(Thèse partie 1)

7. Méthodes de reconstruction
7. 1. La méthode du Neighbor-Joining (NJ) (Saitou & Nei, 1987)
7. 2. La méthode du maximum de parcimonie (Fitch, 1971)
7. 3. Méthode du maximum de vraisemblance (Felsentein, 1981)
Matériel et Méthodes
1. Echantillonnage
2. Isolement, purification et conservation des souches
2. 1. Composition chimique des milieux de cultures utilisés
2. 2. Isolement
2. 3. Conservation des souches
2. 4. Souches de référence
3. Identification des souches purifiées
3. 1. Caractérisation morphologique des souches et de leurs colonies
3. 2. Ultrastructure interne des souches
3. 3. Caractérisation physiologique
3. 4. Caractérisation biochimique
3. 5. Sensibilité aux antibiotiques
3. 6. Chimiotaxinomie
3. 6. 1. Analyse des lipides polaires membranaires archéens
3. 6. 2. Extraction et caractérisation de la bactériorubérine
3. 6. 3. Analyse des acides gras membranaires bactériens
3. 7. Etude phylogénétique
3. 7. 1. Extraction de l’ADN total
3. 7. 2. Contrôle de la pureté et détermination de la concentration de
l’ADN en solution
3. 7. 3. Détermination du contenu en G+C de l’ADN génomique
3. 7. 4. La Réaction de Polymérisation en Chaîne ou technique PCR
3. 7. 5. Hybridation ADN-ADN
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