(Thèse partie 1)

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Annexe 8. Séquences des gènes d´ARNr des souches isolées Séquence de l’ADNr 16S de la souche 5.1 (Halorubrum ezzemoulense sp. nov.) Annexes CCTATGGGACGATTTAGCCATGCTAGTCGCACGAGTTCAGACTCGTGGCGAATAGTCCATTAACACGGAGGAAAA AACTACCCTTCGGAACACAATACCCTCTCCGAAACTGAGGCTAATAGTGTATACCATACCACCACTGGAATGAGT GGTATGCCAAACGCTCCGGCGCCGAAGGATGTGGCTGCGGCCGATTAGGTAGACGGTGGGGTAACGGCCCACCGT GCCAATAATCGGTATGGGTCATGAGAGTGAGAACCCAGAGACGGAATCTGAGACAAGATTCCGGGCCCTACGGGG CGCAGCAGGCGCGAAACCTTTACACTGCACGACAGTGCGATAGGGGGATCCCAAGTGCACAGGCATAGCGCCTGT GCTTTTCGGTACCCTAAGGCGGTACCAGAATAAGGGCTGGGCAAGACCGGTGCCAGCCGCCGCGGTAATACCGGC AGCCCAAGTGATGGCCGATCTTATTGGGCCTAAAGCGTCCGTAGCTGGCCGCGCAAGTCCATCGGGAAATCCACC TGCTCAACAGGTGGGCGCCCGGTAGAAACTGCGTGGCTTGGGACCCGGAAGGCGCCGACCGGGTACGTCCCGGGT AGGAAGTGAATTCCCCGTAATCCTNGACGGANCCGCCGATGGCGAAAGCACGTCGCGAGAACGGATCCGACAGTG AGGGACGAAAAGCCAGGGTCTCGAACCGGATTAGATACCCGGGTAGTCCTGGCCGTAAACAATGTCTGCTAGGTG TGGCTCCCACTACGAGTGGGTGCTGTGCCGTAGGGAAGCCGCTAAGCAGACCGCCTGGGAAGTACGTCCGCAAGG ATGAAACTTAAAGGAATTGGCGGGGGAGCACTACAACCGGAGGAGCCTGCGGTTTAATTGGACTCAACGCCGGAC ATCTCACCAGCATCGACTGTAGTAATGACGATCAGGTTGATGACCTTATCCGAGCTTCAGAGAGGAGGTGCATGG CCGCCGTCAGCTCGTACCGTGAGGCGTCCTGTTAAGTCAGGCAACGAGCGAGACCCGCACCCTTACTTGCCAGCA GTACCGCGAGGTAGCTGGGGACAGTAGGGGGACCGCCGTGGCTAACACGGAGGAAGGAACGGGCAACGGTAGGTC AGTATGCCCCGAATGTGCTGGGCAACACGCGGGCTACAATGGTCGAGACAAAGGGTTCCAACTCCGAAAGGAGAC GGTAATCTCAGAAACTCGATCGTAGTTCGGATTGTGGGCTGCAACTCGCCCACATGAAGCTGGATTCGGTAGTAA TCGCGTGTCACAAGCGCGCGGTGAATNCGTCCCCTGCTCCTNGAACACACCGCCCGTCAAAGCACCCGATTTTCT CCCGGATGAGNGAGTACCTCGTACGTCGAATCTGGGCTNCGCAAGGGGGCTAAGT Les bases qui n’ont pas donné de lecture précise (identifié par N) lors du séquençage du produit PCR. Séquence de l’ADNr 16S de la souche 1’2 GGGGTCAGATTTAGCCATGCTAGTCGCACGAGNTTCAGGACTCGTGGCATAATCCTCCTTAGTAACACGGGAAAA AAAACTACCCTTCGGAAGCGACGATACCCTTCCCGAAACTGGAGGGGAATAATGCATATCACTCTCCAGCTGGAA TGAGGATTGAGTCAAACGCTCCGGCGCCGAAGGATGTGGCTGCGGCCGATTAGGTAGACGGTGGGGTAACGGCCC ACCGTGCCAATAATCGGTACGGGTCATGAGAGTGAGAACCCGGAGACGGAATCTGAGACAAGATTCCGGGCCCTA CGGGGCGCAGCAGGCGCGAAACCTTTACACTGCACGACAGTGCGATAAGGGAATCCCAAGTGCGCAGGCATATAG TATGCGCTTTTGTACACCGTAGGGAGGTGTACGAATAAGGGCTGGGCAAGACCGGTGCCAGCCGCCGCGGTAATA CCGGCAGCCCGAGTGATGGCCGATCTTATTGGGCCTAAAGCGTCCGTAGCTGGCCGCACAAGTCCATCGGAAAAT CCACCCGCCCAACGGGTGGGCGTCCGGTGGAAACTGTGTGGCTTGGGACCGGAAGGCGCGACGGGTACGTCCGGG GTAGGAGTGAAATCCCGTAATCCTGGACGGACCGCCGATGGCGAAAGCACGTCGAGAGGACGGATCCGACAGTGA GGGACGAAAGCCAGGGTCTCGAACCGGATTAGATACCCCCGGATTAGATACCCGGGTAGTCCTGGCTGTAAACAA TGCCTTATAGGTGTGGCTCCCCCTACGAGCGGGTGCTGTGCTGTAGGGAAGCCGATAAGCAGCCCCCCTGGGAAG TATGTCCGCAAGGATGAAATTTAAAGGAATGGGCGGGGGAGCACTACACCCGGAGGAGCCTGCGGTTTAATTGGT CTAAACGCGGGACATCTCACCAGCATCGACTGTAGTAATGACGCCCAGGTTGATGACTTTGTCCGAGTTTCAGAG AGGAGGTGCATGCCCGCCTTCAGCTCGTACCGTGAGGCGTCCTGTTAATTCAGGCAACGAGCGAGACCCGCATCC