(Thèse partie 1)

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Nom : KHARROUB Date de soutenanace : le 9 septembre 2007 Prénom : Karima Titre : Identification et étude moléclaire des bactéries et des archéobactéries aérobies halophiles de la sebkha Zzzemoul (Ain M’Lila) Résumé Les lacs hypersalins constituent un exemple typique d’environnements extrême abritants une flore microbienne halophile qui a dû s’adapter à ces conditions. Dans ce travail des approches culturales en combinaison avec des méthodes moléculaires ont été utilisées pour étudier les communautés microbiennes des saumures de la sebkha Ezzemoul située à Ain M’Lilla (Oum El Bouaghi). Une quarantaine de souches archéennes et bactériennes halophiles ont été isolées, purifiées et caractérisées. Les souches archéennes ap<strong>partie</strong>nnent à la famille des Halobacteriaceae de l’ordre des Halobacteriales. Elles sont toutes halophiles extrêmes, aérobies, à Gram négatif et mésophiles en ce qui a trait à leur température optimale de croissance ; de plus, elles sont neutrophiles. Par ailleurs, leur morphologie est caractérisée par un réel pléomorphisme. La caractérisation des lipides polaires membranaires et l’étude phylogénétique des souches les ont affiliées aux genres : Halobacterium, Haloarcula, Halobaculum, Halococcus, Haloferax, Halorubrum et Haloterrigena. Sur la base des données phénétiques et génotypiques, une nouvelle espèce nommée Halorubrum ezzemoulense sp. nov. a été décrite.Les deux isolats bactériens sont des bâtonnets à Gram négatif, neutrophiles, mésophiles et aérobies. Elles ont été identifiées, respectivement, comme halophile extrême et modérée et ap<strong>partie</strong>nnent à la sous classe des Gamma-Proteobacteria. En se basant sur les résultats de notre étude taxinomique, une nouvelle espèce de bactérie halophile extrême appelée Salicola salis sp. nov. a notamment été décrite. Ce travail de recherche a aussi révélé une très forte dominance des souches archéennes halophiles extrêmes. Mots-clés : halophile extrême, Archaea, Bacteria, haloarchaea, séquençage, hybridation ADN-ADN, sebkha, environnements hypersalins, diversité microbienne, phylogénie. Membres du jury : Président : BENGUEDOUAR Ammar Prof., Uni. Mentouri- Constantine Rapporteur : BOULAHROUF Abderrahmane Prof., Uni Mentouri- Constantine Examinateurs : KARAM Nour-Eddine Prof., Uni. Sénia- Oran GUECHI El hedi Prof., Uni. Ferhat Abbas- Sétif AGLI Nasser Prof., Uni. Mentouri- Constantine HAMIDECHI Abdelhafid M. C., Uni. Mentouri-Constantine
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