(Thèse partie 1)

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Revue bibliographique
Lors de l’analyse des génomes des halobactéries, on a noté la présence de gènes codant
pour les enzymes du cycle de la -oxydation mais aucune oxydation d’acides gras n’a été
observée (Ng et al., 2000 ; Falb et al., 2005). La chaîne de transport des électrons chez
Halobacterium salinarum consiste en un complexe cytochrome b contenant au moins trois
cytochromes type b, un cytochrome type c et une oxydase terminale de type aa3 (Fujiwara
et al., 1989). Il semblerait que le transport des électrons par la chaîne respiratoire soit
stimulé par le glycérol (Oren, 1994). Les halobactéries sont des aérobies mais une
respiration anaérobie a été également signalée chez ce groupe. Ainsi, on a noté que
Haloferax mediterranei, Haloferax denitrificans et Haloferax volcanii réduisent les nitrates
en nitrites (Tindall, 1992).
3. 3. 6. Production de halocines
Les halophiles extrêmes du domaine Archaea produisent des substances protéiques
excrétées dans l’environnement, appelées halocines. Elles ont été décrites pour, la première
fois, par Rodriguez-valera et al. (1982), ce type de bactériocines détruit les membranes
cellulaires ou inhibe la transcription, la traduction et l’activité nucléasique (ADN et ARN)
(Price & Shand, 2000). Bien que la production d’halocines semble être une caractéristique
universelle des halophiles extrêmes (Torreblanca et al., 1991), seulement cinq halocines
ont été caractérisées au niveau protéique. Trois d’entre elles se distinguent par leur haut
poids moléculaire : l’halocine H4 produite par Haloferax mediterranei R4 d’environ 28
kDa (Meseguer & Rodriguez-Valera, 1985), l’halocine H6 produite par Haloferax
gibbonsii Ma d’environ 32 kDa (Torreblanca et al., 1989) et l’halocine III de 31 kDa
produite par Haloferax mediterranei Xia3 (Platas et al., 1996). Les deux autres
microhalocines ont un poids moléculaire inférieur à 3 kDa (Price & Shand, 2000).
3. 3. 7. Bactériorhodopsine et photosynthèse chez les haloarchaea
Les haloarchaea diffèrent des Archaea par la capacité qu’ont certains membres des
genres Halobacterium, Haloarcula et l’espèce Halorubrum sodomense (Blaurock &
Stoeckenius, 1971 ; Oren, 1983b ; Kitajima et al., 1996) de réaliser un type particulier de
photosynthèse en absence de chlorophylle. A basse pression partielle d’oxygène, elles
synthétisent des taches pourpres qui apparaissent sur leur membrane cytoplasmique
(membrane rouge) et qui peuvent couvrir plus de la moitié de la membrane cellulaire :