TTACTTCCCACCAGCACTGCGAAGTGGCTGGGGACAGTAGGGAGACCGCCGTGGCCAACACGGAGGAAGGAACGG GCAACGGTAGGTCAGTATGCCCCGAATGTGCTGGGCAACACGCGGGCTACAATGGTCGAGACAAAGGGTTCCAAC TCCGAAAGGAGACGGTAATCTCAGAAACTCGATCTTAGTTCGGATTGTGGGCTACAACTCGCCCCCAGGAAGCTG GATTCGGTAGTAATCGTGTTTCACAAGCGCCCGGTGAATACTTCCTTGTTCTTTCCACGCACCGCCCTTCAAACC ACCCGAGTGAGTTCCGGATAAGGCAGGATGCCACGTGTCGAATCTGGGCTTCGCAAGGGGGCTTAAGTCGAACAA GGAGC Séquence de l’ADNr 16S de la souche 4’1 ATATAGAATGCTAGCTGCACGAGTTCACACTCGTGGCGAATTTCCCAGTAACACGAGAAAAAACTACCCTACAGA GAACGATAACCTTCCGAAACTGAGGGAAAAAGTTCATACGGGAGTCATGCTGGAATGCCGACTCCCCGAAACGCT CAGGCGCTGTAGGATGTGGATGCGAAGGATTAGGTAGACGGTGGGGTAACGGACCAGCGTGCCGATAATCGGTAC GTATTGTGAGAGCAAGAGCCCGGAGACGGAATCTGAGACAAGATTCCGGGCCCTACGGGGCGCAGCAGGCGCGAA ACCTTTACACTGCACGCAAGTGCGATAAGGGGACCCCAAGTGCGAGGGCATATAGTCCTCGCTTTTCTCGACTGT AAGGCGGTCGAGGAATAAGAGCTGGGCAAGACCGGTGCCAGCCGCCGCGGTAATACCGGCAGCTCAAGTGATGAC CGATATTATTGGGCCTAAAGCGTCCGTAGCCGGCCACGAAGGTTCATCGGGAAATCCGCCAGCTCAACTGGTGGG
Annexes CGTCCGGTGAAAACCACGTGGCTTGGGACCGGAAGGATCGAGGGGTACGTCCGGGGTAGGAGTGAAATCCCGTAA TCCTGGACGGACCACCGATGGCGAAAGCACCTCGAGAAGACGGATCCGACGGTGAGGGACGAAAGCTAGGGTCTC GAACCGGATTAGATACCCGGGTAGTCCTAGCTGTAAACGATGCTCGCTAGGTGTGACACAGGCTACGAGCCTGTG TTGTGCCGTAGGGAAGCCGAGAAGCGAGCCGCCTGGGAAGTACGTCCGCAAGGATGAAACTTAAAGGAATTGGCG GGGGAGCACTACAACCGGAGGAGCCTGCGGTTTAATTGGACTCAACGCCGGACATCTCACCAGCTCCGACTATAG TAATGACGGTCAGGTTGATGACCTTATCACGACGCTATAGAGAGGAGGTGCATGGCCGCCGTCAGCTCGTACCGT GAGGCGTCCTGTTAAGTCAGGCAACGAGCGAGACCCGCACTTCTAATTGCCAGCAGCAGTTTCGACTGGCTGGGT ACATTAGAAGGACTGCCGCTGCTAAAGCGGAGGAAGGAACGGGCAACGGTAGGTCAGTATGCCCCGAATGAGCTG GGCTACACGCGGGCTACAATGGTCGAGACAATGGGTTGCTATCTCGAAAGAGAACGCTAATCTCCTAAACTCGAT CGTAGTTCGGAGTGAGGGCTGAAACTCGCCCTCATGAAGCTGGATTCGGTAGTAATCGCATTTCAATAGAGTGCG GTGAATACGTTTCTTCCTCCCTTGCACGGGAAAGCCCGTCAAAGCACCCGAGTGAGTTTTTTTCCTAGTCCAAGG AGATCGGTGGTCGAATCTGGGCTTCGCAAGGGGGCTTAAGTCGAACAACGGGCCGCG Séquence de l’ADNr 16S de la souche S1 GTTCGGAGTCGATTTAGCCATGCTAGTTGCACGAGTTCAGACTCGTAGCATATANCTNAGTAACACGTGAGAACA AACTACCCTACAGACCGCAATAACCTCCCGGAAACTGGAGGCCAATAGCGGATATAACTCTCATGCTGGAGTGCC GAGAGATAGAAATGTTCCGGCGCTGTAGGATGTGGCTGCGGCCGATTAGGTAGATGGTGGGGTAACGGCCCACCA TGCCGATAATCGGTACAGGTTGTGAGAGCAAGAGCCTGGAGACGGTATCTGAGACAAGATACCGGGCCCTACGGG GCGCAGCAGGCGCGAAACCTTTACACTGCACGACAGTGCGATAGGGGGACTCCGAGTGTGAGGGCATATAGCCCT CGCTTTTCTGAACCGTAAGGTGGTACAGGAACAAGGACTGGGCAAGACCGGTGCCAGCCGCCGCGGTAATACCGG CAGTCCAAGTGATGGCCGATATTATTGGGCCTAAAGCGTCCGTAGCTTGCTGTGTAAGTCCATTGGGAAATCGAC CAGCTCAACTGGTCGGCGTCCGGTGGAAACTACACAGCTTGGGGCCGAGAGACTCAACGGGTACGTCCGGGGTAG GAGTGAAATCCTGTAATCCTGGACGGACCACCAATGGGGAAAACCACGTTGAGAGTCCGGACCCGACAGTGAGGG ACGAAAGCCAGGGTCTCGAACCGGATTAGATACCCGGGTAGTCCTGGCTGTAAACAATGCTCGCTAGGTATGTCA CGGGCCATGAGCACGTGATGTGCCGTAGTGAAGACGATAAGCGAGCCGCCTGGGAAGTACGTCCGCAAGGATGAA ACTTAAAGGAATTGGCGGGGGAGCACCACAACCGGAGGAGCCTGCGGTTTAATTGGACTAAACGCCGGAAATCTC ACCGGTCCCGACAGTAGTAATGACAGTCAGGTTGACGACTTTACTCGACGCTACTGAGAGGAGGTGCATGGCCGC