(Thèse partie 1)

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Annexes Annexe 1 :Tableau 2. Classification des haloarchaea (Archaea, Euryarchaeota, Halobacteria, Halobacteriales, Halobacteriaceae). Genre Espèce type Références Halobacterium Halobacterium salinarum (Elazari-Volcani, 1957) Haloarcula Haloarcula vallismortis (Ganzalez et al., 1978 ; Torreblanca et al., 1986) Halobaculum Halobaculum gomorrense (Oren et al., 1995) Halococcus Halococcus morrhuae (Klebahn, 1919 ; Kocur & Hodgkiss, 1973) Haloferax Haloferax volcanii (Mullakhanbhai & Larsen, 1975 ; Torreblanca et al., 1986) Halogeometricum Halogeometricum borinquense (Montalvo-Rodriguez et al., 1998) Halorubrum Halorubrum saccharovorum (Tomlinson & Hochstein, 1976 ; McGenity & Grant, 1995) Haloterrigena Haloterrigena turkmenica (Zvyagintseva & Tarasov, 1987; Ventosa et al., 1999) Natrialba Natrialba asiatica (Kamekura & Dyall-Smith, 1995) Natrinema Natrinema pellirubrum (McGenity et al., 1998) Natronobacterium Natronobacterium gregoryi (Tindall et al., 1984) Natronococcus Natronococcus occultus (Tindall et al., 1984) Natronomonas Natronomonas pharaonis (Soliman & Trüper, 1982 ; Kamekura et al., 1997) Natronorubrum Natronorubrum bangense (Xu et al., 1999) Halomicrobium Halomicrobium mukohataei (Oren et al., 2002b) Halorhabdus Halorhabdus uthensis (Wainø et al., 2000) Halosimplex Halosimplex carlsbadense (Vreeland et al., 2002) Halobiforma Halobiforma haloterrestris (Hezayen et al., 2002) Halalkalicoccus Halalkalicoccus tibetensis (Xue et al., 2005) Natronolimnobius Natronolimnobius baerhuensis (Itoh et al., 2005) Halovivax Halovivax asiaticus (Castllo et al., 2006a) Halostagnicola Halostagnicola larsenii (Castillo et al., 2006b) Haladapdatus Haladaptatus paucihalophilus (Savage et al., 2007)
Annexe2 : Tableau 4. Bactéries halophiles associées aux environnements hypersalins. Affiliation Espèces Références Sources Proteobacteria -Proteobacteria Rhodobacterales Rhodobacteraceae -Proteobacteria Oceanospirillales Alcanivoraceae Halomonadaceae Saligiper mucescens Palleronia marismortui Antarctobacter heliothermus Halovibrio denitrificans* Halospina denitrificans* Salicola marasensis* Alcanivorax borkumensis Halomonas elongata Halomonas subglaciescola Halomonas meridiana Halomonas halodurans Halomonas halmophila Halomonas eurihalina Halomonas salina Halomonas halodenitrificans Halomonas pantelleriensis Halomonas desiredata Halomonas campisalis Halomonas maura Halomonas magadii Halomonas marisflavae Halomonas glaciei Halomonas halocynthiae Halomonas ventosae Halomonas anticariensis Halomonas neptunia Halomonas sulfidaeris Halomonas axialensis Halomonas hydrothermalis Halomonas boliviensis Chromohalobacter marismortui Chromohlbacter canadensis Chromohalobacter israeliensis Chromohalobacter salexigens Cobetia marina (Martinez-Cánovas et al., 2004a) (Martinez-Checa et al., 2005) (Labrenz et al., 1998) (Sorokin et al., 2006) (Sorokin et al., 2006) (Maturrano et al., 2006b) (Yakimov et al., 1998) (Vreeland et al., 1980) (Franzmann et al., 1987) (James et al., 1990) (Hebert & Vreeland, 1987) (Dobson et al., 1990) (Quesada et al., 1990) (Valderrama et al., 1991) (Dobson & Franzmann, 1996) (Romano et al., 1996) (Berendes et al.,1996) (Mormile et al., 1999) (Bouchotroch et al., 2001) (Duckworth et al., 2000) (Yoon et al., 2001) (Reddy et al., 2003) (Romanenko et al., 2002) (Martinez-Cánovas et al., 2004b) (Martinez-Cánovas et al., 2004d) (Kaye et al., 2004) (Kaye et al., 2004) (Kaye et al., 2004) (Kaye et al., 2004) (Quillaguamán et al., 2004) (Ventosa et al., 1989) (Arahal et al, 2001a) (Arahal et al., 2001a) (Arahal et al., 2001b) (Arahal et al., 2002) Sol salé Sol salé Annexes Lac hypersalé Ekho (Antarctique) Lac salé (Sibérie) Lac salé (Sibérie) Salines (Pérou) Eau marines Salines (Espagne) Lac hypersalé (Antarctique) Lac hypersalé (Antarctique) Estuaire Mer Morte Salines (Espagne) Salines (Espagne) Salines Lac natroné (Kenya) Lac hypersalé (Antarctique) Lac natroné (Washington) Salines (Maroc) Lac natroné, Magadi (Kenya) Eau marine Lac hypersalé (Antarctique) Eau marines Sol salé (Jaèn, Espagne) Sol salé (Málaga, Espagne) Sources chaudes océanique Sol salé (Bolivie) Mer Morte Salines Mer Morte Eaux marines (Espagne) Eaux marines (USA) Dead Sea Salines Salines
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