

1. LÉOTIALES 

= Discomycètes inoperculés 

apothécies de petite taille 

champignons saprotrophes (feuilles mortes, bois mort) ou 

parasites (végétaux) 

Ordre complexe comprenant plusieurs familles

Exemples : 

- Rhytisma acerinum (Hypodermatacées) 

--> parasite des feuilles d’érable 

- Chlorociboria aeruginescens (Dermatéacées) 

--> synthétise un pigment vert qui diffuse dans les bois morts, 

jadis utilisé en marquetterie 

- Stromatinia fructigena (Léotiacées ; anamorphe : Monilia fructigena) 

--> agent de la moniliose des arbres fruitiers 

- Sclerotinia fuckeliana (Léotiacées) : agent du Botrytis de la vigne 

capable d’induire 2 types d’atteintes : 

- sur grains de raisin mûrs : « pourriture noble » 

--> le mycelium ne pénètre pas dans le grain ; la pulpe se 

concentre et le jus est plus sucré, à l’origine de vins liquoreux (ex: 

Sauternes) 

- sur grains non mûrs : « pourriture grise » 

--> le mycelium pénètre dans le grain et en épuise les 

réserves glucidiques, rendant le raisin inutilisable

2. PÉZIZALES 

= Discomycètes operculés : apothécies développées, 

isolées chez les espèces les plus primitives, puis regroupées en 

hymenium externe et portées par un stroma volumineux chez 

les plus évolués 

asques operculées 

importance : 

- plusieurs espèces comestibles réputées : Morschella spp., 

Aleuria aurantia, Peziza spp., Otidea onotica… 

- plusieurs espèces toxiques : Helvella spp., Gyromitra esculenta

3. TUBÉRALES 

champignons saprotrophes ou mycorhiziens, adaptés à un 

mode de vie hypogée : enveloppe externe (= peridium) peridium 

entourant le tissu fertile interne (= gleba) gleba 

disparition de la multiplication asexuée ; reproduction 

sexuée exclusive 

pas de différenciation d’organe sexuel : fécondation par 

simple fusion de filaments mycéliens haploïdes, comme chez 

les Basidiomycètes = perittogamie 

importance : 

- truffes (Tuber spp.) : intérêt culinaire et économique 

Tuber melanosporum

VI. LÉCANORAMYCÉTIDÉES 

asques à déhiscence primitive de type archaeascé 

classe regroupant la grande majorité des espèces 

lichénisées (Lécanorales, Peltigérales, Pertusariales, 

Téloschistales) 

importance 

- Cetraria islandica : utilisé en thérapeutique dans les 

affections ORL et comme antidiabètique (Suède) 

- Acide usnique (genres Usnea, Cetraria, Evernia, Alectoria) : 

antiseptique externe 

- plusieurs composés à activité antitumorale et anti-VIH en 

cours d’évaluation

- lichens à orseille (Ochrolechia spp., Pertusaria dealbata, 

Roccella spp.) : teinture rouge 

- Pseudevernia furfuracea et Evernia prunastri : utilisé en 

parfumerie (absolu « mousse de chêne » : odeur de fond boisé) ; 8 000 

à 9 000 t récoltées chaque année (Yougoslavie, France, Maroc) 

- « mousse d ’Islande » (Cetraria islandica) : utilisé comme 

aliment, en farine ou en bouillie (Laponie) ou en diététique pour la 

confection d’un pain pour diabétiques (Europe) 

- Rhizoplaca esculenta : Manne providentielle ! 

- « tripes de roches » (Umbilicaria spp.) : consommées au 

Japon (« Watakes ») crues en salade ou cuites dans la graisse

- bioindication lichénique : pollutions de l’air par le SO 2

LES BASIDIOMYCÈTES 


II. CYCLE DE DÉVELOPPEMENT 

III. CLASSIFICATION


Basidiomycota = champignons les plus évolués du règne 

fongique (14 000 espèces, majoritairement des 

macromycètes à sporophore = basidiome) basidiome 

caractéristique fondamentale : sporocyste spécialisé (= 

baside) baside donnant naissance à des spores exogènes (= 

basidiospores), basidiospores à l’extrémité de filaments courts (= 

stérigmates) 

stérigmates 

à maturité : libération des basidiospores enveloppées par 

un fragment de la paroi de la baside 

multiplication asexuée quasi absente : formation de 

conidies haploïdes sur le mycelium I aire 

Mycelium II aire dicaryotique prépondérant : le stade 

diploïde devient dominant 

Perfectionnement des pores des cloisons : orifice réduit par 

un anneau protéique, pouvant être obturé par des nappes de 

réticulum endoplasmique (= parenthèsomes) 

parenthèsomes 

= dolipores

II. CYCLE DE DÉVELOPPEMENT 

Plus de différenciation d ’organes sexuels (sauf 

chez les Urédinales = micromycètes archaïques à spermaties) 

--> périttogamie 

hétérothallisme constant (90% des espèces), bi- 

(1 couple d’allèles --> 50% de taux de fécondation) 

ou tétrapolaire (2 couple d’allèles --> 25% de taux de 

fécondation, mais nombreuses exceptions !) 

Parasexualité = possibilité de fusions asexuelles 

entre un filament dicaryotique et : 

- un jeune mycelium haploïde (basidiospore) 

- une conidie 

- un autre filament dicaryotique 

--> nouveau dicaryon par dégénérescence du ou des 

noyaux surnuméraires, dans le sens du plus fort degré 

d ’hétérozygotie totale

Une seule plasmogamie est à l’origine de 

plusieurs (dizaines de) générations de sporophores (≠ 

Ascomycota) 

le premier sporophore est généralement produit 

plusieurs années après la plasmogamie, le mycelium 

devant d’abord entrer en symbiose (mycorhization 

mycorhization) 

le mycelium secondaire issu de la périttogamie 

devient indépendant des myceliums primaires (≠ 

Ascomycota) et pérennant (sauf chez quelques 

espèces saprotrophes coprophiles), d ’une durée de 

vie de plusieurs années à plusieurs siècles 

Sporophore entièrement formés de mycelium II aire , 

capable de produire de 10 à 20 milliards de 

basidiospores de petite taille (quelques µm)

Simplification des hyphes dangeardiennes : 

formation d’articles plurinucléés, dépourvus d ’anses 

latérales (ou à anses non fonctionnelles) par manque 

de synchronisation entre mitoses et cloisonnement 

--> état binucléé réalisé tardivement, parfois 

juste avant la formation des basides

III. CLASSIFICATION 

TÉLIOMYCÈTES 

Basides cloisonnées 

PHRAGMOBASIDIOMYCÈTES 

HOMOBASIDIOMYCÈTES 

Perte des cloisons des basides 

Acquisition de sporophores, mode de vie libre 

Absence de sporophore, mode de vie parasite

LES TÉLIOMYCÈTES 


II. URÉDINALES 

III. USTILAGINALES


champignons parasites des végétaux supérieurs 

baside cloisonnée transversalement issue d’une cellule 

diploïde ne produisant pas de spore, capable de se disséminer 

= probaside 

--> en conditions favorables, la probaside dispersée 

peut germer et produire 4 basidiospores capables de se 

disséminer à leur tour 

absence de sporophore 

2 ordres : 

- Urédinales --> « rouilles » 

- Ustilaginales --> « charbons » et « caries » 

II. URÉDINALES 

champignons parasites obligatoires des végétaux, agents 

des rouilles (4 000 espèces réparties en 6 familles, dont la 

plus importante : Pucciniacées) 