CGTCAGCTCGTACCGTGAGGCGTCCTGTTAAGTCAGGCAACGAGCGAGACCCACACTTCTAGTTGCCAGCAACAC CCTTGAGGTAGTTGGGTACACTAGGAGGACTGCCGCTGCTAAAGCGGAGGAAGGAATGGGCAACGGTAGGTCAGT ATGCCCCGAATGGACCGGGCAACACGCGGGCTACAATGGCTCTGACAGTGGGATGCGACGCCGAGAGGCGAAGCT AATCTCCAAACGGAGTCGTAGTTCGGATTGCGGGCTGAAACCCGCCCGCATGAAGCTGGATTCGGTAGTAATCGC GTGTCAGAAGCGCGCGGTGAATACGTTTCTTCCTCCCTTGCAGCGGGAAAACCCGTCAAAGCACCCGAGTGGGGT TTTTTTCTCCAGGCCGAGGAGGCGACGGTCGAATCTGGGCTCCGCAAGGGGGCTTAAGTCGTAATCAACGAGCC Séquence de l’ADNr 16S de la souche B2 (Salicola salis sp. nov.) GTTTGATCATGGCTCAGATTCTAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGGCAGCAGGCCCTCCGG GGTGCTGGCGAGCGGCGGACGGGTGAGTAATGCATGGGAACTTACCCAGTAGTGGGGGATAGCCCGGGGAAACCC GGATTAATACCGCATACGCCCTGAGGGGGAAAGCGGGCTCCGGCTCGCGCTATTGGATGGGCCCATGTCGGATTA GTTTGTTGGTGAGGTAACGGCTTACCAAGGCGACGATCCGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACCGGGA CTGAGACACGGCCCGGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGGGCAACCCTGATCCAGCC ATGCCGCGTGTGTGAAGAAGGCCTTTGGGTTGTAAAGCACTTTCAGCAGGGAGGAAAAGCTGGTCGCTAATACCG GCCAGTGTTGACGTTACCTGCAGAAGAAGCACCGgCtAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCA AGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGGGCGCGTAGGCGGTTTGATAAGCGGCTTGTGAAAGCCCCGGGCTCA ACCTGGGAATTGCAATCCGAACTATCAGGCTAGAGTGCAGCAGAGGGCAGTGGAATTCCCGGTGTAGCGGTGAAA TGCGTAGATATCGGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTGCCTGGGCTGACACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCG TGGGTAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCTGTAAACGTTGAGAACTAGTCGTTGGGGCTATTAGA GCCTTAGTGACGCAGCTAACGCGATAAGTTCTCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAANACTCAAATGAATT GACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGACGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACA TCCTGCGAAACTTGCTAGAGATAGCTTGATGCCTTCGGGAGCGCAGTGACAGGTKCTGCATGGCCGTCGTCAGCT CGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCTTGTCCTCAGTTACCAGCACTTCGGGTGGGC ACTCTGGGGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAGGTCATCATGGCCCTTACGGCCAG GGCTACACACGTGCTACAATGGGGCGTACAGAGGGCAGCGAGTGCGCGAGCGCAAGCGAATCCCTTAAAGCGTCT CTCAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCAGATCAGAATGCTGCG GTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACAACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGACTGCACCAGAAGCGGTTAGTCTA ACCTTCGGGAGGACGATCGCCACGGTGTGGTTCACGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACC TGCGGCTGGATCACCTCCTTAAA
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N° d’ordre : 79 / T.E / 2007 Sé
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Résultats et discussion 1. Analyse
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Nom : KHARROUB Date de soutenanace
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Remerciements Avant toute chose, je
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Listes des figures Figure 1. Habita
