(Thèse partie 1)

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Revue bibliographique
présents dans les gènes des ARNt et ARNr. Ils sont coupés par une ribonucléase semblable
à celle qui coupe les transcrits primaires d’ARN eucaryotes (Lykke-Andersen et al., 1997).
La similarité la plus remarquable est que l’ordre des gènes est conservé entre les Bacteria
et les Archaea dans certains opérons qui contiennent des protéines ribosomiques appelées
streptomycine (str), spectinomycine (spc), S10, ou par exemple (Keeling et al., 1994).
Tableau 3. Organisation des génomes de cinq haloarchaea (Ng et al., 2000 ; Baliga et al.,
2004 ; Falb et al., 2005 ; Bolhuis et al., 2006).
Propriétés 1 2 3 4 5
Origine
Poissons salés Poissons salés Mer Morte Salines Lac sodé
(Espagne) (Egypte)
Taille du génome
(Mb)
2,61
2,72
4,37 3,24 2,80
Nombre de
plasmides
GC %
Opérons
ARNr
Protéines basées
sur le rétinal
(Bop, Hop, Sop)
2
68,0
1
4
(1, 1, 2)
4
68,0
1
4
(1, 1, 2)
8*
62,4
3
6
(3, 1, 2)
1
47,9
2
3
(2, 1, 0)
2
63,4
1
2
(0, 1, 1)
1, Halobacterium sp. NRC-1 ; 2, Halobacterium str. R1 ; 3, Haloarcula marismortui
ATCC 43049 T ; 4, Haloquadratum walsbyi ; 5, Natronomonas pharaonis.DM 2160 T .
*, un des plasmides est le chromosome II; Bop, bactériorhodopsine ; Hop, halorhodopsine ;
Sop, rhodopsine sensitif.
Une caractéristique commune des membres du genre Haloarcula est la présence d’au
moins deux copies hétérogènes du gène d’ARNr 16S qui diffère de 5 % ou plus (Dennis et
al., 1998). Le génome de Haloarcula marismortui ATCC 43049 T contient trois opérons
ARNr distincts (rrnA, rrnB et rrnC). Opérons rrnA et rrnC sont portés par le chromosome
I et rrnB par le chromosome II (Baliga et al., 2004).
Réplication de l’ADN
De tous les mécanismes informationnels, c’est la réplication de l’ADN qui présente
plus de ressemblance entre Archaea et Eucarya. C’est l’analyse, en 1996, du premier