Pucciniacées 

Probasides regroupées par 2, 3 ou n = téleutospore, 

téleutospore 

pluricellulaire 

champignons très anciens (Carbonifère) au cycle de 

développement très complexe : 

- intervention de 1 (parasite monoxène) ou plusieurs (p. 

hétéroxène) hôtes 

- mise en jeu de plusieurs types de spores

exemple : Puccinia graminis, agent de la rouille du blé 

- germination d’une basidiospore sur l’épine-vinette (Berberis 

vulgaris), qui émet un filament mycélien traversant l’épiderme pour se 

développer dans les espaces intercellulaires (endoparasitisme 

endoparasitisme) et 

émettre des suçoirs dans les cellules = mycelium I aire haploïde 

- extériorisation d ’appareils : 

• à la face supérieure des 

feuilles, des pycnides qui exsudent 

un liquide sucré (insectes !), 

comprenant des filaments grêles 

allongés (= trichogynes) trichogynes et des 

filaments courts à extrémité 

bourgeonnant en spermaties 

• à la face inférieure des 

feuilles, des proécies, proécies en forme de 

gros conceptacles, d’abord clos 

puis largement ouverts,comprenant 

une assise de cellules nourricières 

entourant les cellules qui seront à 

l’origine, après dicaryotisation, des 

écidiospores 

aire haploïde

- dispersion des spermaties (insectes !) vers des trichogynes de signe 

différent (hétérothallisme !) --> transport des noyaux jusqu’au niveau 

de cellules reproductrices situées à la base des proécies, puis formation 

de dicaryons 

- à la face inférieure des feuilles : formation d ’hyphes dangeardiennes 

simplifiées --> multiplication d’articles à dicaryons et différenciation 

d’1 article sur 2 en écidiospore, l’autre se différenciant en disjoncteur 

--> transformation des proécies en ecidies ou écies, écies qui 

contiennent à l’intérieur d’une enveloppe blanchâtre de très 

nombreuses écidiospores jaunes (caroténoïdes !) 

- libération des écidiospores par gélification des cellules disjonctrices 

et dispersion par le vent 

- germination d’écidiospores sur les feuilles du blé en été : émission d’un 

filament mycélien pénétrant par un stomate et se développant dans les 

espaces intercellulaires (endoparasitisme 

endoparasitisme) en émettant des suçoirs dans 

les cellules = mycelium II aire diploïde (dicaryons dicaryons) 

- en été : extériorisation de filaments par l’épiderme( = urédies), urédies 

produisant, par bourgeonnement, des urédospores brunes asexuées 

contenant chacune un dicaryon, dispersées par le vent

- à l’automne : production des urédospores remplacée par celle de 

téleutospores noires sexuées, comprenant après fusion des dicaryons, 2 

probasides superposées 

- dispersion des téleutospores par le vent ; passage de l’hiver sur le sol 

- au printemps suivant : germination de la probaside qui donne une 

baside cloisonnée génératrice de basidiospores (2 spores + et 2 spores -)

III. USTILAGINALES 

champignons parasites des végétaux (500 espèces) 

accomplissant une partie de leur cycle en saprotrophes 

Mycelium I aire réduit ou nul 

absence de multiplication asexuée 

2 familles : 

- Ustilaginacées : agents des charbons 

--> charbons nus (ex: charbons du maïs, du blé, de l’avoine) 

--> charbons couverts (ex: charbon de l’orge) 

- Tillétiacées : agents des caries 

exemple : Ustilago tritici, agent du charbon du blé 

- Arrivée d’un élément infestant dicaryotique levuriforme sur le blé, 

qui émet un filament mycélien se propageant à l’intérieur des grains de 

blé en formation, sans altération visible 

--> grains en apparence sains, qui transmettent le champignon 

lors des semis l’année suivante 

- Hypertrophie des tissus de l’ovaire de certaines fleurs du blé 

--> boursouflures ou galles sur les épis mûrs 

- Eclatement des tissus 

--> libération d’innombrables probasides noires pulvérulentes, 

dispersées par le vent et les insectes

- germination de la probaside 

--> baside sans stérigmate, bourgeonnant latéralement en 

sporidies latérales, latérales qui bourgeonnent à leur tour en sporidies-levures 

sporidies levures, 

l’ensemble formant un arbuscule = thalle levuriforme haploïde 

saprotrophe 

- fusion de 2 sporidies levuriformes de signe opposé (hétérothallisme !) 

--> élément infestant à dicaryons 

exemple : Ustilago maidis

LES 

PHRAGMOBASIDIOMYCÈTES 

Basidiomycota à basides cloisonnées 

transversalement ou verticalement ou à basides 

incomplètement cloisonnées (groupe de transition 

vers les Homobasidiomycètes) 

Classe très hétérogène d’environ 500 espèces

IMPORTANCE 

en pathologie humaine : 

Cryptococcus neoformans (= anamorphe de Filobasidiella neoformans 

- Tremellales) est une levure (mycélium très régressé) vivant en 

saprotrophe dans les fientes de pigeons, agent de méningo-encéphalites 

chez les sujets immuno-déprimés (SIDA +++) 

intérêt alimentaire : 

Auricularia auricula-judae (Auriculariales), l’oreille de Judas est un 

macromycète saprotrophe du bois mort = « champignon noir chinois »

LES 

HOMOBASIDIOMYCÈTES 


II. CYCLE DE REPRODUCTION 

III. EVOLUTION DU SPOROPHORE 

IV. CLASSIFICATION - EXEMPLES


Champigons les plus évolués du règne fongique, 

tous macromycètes (10 000 espèces) 

Basides non cloisonnées, toutes semblables (= 

homobasides) 

homobasides 

II. CYCLE DE REPRODUCTION 

- germination d ’une basidiospore sur le sol, qui donne une 

vésicule plurinucléée puis émet des diverticules à l ’intérieur 

desquels migrent les noyaux 

--> ébauche d ’un mycélium haploïde cloisonné 

= mycélium primaire 

- sur les hyphes Iaires : formation d’organes de multiplication 

asexuée rudimentaires, produisant des conidies en couronne 

- dans certaines conditions : rencontre et fusion de cellules 

appartenant à des mycéliums de signes différents 

(hétérothallisme !) = périttogamie --> dicaryon

- multiplication active des cellules à dicaryon 

--> hyphes dangeardiennes (= hyphes à anses latérales) 

= mycélium secondaire 

- immédiatement après (espèces saprotrophes) ou après 

quelques semaines à plusieurs années (espèces 

mycorhiziennes) : formation de pelotes d’hyphes (= 

primordiums) primordiums qui évoluent en sporophores (= basidiomes) 

basidiomes 

- à maturité : basidiome entièrement dicaryotique comprenant 

généralement 

- un pied (= stipe) stipe avec des rhizoïdes et… 

- un chapeau (= pileus) pileus recouvert d’une cuticule, cuticule 

présentant à sa face inférieure… 

- un hyménium porté par une couche sous-hyméniale 

de plectenchyme (= hyménophore, hyménophore souvent en lames), 

incluant les basides ordonnées régulièrement et de grosses 

cellules à inclusions réfringentes (= cystides) cystides 

- maturation et libération des basidiospores, dispersées par le 

vent

III. EVOLUTION DU SPOROPHORE 

Homobasidiomycètes 

surévolués 

Homobasidiomycètes 

évolués 

Basidiomycota 

primitifs 

Sporophore dont l’endopéridium reste inclus dans 

l’exopéridium ; lames anastomosées en gleba contenant 

des basides éparses non organisées en hyménium non 

en contact avec le milieu extérieur ; spores libérées par 

dégradation du tissu sporogène 

= angiosporie (évolution régressive) 

