(Thèse partie 1)

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Revue bibliographique
Antón et al. (2000) ont par la suite identifié un nouveau genre halophile extrême dénommé
Salinibacter affilié au groupe des Cytophaga-Flavobacterium-Bacteroïdes et pouvant
constituer jusqu’à 25 % de la biomasse des bassins les plus concentrés des marais salants
en Espagne. Il est responsable de 5 % dans le développement de la couleur rouge des
saumures (Oren & Rodriguez-Valera, 2001), dû à la présence d’un pigment de type
caroténoïde C40, la salinixanthine (Oren, 2002c).
Les lacs alcalins ont aussi fait l’objet d’analyses multiples. Il s’agit d’un type particulier de
lac salé, contenant entre autres sels une grande quantité de carbonates et bicarbonates de
sodium (Sorokin & Kuenen, 2005). Duckworth et al. (1996), ont ainsi mis en évidence des
-Proteobacteria du genre Halomonas ainsi que des Actinobacteria et des Firmicutes au
sein de six lacs situés au Kenya et en Tanzanie. Des archaea haloalcalophiles appartenant
aux genres Natronobacterium, Natronococcus, Natrialba, Natrinema, Natronomonas,
Natronorubrum et Halalkalicoccus ont aussi été mises en évidence dans ces mêmes lacs.
Ces derniers présentent une faible diversité qui peut s’expliquer par la difficulté
d’adaptation des microorganismes à la double contrainte du sel et du pH alcalin.
2. Adaptation moléculaire à l’halophilisme
Dans la nature il est extrêmement rare de trouver un habitat composé d’une seule
espèce ou lignée cellulaire. Différents microorganismes coexistent, interagissent entre eux
et avec l’environnement qui les entoure et de ce fait même définissent la communauté.
Cette dernière forme un système en constante évolution mais qui en même temps possède
une certaine homéostasie qui reflète les interactions entre tous les membres de cette
communauté et l’habitat qu’ils occupent (Alexander, 1997).
Aussi, la vie dans les lacs hypersalés n’est possible qu’aux prix d’une forte spécialisation
qui n’est atteinte que par quelques microorganismes, capables de maintenir une pression
osmotique égale à celle de l’environnement. Deux stratégies sont utilisées pour s’adapter
au milieu hypersalé et donc à une faible activité d’eau (Aw).
2. 1. Adaptation à la salinité par production d’osmoprotecteurs
L’exclusion du sodium et la synthèse ou l’accumulation de solutés compatibles est
une réponse au stress hyperosmotique adoptée par les microorganismes Eucarya halophiles