(Thèse partie 1)

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Revue bibliographique
Dans le domaine des Eucarya, les halophiles sont plus rares. Le principal représentant des
halophiles est l’algue verte Dunaliella qui comprend des espèces halophiles modérées
(Dunaliella viridis, Dunaliella parva …) et une espèce halophile extrême (Dunaliella
salina). Cette algue produit le -carotène responsable de la couleur orange des saumures et
dont ses propriétés sont exploitées en biotechnologie (Oren, 2002b). On peut aussi citer le
crustacé Artemia. Enfin, parmi les eucaryotes, des levures osmotolérantes (Rhodotorula
mucilaginosa et Pichia guilliermondii), isolées de bassins d’évaporation croissent à 15 %
de sel (Buchalo et al., 1998).
Le domaine des Bacteria regroupe la plus grande diversité des halophiles, la plupart étant
halophiles modérées plutôt qu’extrêmes. Elles sont ubiquistes et présentes dans un grand
nombre de groupes phylogénétiques. Les bactéries les plus isolées et étudiées sont les
bactéries fermentatives strictes. Elles appartiennent à deux familles Halobacteroidaceae et
Haloanaerobiaceae (Oren, 1984 ; Rainey et al., 1995). Des bactéries sulfato-réductrices
ont également été isolées. Elles sont représentées par des halophiles modérées appartenant
aux genres : Desulfovibrio (Krekeler et al ., 1997), Desulfobacter (Brandt & Ingvorsen,
1997), Desulfotomaculum (Tardy-Jacquenod et al., 1998), et Desufohalobium,
Desulfohalobium retbanse (Ollivier et al., 1994). Ces bactéries vivent dans les sédiments
noirs, les sols hypersalés ainsi que dans les eaux salées souterraines. La famille des
Halomonadaceae constitue probablement le groupe le plus important des bactéries
hétérotrophes aérobies isolées des lacs neutrophiles et sodés (Ventosa et al., 1998).
Enfin, des bactéries photosynthétiques halophiles (cyanobactéries et bactéries phototrophes
anoxygéniques) ont été quelquefois isolées de la surface des sédiments de milieux
hypersalés où elles forment un tapis microbien. Les cyanobactéries unicellulaires forment
une couche brune à la surface des sédiments (DasSarma, 2001). Les bactéries phototrophes
anoxygéniques forment une couche pourpre au dessous de celle des cyanobactéries
(Caumette et al., 1994 ; Sørensen et al., 2004). La majorité des isolats de bactéries pourpre
appartiennent aux genres Halorhodospira, Roseospira, Halochromatium et Thiohalocapsa
(Guyoneaud et al ., 1998 ; Imhoff & Suling, 1996 ; Imhoff et al., 1998a ; Imhoff et al.,
1998b). Des espèces alcalophiles de Halorhodospira et une espèce d’actinomycète
halophile extrême (Actinopolyspora halophila) ont été isolées de nombreux lacs natronés
en Afrique central et en Egypte (Johnson, 1986).