Sporophore à chapeau (= endopéridium) endopéridium : toutes les 

parties (incl. basides) se différencient dans un « œuf », 

dont la partie la plus externe forme une enveloppe 

protectrice ou exopéridium (= voile général) général ; 

hyménium exposé à l ’air libre qu ’à maturité 

= hémiangiosporie 

Croissance hyméniale définie 

Sporophore non enveloppé : hyménium à l’air libre 

= gymnosporie 

Croissance hyméniale indéfinie

IV. CLASSIFICATION - EXEMPLES 

1- APHYLLOPHOROMYCÉTIDÉES 

= Champignons sans lame, coriace à ligneux, à 

hyménium porté par des replis du sporophore : 

Ordre des Corticiales (« croûtes ») 

--> champignons lignicoles saprotrophes ou parasites du bois, 

généralement entièrement accolés au support 

- Stereum hirsutum (Corticiacées) : destructeur des bois de 

chantier ; agent de l’apoplexie de la vigne 

- Serpula lacrymans (Corticiacées) = mérule domestique : 

redoutable saprotrophe des bois d’œuvre (pourriture cubique)

Ordre des Polyporales 

--> champignons lignicoles saprotrophes ou parasite, à 

sporophore coriace ou gélatineux, à hyménium fréquemment en tubes 

- Fomes fomentarius (Polyporacées) = amadouvier : amadou 

- Fistulina hepatica (Fistulinacées) = langue de bœuf : excellent 

comestible 

Ordre des Clavariales 

--> champignons à sporophore ramifié et à hyménium 

rudimentaire lisse 

- Clavaria spp. (Clavariacées) : comestibles jeunes (sauf C. formosa) 

- Hydnum repandum (Hydnacées) = pied de mouton : excellent 

comestible

Ordre des Cantharellales 

--> champignons à sporophore charnu 

- Cantharellus cibarius = girolle et Craterellus cornucopioides = 

trompette des morts (Cantharellacées) : excellents comestibles 

2- AGAROMYCÉTIDÉES 

= Hyménophore lamellé (sauf bolets), basidiome 

charnu 

Ordre des Tricholomatales 

--> lames décurrentes ou échancrées ; stipe peu séparable du 

chapeau ; spores blanches à blanc-rosé ; ni anneau, ni voile 

- Pleurotus ostreatus (Pleurotacées) = pleurote en huître : 

excellent comestible 

- Pleurotus cornucopiae (Pleurotacées) = pleurote corne 

d ’abondance : excellent comestible cultivé industriellement

- Hygrophorus spp. (Hygrophoracées) = hygrophores : plusieurs 

espèces comestibles 

- Tricholoma georgii (Tricholomatacées) = mousseron de la 

Saint-Georges : excellent comestible 

- Clitocybe dealbata (Tricholomatacées) : champignon toxique 

(muscarine --> syndrome sudorien) 

- Armillaria mellea (Tricholomatacées) = armillaire couleur de 

miel : saprotrophe ou parasite des arbres affaiblis, agent du pourridié des 

racines

Ordre des Entomolales 

--> champignons à pied et chapeau confluents (difficilement 

séparables) ; lames échancrées ou décurrentes ; spores roses ; ni 

anneau, ni volve 

- Entoloma lividum (Entolomatacées) = entolome livide : espèce 

vénéneuse (--> syndrome résinien) 

Ordre des Cortinariales 

--> champignons à pied et chapeau confluents (difficilement 

séparables) ; lames échancrées ou adnées ; spores brunes à rouilles ou 

violacées à noirâtres ; voile partiel --> anneaux ou cortines 

- Galerina marginata (Strophariacées) = galère marginée : espèce 

mortelle (--> syndrome phalloïdien) 

- Agrocybe aegerita (Strophariacées) = pholiote du peuplier : excellent 

comestible, cultivée

- Psilocybe semilanceolata (Strophariacées) : espèce hallucinogène 

(psilocine et psilocybine) 

- Inocybe patouillardi (Cortinariacées) = inocybe de Patouillard : 

champignon toxique (--> syndrome sudorien) 

- Cortinaria orellanus (Cortinariacées) = cortinaire des montagnes : 

champignon mortel (orellanine --> syndrome orellanien) 

Ordre des Agaricales 

--> champignons à pied et chapeau séparables ; lames libres ; 

spores blanches ou noirâtres 

- Agaricus campestris (Agaricacées) = rosé des prés : espèce 

comestible 

- Agaricus bispora (Agaricacées) = champignon de couche : espèce 

comestible cultivée industriellement en grand (« champignon de 

Paris »)

- Macrolepiota procera (Agaricacées) = lépiote élevée : espèce 

comestible 

- Coprinus atramentarius (Coprinacées) = coprin noir d’encre : 

espèce comestible jeune, mais à effet antabuse 

Ordre des Amanitales 

--> champignons à pied et chapeau séparables ; anneau + volve ; 

lames libres ; spores blanches 

- Amanita phalloides (Amanitacées) = amanite phalloïde : espèce 

mortelle (amanitines --> syndrome phalloïdien) 

- Amanita muscaria (Amanitacées) = amanite tue-mouches : espèce 

toxique (isoxazol --> syndrome panthérinien) et hallucinogène

Ordre des Plutéales 

--> champignons à pied et chapeau séparables ; lames libres 

roses ; spores roses 

- Volvaria spp. = volvaires et Plutea spp. = plutées (Plutéacées) : 

espèces comestibles 

Ordre des Russulales 

--> champignons à chair grenue ; pied cassant ; spores 

blanches à jaune foncé 

- Russula cyanoxantha (Russulacées) = russule charbonnière : 

excellent comestible 

- Lactarius deliciosus (Russulacées) = lactaire délicieux : espèce 

comestible

Ordre des Bolétales 

--> champignons à pied et chapeau non séparables ; hyménium 

souvent en tubes, toujours séparable du chapeau 

- Paxillus involutus (Paxillacées) = paxille à bords enroulés : 

champignon plus ou moins toxique 

- Boletus edulis (Bolétacées) = cèpe de Bordeaux : excellent 

comestible cultivé 

- Boletus satanas (Bolétacées) = bolet Satan : espèce vénéneuse 

3- GASTÉROMYCÉTIDÉES 

= Champignons à angiosporie (hyménium interne), 

souvent souterrains 

Ordre des Lycoperdales 

ex: Lycoperdon perlatum = vesce de loup perlée

Ordre des Sclérodermatales 

ex: Scleroderma citrinum 

Ordre des Phallales 

ex: Phallus impudicus = satyre puant

LES DEUTÉROMYCÈTES 

I. DÉFINITION 

II. CLASSIFICATION 

III. IMPORTANCE

I. DÉFINITION 

Deutéromycètes = champignons « imparfaits » ou 

Fungi imperfecti 

--> ensemble artificiel d’espèces fongiques 

levuriformes ou à thalle cloisonné (environ 20 000) pour 

lesquelles on ne connaît pas de reproduction sexuée (= 

anamorphes) 

anamorphes 

--> parasexualité 

parasexualité fréquente : hétérocaryose suivie 

d ’haploïdisation à l’origine d’un polymorphisme génétique 

du mycélium 

Origine de l ’absence de reproduction sexuée : 

- soit parce qu’elle ne se produit que dans certains secteurs 

géographiques (ex: Uncinula necator) 

- soit parce qu’elle ne se produit pas en conditions naturelles 

(ex: Penicillium spp.) 

