(Thèse partie 1)
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Revue bibliographique<br />
NRC-1 (Ng et al., 2000). Les promoteurs reconnus par les ARN polymérases archéennes<br />
ressemblent fortement à ceux des eucaryotes en contenant notamment un motif plus ou<br />
moins conservé composé majoritairement de bases T et A, appelé boite TATA (Baumann<br />
et al., 1995 ; Ng et al., 2000). Cette boite se situe à environ 25 bases en amont du site<br />
d’initiation de la transcription, ce qui correspond à sa position chez les eucaryotes. En<br />
outre, les Archaea et les Eucarya possèdent des facteurs protéiques de transcription<br />
communs, dont la protéine (TBP) (pour « TATA binding protein ») de reconnaissance de<br />
la boite TATA et TFIIB, qui présentent des séquences similaires et dont on ne connaît pas<br />
d’homologues chez les bactéries (Marsh et al., 1994). Halobacterium sp. NRC-1 possède<br />
de multiples copies de gènes codant pour TBP et TFIIB dont la majorité sont sur le<br />
réplicon pNRC 200 (Ng et al., 2000).<br />
Les ARN messagers des archéobactéries ressemblent plus à ceux des bactéries qu’à ceux<br />
des eucaryotes. Mais la traduction chez les haloarchaea ne débute pas au niveau de la<br />
séquence Shine-Dalgarno comme chez les bactéries et d’autres Archaea (Soppa, 2005).<br />
Généralement, les protéines intervenant lors de la traduction ressemblent plus à celles des<br />
eucaryotes. En dépit du fait que les séquences des gènes codant pour les protéines<br />
ribosomales de Halobacterium sp. NRC-1 soient similaires à celles des eucaryotes,<br />
l’organisation en groupes de plusieurs gènes ressemble aux opérons de E. coli et la<br />
régulation a lieu au niveau de la transcription et de la traduction (Zimmermann & Pfeifer,<br />
2003). Tebbe et al. (2005), ont également noté la présence d’une régulation post-traduction<br />
par contrôle de l’activité des enzymes.<br />
De nombreux aspects moléculaires d’adaptation des haloarchaea à leur environnement<br />
restent à élucider. Peu de gènes ont été reportés chez les halobactéries tels que celui codant<br />
pour les vésicules à gaz, la bactériorhodopsine et autres gènes osmorégulateurs. Il paraît<br />
que l’adaptation à un stress hypoosmotique est plus complexe pour les haloarchaea et<br />
nécessite l’intervention de plus de protéines et de gènes (Juez, 2004).<br />
Translocation des protéines<br />
Le principe de transport des protéines est commun aux trois domaines (Schatz &<br />
Dobberstein, 1996 ; Pohlschroder et al., 1997 ; Prinz et al., 1997). Ils utilisent 2 systèmes