(Thèse partie 1)

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Revue bibliographique
Les lipides polaires dérivent du diacylglycérol (C20-isopropanylglycérol diéther ou sn-2,3-
diphytanylglycérol diéther) (Figure 7, 1) (Kates, 1978) et non du diacylglycérol (sn-1,2-
diacylglycérol diester). La chaîne phytanyl C20 contient 4 branchements méthyles et est
similaire au groupe phytol de la chlorophylle après saturation (Kates, 1984). Il existe des
variétés de cette structure chez les halophiles extrêmes alcalophiles : 2-O-sesterterpanyl-3-
O-phytanyl-sn-glycérol (C20C25 diéther ou core C20C25) et 2,3-di-O-sesterterpanyl-sn-
glycérol (C25C25 diéther ou core C25C25) (Figure 7, 1A et 1B) (De Rosa et al., 1983). Le
nom «archaeol » additionné de la désignation du groupe acyl (C20C25) a été introduit par
Nishihara et al. pour désigner le diphytanylglycérol diéther (Kates, 1988a).
La structure des phospholipides a été établie par Kates (1978) (Figure 8) et comprend un
phospholipide majeur et 3 phospholipides mineurs. Le phospholipide majeur est un
archaeol analogue du phosphatidylglycérol phosphate méthyl ester (PGP-Me). Les mineurs
sont identifiés comme étant des archaeol analogues de phosphatidylglycérol (PG), de
phosphatidylglycérol sulfate (PGS) et d’acide phosphatidique (PA).
La comparaison des structures des phospholipides diéther avec les phospholipides
normaux, a indiqué que celles des halophiles extrêmes sont les images dans un miroir de
celles des autres organismes (Figure 8). Chez les Archaea en général, la molécule existe
sous la forme de sn-glycérol-1-phosphate (G1P) alors que chez les bactéries et les
eucaryotes sous la forme de sn-glycérol-3-phosphate (G3P) (Kates, 1978 ; Daiyasu et al.,
2005). Archaeol C20C20 analogues de PGP-Me et PG sont présents chez tous les genres
(Kates, 1978 ; Kates, 1993a). Les membres alcalophiles contiennent en plus, des C20C25
diéther (Kamekura & Dyall-Smith, 1995) et C25C25 diéther (De Rosa et al., 1983).
La composition des lipides polaires et spécialement celle des glycolipides semble être
corrélée avec la taxinomie au niveau du genre (Torreblanca et al., 1986 ; Kates, 1993b).
Leur détermination constitue un test rapide pour classer une haloarchaea (Ross & Grant,
1985 ; Tindall et al., 1987).
Les glycolipides sont présents spécialement chez les membres neutrophiles (Kamekura &
Kates, 1999) et comprennent un triglycosyl sulfaté (S-TGD-1) comme glycolipide majeur
et de nombreux glycolipides mineurs (Figure 9) (Kates, 1978). Le groupe de glycolipides
mineurs comprend un triglycosyl, archeaol galactosyl-mannosyl-glucosyl (TGD-1) ;
tétraglycosyl sulfaté (S-TeGD) et sa forme désulfaté (TeGD) ; un triglycosyl, archaeol
glucosyl-mannosyl-glucosyl (TGD-2) ; un diglycosyl (TGD-2) ; un diglycosyl sulfaté,