- soit parce qu’il s’agit d’une espèce hétérothallique pour 

laquelle il n’existe pas 2 signes opposés 

- soit parce que l’espèce a définitivement perdu sa reproduction 

sexuée au cours de l ’évolution 

- soit parce que la reproduction sexuée n ’a pas encore été 

découverte

conséquence propre à la systématique des champignons : 

une même espèce peut présenter des formes sexuées (= 

téléomorphes) téléomorphes et des formes asexuées (= anamorphes), 

anamorphes 

nommées différemment et classées à 2 niveaux systématiques 

différents (Ascomycètes +++) 

II. CLASSIFICATION 

Champignons levuriforme ou dimorphiques 

…… BLASTOMYCÈTES 

Champignons à thalle entièrement mycélien 

…… HYPHOMYCÈTES 

- spores asexuées (arthrospores ou conidies) 

--> Moniliales 

- spores absentes 

--> Thallosporales 

Champignons à thalle mycélien produisant des conidies à l’intérieur 

d ’organes différenciés 

- pycnides --> Sphaeropsidales 

- acervules ou sporodochies --> Mélanconiales

Phytopathologie : 

III. IMPORTANCE 

- Fusarium spp. : parasites des Solanacées et Rosacées 

- Helminthosporium spp. : parasites des céréales 

- cf. Loculomycétidées et Pyrénomycétidées 

Mycologie médicale : 

- Candida spp. (C. albicans +++) : agent de candidoses 

locales (muguet, perlèche, etc.) ou généralisées

- Malassezia furfur : agent du Pytiriasis versicolor 

- Cladosporium carrionii, Phialophora spp. : agents de 

chromomycoses 

- Pneumocystis jiroveci (ex-P. carinii) : agent d ’une 

pneumocystose (infection opportuniste du SIDA +++)

Industrie pharmaceutique : 

- Penicillium chrysogenum : production de pénicilline 

- Cephalosporium acremonium : production de 

céphalosporine C 

- Tolypocladium inflatum : production de ciclosporine 

- Penicillium griseofulvum : production de griséofulvine 

- Aspergillus nidulans, Coleophoma empetri, Glarea 

lozoyensis : production d ’échinocandines 

Lutte biologique : 

- Arthrobotrys spp. et Dactylaria spp. : nématicides 

Bioremédiation : 

- Cladosporium resinae : lutte contre les pollutions 

marines par les hydrocarbures

BIOLOGIE ET PHYLOGÉNIE 

DES ALGUES 

I. DÉFINITION DES ALGUES - PHYLOGÉNIE 

II. APPAREIL VÉGÉTATIF : LE THALLE 

III. LES PIGMENTS 

IV. ECOLOGIE DES ALGUES 

V. REPRODUCTION ET MULTIPLICATION

I. DÉFINITION DES ALGUES - PHYLOGÉNIE 

« Algues » 

Aucune valeur systématique (ensemble 

polyphylétique) 

Ensemble artificiel d’organismes partageant 

certains caractères : 

- mode de vie aquatique 

- organismes autotrophes à chlorophylle a 

- appareil végétatif rudimentaire avasculaire = thalle 

--> ex-« thallophytes » 

- appareil reproducteur = cystes 

--> ex-« cryptogames » 

incluent des « macroalgues » benthiques et une 

grande diversité de « microalgues » planctoniques 

ou benthiques, marines ou d’eau douce 

réparties dans 11 groupes : 

- 1 procaryotique (Eubactéries) : Cyanobactéries = « algues 

bleues » 

- 10 eucaryotiques, répartis dans 6 (?) clades 

sont des organismes aquatiques à thalle ayant 

acquis la photosynthèse par endosymbiose, 

endosymbiose 

directement ou indirectement, d’une cyanobactérie

A l’origine des eucaryotes : 

- établissement d ’une symbiose entre une 

archébactérie et une eubactérie (mécanisme ?) 

--> cellule hétérotrophe à véritable noyau 

(endosymbiote 

endosymbiote) et système membranaire endocellulaire 

- phagocytose d’une bactérie α-pourpre par la 

cellule hétérotrophe et endosymbiose primaire 

--> apparition de la mitochondrie 

A l’origine des 1ers eucaryotes photosynthétiques : 

phagocytose d’une cyanobactérie par la cellule 

eucaryote hétérotrophe et nouvelle endosymbiose Iaire --> apparition de plastes à 2 membranes (inauguration 

de la « lignée verte »)

EUCARYOTES 

Endosymbiose I aire 

« LIGNÉE VERTE » 

Chlorophytes 

Streptophytes 

CHLOROBIONTES 

Glaucophytes 

Rhodobiontes 

Chlorobiontes 

Ulvophytes 

Prasinophytes 

Chlorokybophytes 

Klebsormidiophytes 

Chaetosphaeridiophytes 

Charophytes 

Coléochaetophytes 

EMBRYOPHYTES 

Zygnématophytes

A l’origine de la plupart des autres algues : 

plusieurs épisodes d’endosymbiose 

endosymbiose secondaire 

= phagocytose de Rhodobiontes par des cellules 

eucaryotes 

--> apparition de plastes à 4 membranes (Cryptophyta, 

Haptophyta, Ochrophyta, Dinophyta p.p.?) 

Exception : un Chlorobionte remplace le Rhodobionte chez les 

Chlorarachnophytes et les Euglenophyceae

chez certaines lignées d’algues (Euglenophyceae et 

Dinophyta), existence de plastes à 3 membranes 

- myzocytose au lieu d’une phagocytose ? 

- perte d’une membrane au cours de l’évolution ? 

possibilité d’endosymbiose 

endosymbiose tertiaire 

--> cas de Dinophytes ayant phagocyté une Haptophyte 

--> présence de plastes d’origines différentes !

I 

II 

II 

II 

II 

LIGNÉE BRUNE 


II 

III 

LIGNÉE VERTE 

CHAMPIGNONS 


CHOANO ORGANISMES 

LIGNÉE BRUNE 

Ciliés 

Dinophytes 

Mycétozoaires 

Euglénobiontes 

Cryptophytes 

Chlorarachniophytes 

Blastocystea 

Proteromonadea 

Opalinidea 

Bicoecea 

Labyrinthulomycètes 

Hyphochytriomycètes 

Oomycètes 

Bigyromonadae 

OCHROPHYTA 

Haptophytes

parfois dans un même clade : « algues » et 

organismes non « algaux » (ex: euglènes et trypanosomes 

dans les Euglénobiontes) 

- soit parce que l’endosymbiose n’a pas concerné tous 

les organismes du clade 

- soit parce que certains organismes du clade ont perdu 

secondairement leurs plastes 

Conclusion : les algues sont des organismes 

chimériques, chimériques formant un ensemble polyphylétique, 

objet d ’étude de la phycologie 

Remarque : les Embyophytes sont des « algues 

terrestres » !

