(Thèse partie 1)

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Conclusion générale et Perspectives
souches archéennes, vu que la plupart des substrats tests ne sont pas utilisés comme source
unique de carbone, d’énergie et/ou d’azote. Par ailleurs, elles sont toutes aérobies strictes, mis
à part quelques souches qui possèdent en plus la capacité de réduire les nitrates en
anaérobiose et/ou de fermenter l’arginine. Cette dernière propriété est propre au genre
Halobacterium. Nous reconnaissons que l’analyse des lipides polaires membranaire par
chromatographie sur couche mince, au niveau de la classification en genres, est la méthode la
plus simple, la plus rapide qui a permis de regrouper les isolats archéens dans les genres
Halobacterium, Haloarcula, Halobaculum, Halococcus, Haloferax, Halorubrum et
Haloterrigena, membres de la famille des Halobacteriaceae. Par ailleurs, une majorité des
souches isolées est retrouvée dans le genre Halorubrum. Quand au séquençage de l’ADNr
16S a donné un élan supplémentaire dans la taxinomie et a permis d’établir des relations de
parenté entre nos séquences et celles de la base de données Genbank.
Cette étude a permis également la description de deux souches bactériennes halophiles,
aérobies et affiliées aux groupes des Gamma-Proteobacteria. La première est apparentée aux
espèces halophiles extrêmes alors que la seconde est intimement liée aux espèces halophiles
modérées de la famille des Halomonadaceae.
Au sein de la collection de microorganismes, archées et bactéries halophiles qui a été
constituée, certaines souches se sont révélées taxinomiquement intéressantes. Des études
d’homologies ADN-ADN ont donc été entreprises afin de déterminer leur positon exact car ce
test permet de classifier les souches sans aucune ambiguïté. Sur la base des résultats obtenus,
deux nouvelles espèces appartenant à l’ordre archéens des Halobacteriales et à l’ordre
bactérien des Oceanospirillales ont été ainsi décrites.
La première nommée Halorubrum ezzemoulense (sp. nov.), a fait l’objet d’une
caractérisation (Kharroub et al., 2006).
La seconde espèce décrite appartenant aux Gamma-Proteobacteria appelée Salicola salis
(sp. nov.) (Kharroub et al., 2006).
Ces deux procaryotes sont des hétérotrophes halophiles extrêmes. Outre l’intérêt lié à leur
position taxinomique nouvelle, Halorubrum ezzemoulense produit un exopolymère. Aussi,
Salicola salis est la première bactérie halophile extrême isolée dans le continent africain.