(Thèse partie 1)

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Revue bibliographique
NRC-1 (Ng et al., 2000). Les promoteurs reconnus par les ARN polymérases archéennes
ressemblent fortement à ceux des eucaryotes en contenant notamment un motif plus ou
moins conservé composé majoritairement de bases T et A, appelé boite TATA (Baumann
et al., 1995 ; Ng et al., 2000). Cette boite se situe à environ 25 bases en amont du site
d’initiation de la transcription, ce qui correspond à sa position chez les eucaryotes. En
outre, les Archaea et les Eucarya possèdent des facteurs protéiques de transcription
communs, dont la protéine (TBP) (pour « TATA binding protein ») de reconnaissance de
la boite TATA et TFIIB, qui présentent des séquences similaires et dont on ne connaît pas
d’homologues chez les bactéries (Marsh et al., 1994). Halobacterium sp. NRC-1 possède
de multiples copies de gènes codant pour TBP et TFIIB dont la majorité sont sur le
réplicon pNRC 200 (Ng et al., 2000).
Les ARN messagers des archéobactéries ressemblent plus à ceux des bactéries qu’à ceux
des eucaryotes. Mais la traduction chez les haloarchaea ne débute pas au niveau de la
séquence Shine-Dalgarno comme chez les bactéries et d’autres Archaea (Soppa, 2005).
Généralement, les protéines intervenant lors de la traduction ressemblent plus à celles des
eucaryotes. En dépit du fait que les séquences des gènes codant pour les protéines
ribosomales de Halobacterium sp. NRC-1 soient similaires à celles des eucaryotes,
l’organisation en groupes de plusieurs gènes ressemble aux opérons de E. coli et la
régulation a lieu au niveau de la transcription et de la traduction (Zimmermann & Pfeifer,
2003). Tebbe et al. (2005), ont également noté la présence d’une régulation post-traduction
par contrôle de l’activité des enzymes.
De nombreux aspects moléculaires d’adaptation des haloarchaea à leur environnement
restent à élucider. Peu de gènes ont été reportés chez les halobactéries tels que celui codant
pour les vésicules à gaz, la bactériorhodopsine et autres gènes osmorégulateurs. Il paraît
que l’adaptation à un stress hypoosmotique est plus complexe pour les haloarchaea et
nécessite l’intervention de plus de protéines et de gènes (Juez, 2004).
Translocation des protéines
Le principe de transport des protéines est commun aux trois domaines (Schatz &
Dobberstein, 1996 ; Pohlschroder et al., 1997 ; Prinz et al., 1997). Ils utilisent 2 systèmes