II. APPAREIL VÉGÉTATIF : LE THALLE 

Plusieurs niveaux d’organisation : 

• thalle unicellulaire (mais organismes vivant 

souvent en colonies à l’intérieur d’un mucilage) 

- non mobile : thalle coccoïde 

- mobile (1 ou 2 flagelles) : thalle monadoïde 

• thalle pluricellulaire 

- filaments cloisonnés, ramifiés ou non 

- siphons (coenocytes coenocytes) 

- pseudoparenchyme 

morphologie = résultat de convergences évolutives 

multiples : 

- thalle filamenteux ou d’allure filamenteuse 

- thalle creux ou mucilagineux 

- thalle foliacé 

- thalle cylindrique ou épais 

- thalle encroûtant non calcifié 

- thalle calcifié

II. LES PIGMENTS 

pendant longtemps un critère majeur pour la 

classification des algues 

Chlorophylles --> couleur verte des chloroplastes 

- chlorophylle a (algues + embryophytes) 

- chlorophylle b (Chlorobiontes et plastes dérivés) 

- chlorophylle c (plastes dérivés des Rhodobiontes) 

- chlorophylle d (Rhodobiontes) 

rôle : photosynthèse 

Phycobiliprotéïnes (= Phycobilines) 

Phycobilines 

- phycoérythrines 

--> couleur rouge 

- phycocynanines 

--> couleur bleue 

- allophycocynanines 

--> couleur bleu turquoise 

rôle : capter des photons de λ différentes de ceux 

captés par les chlorophylles et les transmettre à celles-ci

Caroténoïdes 

- carotènes 

--> couleur orange ou brune 

- xanthophylles 

--> couleur jaune 

rôle : participation à la collecte des photons et 

protection contre la photooxydation 

Fucoxanthine 

(500-560) 

Phycoérythrine 

(500-565) 

Phycocyanine 

(555-620) 

Chlorophylles (b: 650 ; a: 670-680) 

b a 

Allophycocyanine 

(650) 

500 600 

700 

λ (nm)

IV. ECOLOGIE DES ALGUES 

La composition pigmentaire ne conditionne pas la 

répartition altitudinale des algues (adaptation adaptation 

chromatique !) 

---> rôle essentiel des facteurs environnementaux 

• Lumière : indispensable aux algues exclusivement 

autotrophes (toutes sauf Dinophytes et Haptophytes --> 

mixotrophes) 

--> l’intensité doit être supérieure au point de 

compensation (plus bas chez les Rhodobiontes) 

• Température : responsable d ’une zonation latitudinale des 

espèces (tropical --> arctique) et d’une stratification verticale 

(algues planctoniques +++) 

• Salinité : influence la pression osmotique des cellules 

(régulée par certains composés : mannitol, floridoside…) ; 

faible en eau douce, élevée en milieu marin 

• Durée d’émersion 

Durée d’émersion : représente un stress hydrique plus ou 

moins prolongé (dessication, modulée par la chaleur, le gel 

ou le vent), supporté grâce à certains composés : mucilage, 

alginates

• nature du substrat : influence la fixation et l’aptitude à la 

colonisation des algues fixées (= algues benthiques) benthiques mais 

n ’affecte pas celles en suspension dans l’eau (= algues 

pélagiques) pélagiques ; 

Cas particuliers : algues épiphytes et algues parasites 

• Substances dissoutes : nécessité d’une source d’azote 

(nitrates +++), de phosphore, de métaux (Mg, Cu, Mn, Zn, 

Mo, de vitamine B12 et B1 • Hydrodynamisme : influence fortement la morphologie 

des thalles (mode battu/mode abrité sur le littoral ; eau 

courante/eau stagnante en eau douce) 

Existence d’une zonation verticale des 

communautés algales du benthos = étagement : 

- étage supralittoral : soumis aux embruns 

- étage médiolittoral : zone de balancement des marées 

- étage infralittoral : zone immergée des algues 

photophiles 

- étage circalittoral : zone immergée des algues 

sciaphiles 

--> système littoral = système phytal 

- étages bathyal, abyssal et hadal : pas d’algue 

--> système aphytal

V. REPRODUCTION ET MULTIPLICATION 

Extraordinaire diversité des cycles de développement 

chez les algues, sans modèle général 

Reproduction sexuée plus fréquente que la multiplication 

asexuée 

Reproduction sexuée : 

- spores et gamètes souvent (bi-)flagellées = zoospores et 

zoogamètes 

- organes reproducteurs (= cystes) cystes peu différenciés en général 

(sauf Rhodobiontes et Ochrophytes) 

Cycles de vie : 4 types et une multitude de variantes 

- monogénétique haplontique : 1 génération haploïde 

- monogénétique diplontique : 1 génération diploïde 

- digénétique haplodiplontique : 2 générations, haploïde et diploïde 

- trigénétique haplodiplontique : 3 générations, haploïdes et diploïdes 

Multiplication asexuée : seule connue chez plusieurs 

groupes d’algues, dominante chez d’autres 

- simple mitose chez de nombreuses algues unicellulaires 

- parthénogénèse 

- propagules (algues brunes +++) 

- fragmentation du thalle (fragments = hormogonies) 

hormogonies

LES ALGUES BLEUES 

(= CYANOBACTÉRIES) 



III. MULTIPLICATION ET REPRODUCTION 

IV. ÉCOLOGIE 

V. IMPORTANCE


Seule lignée d’algues procaryote, procaryote appartenant 

au super-règne des Bacteria 

BACTERIA 

ARCHAEA 

EUKARYA 

contient la chlorophylle a (et non la 

bactériochlorophylle) et les photosystèmes I et II 

--> réalisent la photosynthèse oxygénique 

contient des phycobilisomes 

cellules jamais flagellées

EUBACTÉRIES 

- 3,4 milliards d ’années 


PROTÉOBACTÉRIES 

Bacillus/Clostridium 

Actinobactéries 

Cyanobactéries 

Thermus/Deinococcus 

Flavobactéries 

Bactéroïdes 

Bactéries vertes sulfureuses 

Spirochètes 

Bactéries vertes non 

sulfureuses 

thalle généralement unicellulaire (coccoïde), 

parfois filamenteux (= trichomes) trichomes ou massif, de 

cellules groupées dans une gaine mucilagineuse 

pigmentée)

paroi cellulaire muréique (Eubactéries !) 

nombreuses couches parallèles de membranes = 

thylakoïdes photosynthétiques 

pigments : chlorophylle a, caroténoïdes, 

phycobilines (phycoérythrine et phycocyanine) 

substance de réserve : 

- carbone : amidon cyanophycéen (# glycogène) glycogène 

- azote : cyanophycine (polypeptide arginineasparagine) 

différenciation de cellules particulières : 

- cellules à vésicules gazeuses 

vésicules gazeuses intravacuolaires : 

contrôle la flottabilité des cyanobactéries aquatiques 

(plancton +++)

- hétérocystes : grandes cellules spécialisées dans la fixation 

anaérobie de l’azote atmosphérique (nitrogénase !) chez les 

cyanobactéries filamenteuses, reliées aux cellules végétatives 

par des microplasmodesmes 

- akinètes : spores résistantes à paroi épaissie, capables de 

survivre plusieurs décennies

III. MULTIPLICATION ET REPRODUCTION 

Multiplication végétative 

- par fragmentation des filaments (= hormogonies) 

hormogonies 

- par simple séparation de cellules (= nanocytes) nanocytes 

- par division d ’un contenu cellulaire en endospores (= 

baeocytes) baeocytes libérées après ouverture ou gélification de la 

cellule mère (= sporocyste) sporocyste 

- par bourgeonnement du thalle en exospores 

Reproduction sexuée inexistante : parasexualité 

--> transfert d’ADN d ’une cellule à une autre 

IV. ÉCOLOGIE 

très grande amplitude écologique : sources 

chaudes, glaces antarctiques, déserts, plancton, fonds 

marins, intérieur de roches, intérieur des poils creux 

des ours polaires ! 

phototrophie stricte ou facultative 

sur environ 7 500 espèces connues, seulement 200 

vivent libres 

--> organismes essentiellement symbiotiques

V. IMPORTANCE 

Rôle écologique majeur 

- Premiers organismes photosynthétiques apparus sur 

Terre (- 3 milliards d’années) ! 

