(Thèse partie 1)

Nom : KHARROUB Date de soutenanace : le 9 septembre 2007
Prénom : Karima
Titre : Identification et étude moléclaire des bactéries et des archéobactéries aérobies
halophiles de la sebkha Zzzemoul (Ain M’Lila)
Résumé
Les lacs hypersalins constituent un exemple typique d’environnements extrême abritants une
flore microbienne halophile qui a dû s’adapter à ces conditions. Dans ce travail des approches
culturales en combinaison avec des méthodes moléculaires ont été utilisées pour étudier les
communautés microbiennes des saumures de la sebkha Ezzemoul située à Ain M’Lilla (Oum
El Bouaghi). Une quarantaine de souches archéennes et bactériennes halophiles ont été
isolées, purifiées et caractérisées. Les souches archéennes appartiennent à la famille des
Halobacteriaceae de l’ordre des Halobacteriales. Elles sont toutes halophiles extrêmes,
aérobies, à Gram négatif et mésophiles en ce qui a trait à leur température optimale de
croissance ; de plus, elles sont neutrophiles. Par ailleurs, leur morphologie est caractérisée par
un réel pléomorphisme. La caractérisation des lipides polaires membranaires et l’étude
phylogénétique des souches les ont affiliées aux genres : Halobacterium, Haloarcula,
Halobaculum, Halococcus, Haloferax, Halorubrum et Haloterrigena. Sur la base des données
phénétiques et génotypiques, une nouvelle espèce nommée Halorubrum ezzemoulense sp.
nov. a été décrite.Les deux isolats bactériens sont des bâtonnets à Gram négatif, neutrophiles,
mésophiles et aérobies. Elles ont été identifiées, respectivement, comme halophile extrême et
modérée et appartiennent à la sous classe des Gamma-Proteobacteria. En se basant sur les
résultats de notre étude taxinomique, une nouvelle espèce de bactérie halophile extrême
appelée Salicola salis sp. nov. a notamment été décrite. Ce travail de recherche a aussi révélé
une très forte dominance des souches archéennes halophiles extrêmes.
Mots-clés : halophile extrême, Archaea, Bacteria, haloarchaea, séquençage, hybridation
ADN-ADN, sebkha, environnements hypersalins, diversité microbienne, phylogénie.
Membres du jury :
Président : BENGUEDOUAR Ammar Prof., Uni. Mentouri- Constantine
Rapporteur : BOULAHROUF Abderrahmane Prof., Uni Mentouri- Constantine
Examinateurs : KARAM Nour-Eddine Prof., Uni. Sénia- Oran
GUECHI El hedi Prof., Uni. Ferhat Abbas- Sétif
AGLI Nasser Prof., Uni. Mentouri- Constantine
HAMIDECHI Abdelhafid M. C., Uni. Mentouri-Constantine