(Thèse partie 1)

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Revue bibliographique
La présence des enzymes du cycle tricarboxylique a été démontrée chez les haloarchaea.
Elles sont toutes cytoplasmiques à l’exception de la succinate déshydrogénase et sont
actives en présence de chlorure de potassium ou de chlorure de sodium (Hochstein, 1988).
Communément à tous les Archaea, la conversion du pyruvate en acétyl CoA est catalysée
par une oxo-acid ferredoxine réductase. Au contraire de la dégradation du glucose, la
gluconéogénèse suit la voie inverse d’Embden-Meyerhof (Altekar & Rangaswamy, 1992 ;
Verhees et al., 2003). Tous les gènes codant pour cette voie, sont présents dans le génome
de Halobacterium sp. NRC-1 et de Haloarcula marismortui sauf pour celui de la fructose
1, 6- diphosphate aldolase. Cependant, une classe I d’aldolase de type eucaryote est
détectée chez de nombreuses espèces de Haloarcula (Ng et al., 2000 ; Baliga et al., 2004).
La voie des pentoses phosphate est absente chez Halobacterium salinarum (Oren, 1999b).
Dans les lacs hypersalés, les haloarchaea présentent une grande affinité pour le glycérol
produit par l’algue verte unicellulaire Dunaliella. En effet, toutes les halobactéries étudiées
possèdent une glycérol kinase constitutive (Oren, 1994). La croissance de certaines espèces
d’halobactéries sur certains hexoses aboutit à une acidification du milieu par production
d’acétate, de lactate et de pyruvate (Tomlinson & Hochstein, 1976 ; Oren et al., 1995).
L’acétate produit pourra servir de source de carbone et d’énergie pour certaines espèces
des genres Haloarcula, Halococcus et Haloferax (Javor, 1984 ; Tindall, 1992 ; Bräsen &
Schönheit, 2001) via le cycle Shunt du glyoxylate, une variante du cycle de Krebs.
L’isocitrate lyase inductible clive l’isocitrate en succinate et glyoxylate (Aitken & Brown,
1969 ; Oren et al., 1995).
L’arginine est utilisé en anaérobiose et à l’obscurité par Halobacterium selon la voie dite
de l’arginine désiminase (Hartmann et al., 1980 ; Ruepp & Soppa, 1996). L’arginine est
donc propice comme substrat de croissance là où elle est abondante, en fournissant à la fois
carbone, azote et énergie. La fermentation de l’arginine par cette voie est également
répandue chez les bactéries lactiques, Pseudomonas sp., Bacillus sp., Mycoplasma sp. et
chez les cyanobactéries.
Certaines halobactéries semblent fixer le CO2 en présence d’acide propionique par une
voie non établie. Cette fixation semble parfois être stimulée par la lumière (Danon &
Caplan, 1979).