- Cycle du carbone : part la plus importante (?) de la 

production Iaire des océans (plancton) 

- Cycle de l’azote 

- Nombreuses symbioses (Azolla, Cycas, Anthoceros, 

lichens, éponges, etc.) 

- A l ’origine des plastes de la 1ère cellule eucaryote 

photosynthétique (endosymbiose Iaire !) 

Alimentation humaine 

- Spiruline (Spirulina platensis), traditionnellement 

consommées au Tchad et au Mexique ; vendues dans les 

magasins de diététique pour leur richesse en protéines et en 

acides gras polyinsaturés omega-3

Agriculture : le genre Anabaena est capable de fixer N2 - en vie libre : 40 kg/ha/an 

- en symbiose avec les fougères aquatiques du genre 

Azolla spp. : 160 à 350 kg/ha/an 

--> « engrais vert » utilisé dans les rizières d ’Asie 

Nuisances : « fleurs d’eau » = prolifération d’algues 

bleues , parfois toxiques ou nuisibles : 

- Anabaena flos-aquae (anatoxines), Aphanizomenon 

flos-aquae (saxitoxine) : alcaloïdes à toxicité neuromusculaire 

- Microcystis aeruginosa (microcystine) : polypeptide 

cyclique hépatotoxique

LES ALGUES ROUGES 

(= RHODOBIONTES) 



III. CARACTÈRES CYTOLOGIQUES 

IV. REPRODUCTION 

V. ÉCOLOGIE 

VI. IMPORTANCE


Algues eucaryotes de la « lignée verte » 

--> plastes à 2 membranes issus de l’endosymbiose primaire 

(phycobilisomes d’origine cyanobactérienne) 

Métabiontes 

--> organismes généralement pluricellulaires à ADN 

chloroplastiques circulaires concentrés en petits nucléoïdes 

Rhodobiontes = lignée monophylétique « sœur » 

de celle des Chlorobiontes 

- présence d ’un amidon cytoplasmique = rhodamylon ou 

amidon floridéen 

- absence totale de cellules flagellées 

- cytoplasme de 2 cellules voisines en relation par une synapse

LIGNÉE VERTE 


MÉTABIONTES 

- 700 MA 

CHLOROBIONTES 


thalle de taille modérée (qq mm à 1 m), souvent 

filamenteux et ramifié, rarement unicellulaire 

Glaucophytes 

Rhodobiontes 

Chlorophytes 

Streptophytes 

structure uniaxiale (axes dressés à croissance indéfinie, 

rameaux à croissance définie = pleuridies) pleuridies ou multiaxiale 

(nombreux filaments adhérant entre-eux, maintenus par une 

couche de mucilage) 

croissance le plus souvent apicale, parfois intercalaire ou 

diffuse


1 ou plusieurs plastes à 2 membranes 

cellules multinucléées sans centriole ; mitoses fermées 

nombreuses inclusions intracytoplasmiques de formes 

variées 

existence de cellules spécialisées : 

- cellules sécrétrices de produits bromés (bromuques bromuques) 

ou iodés (ioduques ioduques) 

- cellules sécrétrices de mucilage 

relations étroites entre les mitochondries et l ’appareil de 

Golgi 

pigments : chlorophylle a (parfois chlorophylle d), 

phycoérythrine, phycocyanine, allophycocyanine, α-carotène, 

ß-carotène, xanthophylles (lutéine, zéaxanthine) 

substances de réserve (cytoplasme) : 

- rhodamylon ou amidon floridéen (glucane α 1-4 

ramifié en α 1-6, sans amylose) en grains ou en écailles 

- floridoside et isoflorioside (hétérosides du glycérol), 

polyols (sorbitol, dulcitol) 

--> osmorégulation

paroi cellulaire constituée de cellulose (parfois de xylanes) 

pour la partie fibrillaire et de galactanes sulfatés (parfois de 

mannanes) pour la partie mucilagineuse 

accumulation de carbonate de calcium dans les parois chez 

certaines espèces = espèces calcifiées (Corallinales) 

cloison transversale séparant 2 cellules percée d ’un orifice 

(= synapse) synapse fonctionnant comme un diaphragme ne se 

fermant pas complètement, mais s ’obstruant par un bouchon 

synaptique en vieillissant 


Cas général : algues diplobiontes (2 types de 

plantes dans la nature) à cycle trigénétique (3 

générations : gamétophyte, carposporophyte et 

tétrasporophyte) dimorphe (2 morphologies 

différentes) 

Chez certaines espèces : multiplication végétative 

grâce à des monospores

germination des carpospores 

cellules reproductrices = protoplastes : 

- oocyste à trichogyne --> oosphère 

- spermatocyste --> spermaties : injectent leur noyau dans le 

trichogyne 

fécondation (oogamie) dans l’oocyste --> zygote 

division du zygote --> gonimoblaste = ensemble de 

filaments gonimoblastiques (2n), qui parasite le gamétophyte 

(= carposporophyte) carposporophyte et qui porte des sporocystes libérant 

des carpospores 

germination des carpospores --> thalle = sporophyte (2n), 

portant des sporocystes divisés en 4 = tétrasporocystes 

libérant des tétraspores haploïdes (n) 

germination des tétraspores --> thalle : gamétophyte (n) 

produisant les gamètes

Exemple : Porphyra sp. 

multiplication végétative par 

des archéospores (= 

monospores) 

cycle trigénétique trimorphe ; 

sporophyte = ex-genre 

Conchocelis) 

méiose à l’intérieur des 

tétrasporocystes --> 

conchospores haploïdes (au lieu 

de tétraspores diploïdes) 

V. ÉCOLOGIE 

algues phototrophes, sauf espèces parasites : 

seules macroalgues ayant des réprésentants parasites 

obligatoires hétérotrophes 

--> parenté étroite avec leur hôte = adelphoparasites 

(même ordre ou même famille) 

algues essentiellement marines et benthiques 

(mers tropicales +++), souvent saxicoles ou épiphytes 

(plus rarement : endophytes, parasites, symbiotiques)

exemples d’algues rouges 

Chondrus crispus 

Dumontiera sp. 

Hildenbrandia sp. 

Polysiphonia elongata 

VI. IMPORTANCE 

Porphyra sp. 

Corallina sp. 

importance industrielle : galactanes sulfatés des 

parois +++ : 

- carraghénanes (Chondrus crispus, Eucheuma spp., 

Mastocarpus spp., etc.) 

--> utilisés comme gélifiant (E 407) dans l’industrie agroalimentaire 

: dessert lactés, conserves de viande, aliments pour 

animaux…

- agars (Gelidium spp., Gelidiella spp., Gracilaria spp., etc.) 

--> utilisés comme épaississant (E 406) dans l’industrie agroalimentaire 

(sauces, nappages, glaçages pâtissiers…) et biologique (gels 

d’électrophorèse, gélose de culture, billes de chromatographie…) 

- funorane (Gloiopeltis spp.) 

--> utilisés comme adhésif 

thérapeutique : 

- agars (Gelidium spp.) 

