(Thèse partie 1)

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62 Matériel et Méthodes gélose inclinée à 4°C pendant trois mois ou en milieu liquide contenant 10 à 15 % de glycérol à – 80°C (Tindall, 1992). 2. 4. Souches de référence Les souches types archéennes et bactériennes utilisées lors de ce travail sont répertoriées dans le Tableau 6. Leur culture a été faite sur le milieu HE de Torreblanca et al. (1986) à concentration saline finale de 25 % (p/v) et supplémenté de 0,1 % (p/v) de glucose (Tableau 5-Annexe 3). 3. Identification des souches purifiées L´identification des souches est faite sur la base des tests proposés par Oren et al. (1997) pour la description de nouveau taxon dans l´ordre des Halobacteriales. 3. 1. Caractérisation morphologique des souches et de leurs colonies L’aspect macroscopique est déterminé sur milieu solide spécifique pour chaque souche après 5 jours d’incubation à 37°C. La coloration de Gram a été effectuée selon la technique modifiée par Dussault (1955) par application, après fixation, d’une solution d’acétate à 2 % (v/v) pendant 5 minutes. Pour la coloration négative, une goutte d’une culture en croissance exponentielle est déposée sur une grille de cuivre. Après séchage, la préparation est colorée par une solution d’acétate d’uranyle (2 % dans l’eau distillée) durant 1 minute. Après séchage de 10 minutes à température ambiante, les grilles sont observées à l’aide d’un microscope électronique en transmission Zeiss EM 902 à 60 kV.
Tableau 6. Souches de référence utilisées. Espèce Souche Source Halobacterium salinarum DSM 3754 DSM Halococcus morrhuae NRC 51001 NRC Halorubrum trapanicum NRC 34021 NRC Halorubrum coriense DSM 10284 DSM Halorubrum distributum JCM 9100 JCM Halorubrum xinjiangense JCM 12388 JCM Halorubrum terrestre JCM 10284 JCM Halorubrum sodomense DSM 3755 DSM Halorubrum tebenquichense CECT 5317 CECT Halorubrum lacusprofundi DSM 5036 DSM Halorubrum saccharovorum DSM 1137 DSM Haloarcula marismortui DSM 3752 DSM Haloarcula vallismortis DSM 3757 DSM Haloarcula hispanica DSM 4426 DSM Haloferax mediterranea ATCC 33500 ATCC Haloterrigena turkmenica DSM 5511 DSM Pseudomonas halophila DSM 3050 DSM Halovibrio denitrificans DSM 15503 DSM Halospina denitrificans DSM 15505 DSM Salicola marasensis CECT 7107 CECT 63 Matériel et Méthodes DSM, Deutsche Sammlung von Mikroorganismen; NRC, National Research Council, (Ottawa, Canada); JCM, Japanese Center of Microorganisms; CECT, Centro Espanola de Collection Typo; ATCC, American Type Culture Collection
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