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Tableau 31. Taux d’hybridations A
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A ADN ADNr 16S ARN ARNr ARNt ATP Aw
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1 Introduction générale En dehors
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3 Introduction générale position
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33 Revue bibliographique génome d
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4. 3. Physiologie 37 Revue bibliogr
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39 Revue bibliographique A l’exce
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41 Revue bibliographique nucléotid
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43 Revue bibliographique famille de
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5. Biotechnologies des procaryotes
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53 Revue bibliographique culture re
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1. Echantillonnage 59 Matériel et
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Technique 1 (Marmur, 1961) 69 Maté
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3. 7. 3. Détermination du contenu
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Tableau 9. Cycles employés. Paires
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79 Matériel et Méthodes doubles b
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81 Résultats et discussion Le but
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1. Morphologie des souches d’halo
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85 Chapitre 1 : Résultats et discu
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Tableau 14. Croissance à différen
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Tableau 16. Spectre de température
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Tableau 18. Utilisation des sucres.
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Tableau 22. Production d’acides
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Tableau 23. Caractérisation biochi
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Tableau 24. Résultats de la sensib
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5. Chimiotaxinomie 5. 1. Analyse de
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109 Chapitre 1 : Résultats et disc
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Absorbance (D.O.) 0,095 0,085 0,075
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Tableau 28. Affiliation phylogéné
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0,02 26 37 31 85 55 100 127 Chapitr
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Description de Halorubrum ezzemoule
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0,02 145 Chapitre 1 : Résultats et
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