--> utilisés comme principe actif (laxatif) ou excipient 

(émulsifiant, épaississant, agent de dispersion pour les comprimés 

- diverses espèces de Corallinales 

--> utilisés comme prothèse osseuse (structure microalvéolaire !) 

- terpénoïdes toxiques originaux (protection 

contre les herbivores) 

-->activité antitumorale (essais cliniques)

- usages anciens et/ou traditionnels 

genres Corallina, Alsidium, Digenea, 

Symphyocladia 

--> propriétés vermifuges 

Delesseria sanguinea 

--> propriétés hémostatiques 

Corallina sp. Delesseria sanguinea 

alimentation humaine : plusieurs espèces sont 

consommées directement, au Japon (Porphyra spp. = 

« nori ») ou en Europe et Amérique du Nord 

(Palmaria spp. = « dulse ») 

En France : « flan au liquen » (Bretagne), « Blanc mangé » 

(Vendée) = dessert à base de Chondrus crispus

agriculture : 2 espèces de Corallinales 

(Lithothamnium coralloides et Phymatolithon 

calcareum) constituent un sédiment marin, le maërl, 

exploité comme amendement calcaire (500 000 t/an 

en France)

LES ALGUES VERTES 

(= CHLOROBIONTES) 



III. LES ULVOPHYTES 

IV. LES CHAROPHYTES 

V. IMPORTANCE DES ALGUES VERTES


Algues eucaryotes de la « lignée verte » 

--> plastes à 2 membranes issus de l’endosymbiose primaire 

(phycobilisomes d’origine cyanobactérienne) 

Métabiontes 

--> organismes généralement pluricellulaires à ADN chloroplastiques 

circulaires concentrés en petits nucléoïdes 

LIGNÉE VERTE 


MÉTABIONTES 

Glaucophytes 

Rhodobiontes 

Chlorobiontes

Chlorobiontes = lignée monophylétique « sœur » de 

celle des Rhodobiontes 

- présence d ’une structure étoilée (= pièce en H) H dans la zone de 

transition flagellaire 

- plates à 2 membranes à chlorophylle a et b 

- présence d’un amidon intraplastidial de réserve 

- présence d’un caroténoïde particulier : la néoxanthine 

550 à 570 genres pour 16 000 à 17 000 espèces 

CHLOROPHYTES 

CHLOROBIONTES 

STREPTOPHYTES 

Ulvophytes 

Prasinophytes 

Chlorokybophytes 

Klebsormidiophytes 

Chaetosphaeridiophytes 

Charophytes 

Coléochaetophytes 

EMBRYOPHYTES 

Zygnématophytes


très grande diversité des thalles : unicellulaire à 

multicellulaire complexe (Charales), de qq mm à 8 m 

majorité d’espèces microscopiques 

dulçaquatiques, mais très grande 

amplitude d’habitats : océans, lagunes, 

neiges, déserts, cendres volcaniques, sols, 

écorces, rochers, végétaux, animaux, etc. 

III. LES ULVOPHYTES 

lignée monophylétique différenciée par le métabolisme 

particulier du glycolate : oxydation par une glycolate 

deshydrogénase au niveau des mitochondries

Enteromorpha 

Acetabularia 

Ulva lactuca 

Codium 

Bryopsis 

Halimeda 

classe la plus importante : Ulvophyceae (110 genres, 950 

espèces) : 

- algues multicellulaires à structure coenocytique ramifiée, 

essentiellement marines et benthiques 

- cycle monogénétique haplontique ou digénétique 

haplodiplontique iso- ou hétéromorphes 

- cellules flagellées à 2 (gamètes) ou 4 (spores) flagelles 

égaux et lisses à insertion apicale

Exemple : Ulva lactuca 

cycle digénétique isomorphe 

(haplodiplontique) 

IV. LES CHAROPHYTES 

Classe des Charophyceae : lignée « sœur » des 

Parenchymophytes (= Embryophytes + Coléochaetophytes), au 

sein de l ’infra-règne des Streptophytes 

6 genres, environ 100 espèces 

algues d’eau douce à saumâtre, proche des Bryophytes et des 

Trachéophytes 

caractères cytologiques proches de ceux des Embryophytes 

(phragmoplaste, mitose ouverte, etc.)

Thalle à architecture très élaborée : 

- axe principal avec succession de nœuds et d’entre-nœuds 

- rhizoïdes à statolithes 

- paroi cellulaire cellulosique souvent calcifiée 

- différenciation d’organes reproducteurs : 

--> organe mâle : ensemble de spermatocystes 

entourés d ’une structure végétative 

--> organe femelle recouvert d ’un verticille de 

rameaux bicellulaires 

cycle monogénétique haplontique 

spermatozoïdes à 2 flagelles inégaux insérés latéralement 

zygote à paroi calcifiée épaisse contenant de la sporopollénine 

= hypnozygote 

multiplication végétative sans production de spores : 

fragmentation du thalle (bulbilles bulbilles)

V. IMPORTANCE DES ALGUES VERTES 

alimentation humaine 

- Caulerpa lentillifera (Ulvophycées), cultivée en Asie 

- Monostroma nitidum (Ulvophycées), cultivée au Japon

industrie 

- Dunaliella spp. et Haematococcus spp. (Chlorophycées) : 

espèces unicellulaires cultivées pour en extraire du ß-carotène carotène 

(utilisée pour colorer le jaune d’oeuf dans les élevages en 

batteries) et de l’astaxanthine 

astaxanthine (utilisée pour colorer la chair du 

poisson d ’élevage) 

- Dunaliella salina : cultivé pour l’extraction de glycérol 

thérapeutique 

- Chara spp. (Charophycées) : traditionnellement utilisées 

contre les rhumatismes (et les moustiques !)

pathologie 

- Prototheca wickerhamii (Trébouxiophycées) : agent de la 

protothécose, protothécose pathologie cutanée atteignant les sujets 

immunodéprimés 

nuisances 

- Caulerpa taxifolia (Ulvophycées) : espèce invasive en 

Méditerranée (« algue tueuse ») 

- Cephaleuros spp. et Stomatochroon spp. : espèces 

parasites du théier et du caféier

- Ulva spp. (Ulvophycées) : « marées vertes »

LES ALGUES BRUNES 

(= PHAEOPHYCEAE) 

PHAEOPHYCEAE 





V. ECOLOGIE 

VI. IMPORTANCE


Eucaryotes - Lignée brune 

--> chloroplastes à 4 membranes (endosymbiose d’un 

Rhodobionte) 

Straménopiles (= Hétérokontes) 

Hétérokontes 

--> monades, spores ou gamètes à flagelles différant 2 

à 2 par leur forme, leur orientation et leur fonctionnement (= 

flagelles hétérocontes) 

hétérocontes 

--> présence de touffes de poils creux sur le flagelle 

antérieur (= mastigonèmes tubulaires tripartites) tripartites 

--> zone de transition intracellulaire à la base des 

flagelles = hélice de transition 

Embranchement des Ochrophyta 

--> Straménopiles photosynthétiques à chlorophylle a 

et c, n’ayant pas perdu secondairement leurs chloroplastes 

12 (13 ?) classes d’organismes essentiellement 

unicellulaires (plancton +++) dont la plus importante 

est celle des Pheophyceae (= algues brunes) : environ 

2 000 espèces dans 265 genres 

--> organes reproducteurs différenciés (uni- et 

pluriloculaires) 

--> présence de plasmodesmes


LIGNÉE BRUNE 

Blastocystea 

Proteromonadea 

Opalinidea 

Bicoecea 

Labyrinthulomycètes 

Hyphochytriomycètes 

Oomycètes 

Bigyromonadae 

OCHROPHYTA 

(-700 MA) 

Haptophytes 

? 

