(Thèse partie 1)

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8 Revue bibliographique Figure 4. Arbre phylogénétique universel issu d’une analyse comparative des séquences de gènes ribosomaux. Les groupes phylogénétiques contenant des membres halotolérants et halophiles (croissent bien à 100 gl -1 ) sont indiquées en lignes gras (Oren, 2002a).
9 Revue bibliographique De nombreuses définitions ont été données dans la littérature pour qualifier les termes halotolérant et halophile. Elles sont basées sur la réponse de la croissance des microorganismes en présence de chlorure de sodium (NaCl). Il est toutefois très difficile d’établir des limites qui définissent l’halophilisme et l’halotolérance car de nombreux facteurs comme la température, la concentration et la présence de certains nutriments, et ou la présence d’autres sels, modifient considérablement la réponse des bactéries au NaCl. Le terme « halophile » désigne les microorganismes nécessitant la présence de sel (NaCl) dans le milieu pour leur croissance. En revanche, le terme « halotolérant » signifie que les microorganismes tolèrent différentes concentrations en sel durant leur croissance. Les bactéries nécessitant moins de 1 % (p/v) de sel pour une croissance optimale nesont pas considérées comme halophiles. En 1962, Larsen a définit 3 catégories de bactéries halophiles selon la concentration en sel qui amène à une croissance optimale des microorganismes (Bertrand & Larsen, 1989). Cette concentration peut varier de 1 à 6 % (p/v) pour les bactéries faiblement halophiles, de 3 à 15 % (p/v) pour les bactéries halophiles modérées et jusqu’à 15-30 % (p/v) pour les bactéries halophiles extrêmes. Par ailleurs, les bactéries halotolérantes acceptent des concentrations modérées de sels mais non obligatoires pour leur croissance. Les domaines de croissance de ces 3 catégories d’organismes halophiles sont représentés schématiquement sur la Figure 5 (Larsen, 1962). Figure 5. Les différents groupes de microorganismes halophiles (Larsen, 1962).
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