(Thèse partie 1)

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Résumés Remerciements Avant-propos Listes des figures Listes des tableaux Listes des annexes Listes des abréviations Introduction générale Revue bibliographique 1. Environnements hypersalins 1. 1. Généralités Sommaire 1. 2. Caractéristiques physico-chimiques des environnements hypersalins 1. 3. Diversité phylogénétique des halophiles 1. 4. Diversité moléculaire des halophiles 2. Adaptation moléculaire à l’halophilisme 2. 1. Adaptation à la salinité par production d’osmoprotecteurs 2. 2. Adaptation à la salinité par accumulation de KCl 3. Archaea halophiles extrêmes 3. 1. Généralités 3. 2. Taxinomie 3. 3. Structure et physiologie 3. 3. 1. La paroi cellulaire 3. 3. 2. Les lipides et la membrane cytoplasmique 3. 3. 3. Flagelles, vésicules à gaz et substances de réserves 3. 3. 4. ARN et ribosomes 3. 3. 5. Métabolisme 3. 3. 6. Production de halocines 3. 3. 7. Bactériorhodopsine et photosynthèse chez les haloarchaea Pages 1 4 4 4 6 7 11 13 13 14 16 16 18 18 18 20 23 24 25 28 28
3. 3. 8. Gènes et biologie moléculaire 4. Les bactéries halophiles aérobies 4. 1. Généralités 4. 2. Taxinomie et phylogénie 4. 3. Physiologie 4. 3. 1. Concentrations ioniques internes 4. 3. 2. Composés organiques compatibles 4. 3. 3. Enzymes 4. 3. 4. Membrane cytoplasmique 4. 4. Salinibacter ruber 4. 4. 1. Généralités 4. 4. 2. Analyse génomique et protéomique 4. 4. 3. Physiologie 4. 4. 4. Osmoadaptation 4. 4. 5. Rhodopsines 5. Biotechnologies de procaryotes halophiles 6. Méthodes pour décrire et accéder à la diversité microbienne 6. 1. Taxinomie et définition d’espèce 6. 1. 1. Taxinomie phénétique 6. 1. 2. Taxinomie numérique 6. 1. 3. Taxinomie phylogénétique 6. 1. 4. Taxinomie mixte et consensuelle 6. 2. L’approche culturale 6. 3. L’approche non culturale 6. 3. 1. Les techniques de quantification 6. 3. 2. Les biomarqueurs cellulaires 6. 3. 3. Les acides nucléiques 6. 4. L’analyse phylogénétique 6. 4. 1. Principe fondamentale 6. 4. 2. L’alignement Pages 30 35 35 36 36 38 38 40 41 42 42 43 43 43 44 45 47 47 48 48 48 50 50 51 51 51 52 53 53 54
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Description de Halorubrum ezzemoule
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Annexe 10. Courbes de quantificatio
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