Bacillariophyceae 

Bolidophyceae 

Parmophyceae 

Pelagophyceae 

Dictyophyceae 

Pinguiophyceae 

Raphidiophyceae 

Phaeophyceae 

Chrysomerophyceae 

Phaeothamniophyceae 

Xanthophyceae 

Eustigmatophyceae 

Chrysophyceae 


extraordinaire diversité du thalle, même à l’intérieur 

d ’une espèce, mais jamais unicellulaire

taille microscopique à géante (> 60m pour 300 kg!) 

Myrionema sp. 

Macrocystis sp. 

nombre de modèles architecturaux limité 

Durvillea antarctica 

- hétérotriche : filaments unisériés rampants et/ou dressés 

--> sans cloisonnement longitudinal : haplostique 

--> avec cloisonnement longitudinal : polystique = structure 

parenchymateuse 

- complexes : différenciation d’un épiderme, d’un cortex et 

d’une moelle 

croissance apicale ou intercalaire 

2 principaux types de poils : 

- phéopoils = poils endogènes à méristème basal, rôle dans 

l’absorption des sels nutritifs 

- pseudopoils : filament effilé terminé par de longues cellules 

sans plaste ; absence de méristème


cellules normalement uninucléées avec 1 ou 2 nucléoles à 

centrosome 

un ou plusieurs plastes à 4 membranes, pourvus ou non de 

pyrénoïdes 

cytoplasme à structures spécialisées sphériques contenant 

des polyphénols = physodes 

paroi à plasmodesmes 

paroi cellulaire composée de cellulose, fucoïdanes 

sulfatés et alginates : 

• acide alginique = polymère linéaire d ’acide α Dmannuronique 

et d ’acide ß L-guluronique de PM+/-800kD, 

soluble dans les solutions alcalines 

• fucoïdanes :polymères sulfatés de L-fucose liés en α- 

1,2, avec différents oses et acides uroniques, de 3 types : 

- galactoxylufucanes : L-fucose 4-sulfate +++ 

- xylofucohexuronanes :acides uroniques et D-xylose +++ 

- glucuronofucogalactanes : galactose +++

cellules flagellées à flagelles insérés latéralement 

parfois présence de cellules spécialisées : 

- paraphyses : rôle de protection des sporocystes 

auxquels elles sont mêlées 

- ascocystes : grandes cellules d ’abord bourrées de 

physodes puis vides et hyalines 

- cellules sécrétrices de mucilage : présence/absence 

liée aux conditions environnementales 

pigments : Chlorophylles a, c 1, c 2 et c 3 ; xanthophylles 

(fucoxanthine +++, violaxanthine), ß,ß carotène 

substances de réserve : laminarine (ß1-3 glucane à 

résidus mannitol), D-mannitol mannitol (polyalcool)

Cycle digénétique : 


- sporophyte diploïde à sporocystes uniloculaires formés dans 

des sores 

- gamétophyte haploïde à gamétocystes pluriloculaires 

majorité d’espèces diplobiontiques (à cycle isomorphes 

ou hétéromorphes), mais les macroalgues sont souvent 

diplohaplontiques à phase diploïde très nettement 

dominante, avec de très nombreuses variantes 

reproduction sexuée faisant intervenir des phéromones 

(hydrocarbures insaturés) 

Exemple 1 : Laminaria spp 

Cycle diplobiontique très 

hétéromorphe : les 

gamétophytes microscopiques 

sont transitoires, la plante 

visible étant le sporophyte 

diploïde.

Exemple 2 : Fucus vesiculosus 

Cycle haplodiplontique à phase 

diploïde dominante : 

gamétophyte extrêmement 

réduit se développant à 

l ’intérieur du sporophyte 

Thalle parsemé de cryptes 

pilifères ; gamètes produits à 

l ’intérieur de conceptacles 

groupés en réceptacles 

V. ECOLOGIE 

Algues presque exclusivement marines (6 espèces 

dulçaquatiques), de l’étage supralittoral à l ’étage infralittoral 

(zone de balancement des marées +++) 

espèces photophiles à sciaphiles, saxicoles ou épiphytes 

(exception : sargasses flottantes) 

présentes de la zone équatoriale aux régions subarctiques

Exemples d ’algues brunes 

Fucus vesiculosus 

Laminaria digitata 

Pelvetia canaliculata Padina sp. 

VI. IMPORTANCE 

Alimentation humaine (Japon +++) 

- Laminaria japonica = kombu, récoltée sur le littoral pacifique 

ou cultivée 

- Undaria pinnatifida = wakame, cultivée 

--> séchées puis bouillies et salées avant consommation 

(NB: en Europe, kombu = L. saccharina et L. digitata)

- « lanières » (= réceptacle) de Himanthalia elongata : commercialisées 

comme « spaghetti de mer » 

- Durvillea spp. aliment traditionnel en Amérique du Sud et 

Nouvelle-Zélande 

Industrie 

- extraction d ’alginates alginates à partir de différentes espèces (= 

alginophytes : > 18% d ’acide alginique) : Macrocystis pyrifera (USA), 

Durvillea antarctica (GB), Fucus serratus (GB), Ascophyllum nodosum 

(GB), Laminaria hyperborea (Norvège), Laminaria japonica (Chine), 

Laminaria digitata (France) récoltées en mer, parfois cultivées 

--> utilisés comme support pour les biotechnologies, 

complexant, radiodécontaminant, enrobage, additif (colles, vernis, 

huiles, goudrons, cirages, isolants électriques, détergents, etc.), affinage 

de l’argenterie, films protecteurs, pellicules photographiques, habits 

ininflammables des sapeurs pompiers (alginate de béryllium), 

imperméabilisant, etc. 

--> utilisés comme additifs alimentaires : acide alginique = E400, 

alginates : E401 --> E405 (crèmes glacées, sauces, sirops +++)

Thérapeutique 

- alginates : pansement digestif 

- iode : extraits algaux (Laminaria spp.) utilisés comme 

complément alimentaire, contre les insuffisances thyroïdiennes 

- Fucus vesiculosus : laxatif (fibres !) et coupe-faim (--> 

régimes amaigrissants) 

- stipes de laminaires : utilisés en gynécologie pour dilater le 

col de l ’utérus (mucilages !) 

- fucanes sulfatés (Delesseria spp.): anticoagulant (usage 

externe : antithrombotique, traitement et prévention des varices) 

- thalassothérapie : cataplasmes et bains chauds toniques, 

stimulants et reminéralisants (indications : obésité, vieillissement, 

fatigue chronique, cellulite, rhumatismes, anémie) 

Agriculture 

algues brunes fraîches ou séchées utilisées comme 

engrais traditionnel depuis l ’Antiquité, par épandage direct 

dans les champs (en France : Bretagne +++): 

-«goémon goémon épave » = laisses de mer, récoltées après 

fortes marées ou tempêtes 

- « goémon de rive » : algues brunes fixée accessibles à 

marée basse 

NB: de nombreux dérivés algaux sont brevetés comme amendements

Nuisances 

- rejets importants de dérivés bromés du méthane 

volatils (couche d ’ozone !)

Support du cours LS3-2 (G.DECOCQ)

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