(Thèse partie 1)

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Revue bibliographique
A l’exception de quelques groupes de bactéries à Gram positif qui accumulent la
proline, les acides aminés ne semblent pas avoir une importance considérable en tant que
solutés compatibles chez ces bactéries. Cependant, on a noté chez Halomonas elongata une
augmentation du pool d’acides aminés intracellulaire, principalement du glutamate en
réponse à une augmentation de la concentration saline (Vreeland et al., 1983). Alors que la
proline est le principal acide aminé rencontré chez Salinicoccus roseus et Salinicoccus
hispanicus (Galinski & Trüper, 1994).
Glycine bétaïne
La glycine bétaïne (N, N, N-triméthylglycine), appartient à la famille des composés
ammonium quaternaires est le soluté compatible le plus fréquemment accumulé par les
bactéries pourpres photosynthétiques, les cyanobactéries et les bactéries hétérotrophes
halophiles aérobies (Imhoff & Rodriguez-Valera, 1984 ; Ventosa et al., 1998). A
l’exception de l’actinomycète Actinopolyspora halophila, aucune bactérie halophile
modérée ou halotolérante n’est capable d’une synthèse de novo de la glycine bétaïne
(Galinski, 1993). Mais certaines d’entre elles, sont capables de synthétiser cette molécule
soit par méthylation de la glycine, soit par oxydation de la choline (DasSarma, 2001). La
plupart de ces bactéries possèdent des systèmes de transport qui permettent une
importation rapide de ce composé ou de son précurseur (la choline), s’ils sont présents
dans le milieu environnant (Imhoff & Rodriguez-Valera, 1984).
La glycine bétaïne peut aussi servir de substrat pour certaines bactéries aux concentrations
salines inférieures à 2 M (Ventosa et al., 1998).
Ectoïne et hydroxyéctoïne
Ectoïne (acide 1, 4, 5, 6-tétrahydro-2-méthyl-4-Pyrimidinecarboxylique) et son
dérivé -hydroxyéctoïne, ont été identifiés comme solutés compatibles chez une bactérie
phototrophe halophile extrême, Ectothiorhodospira halochloris (Galinski et al., 1985). Ils
sont également reconnus comme osmoprotecteurs chez de nombreux halophiles modérés
du domaine Bacteria. La synthèse de l’éctoïne se fait en trois étapes : elle débute par le
semialdéhyde aspartate et avec le diaminobutyrate et le N- -acetyldiaminobutyrate comme
intermédiaire (Peters et al., 1990 ; Nakayama et al., 2000).Les bactéries halophiles
modérées de la famille des Halomonadaceae synthétisent ou accumulent l’ectoïne comme