(Thèse partie 1)

More documents

Recommendations

Info

160 Chapitre 2 : Résultats et discussion Les résultats de l’analyse par «bootstrap» permettent de vérifier la constance de la répartition des souches à l’intérieur d’un même groupement. Une valeur de «bootstrap» de 100 est trouvée entre la séquence de B2 et celle de Salicola marasensis CECT 7107 T . Il en ait de même de la souche 5-3 avec la souche Halomonas halmophila ATCC 19717 T . Cette valeur indique que 100 % des répétitions ont fourni une répartition identique à l’intérieur d’un clade. Le Tableau 38 représente les distances de Tamura-Nei, prenant en compte les transitions et les transversions, calculées à partir des séquences d’ADNr 16S. Les distances sont comprises entre 0,0025 et 1,0449. la distance minimale (0,0025) est trouvée pour la comparaison de la séquence B2 à celle de Salicola marasensis CECT 7107 T et la séquence de la souche 5-3 à celle de Halomonas halmophila ATCC 19717 T . C’est un résultat attendu vu le pourcentage de similitude élevé observé entre les séquences de la petite sous unité ribosomale. La séquence de Bacillus subtilis ATCC 6633 T est celle présentant les distances les plus élevées par rapport aux autres séquences. En outre, la même distance a été obtenue entre deux souches décrites comme des espèces différentes, Halomonas salina ATCC 49509 T et Halomonas ventosae DSM 15911 T (Tableau 38). Mais cette étroite parentée ne peut confirmer l’inclusion de ces souches dans les espèces déjà décrites. Il est connu que des espèces peuvent avoir des équences des ARNr 16S très proches et être différentes par hybridation ADN-ADN (Dijkshoorn et al., 2000). Ils serait donc nécessaire d’effectuer une étude d’homologie ADN-ADN afin d’établir la position taxinomique exacte de ces souches.
161 Chapitre 2 : Résultats et discussion Tableau 39. Taux d’hybridation ADN-ADN de la souche B2 et espèces proches. Souches Absorbance ADN (pg) S = s × 5 D = d × 2 B2 1s 0,545 177 885 B2 1d 0,620 552 1104 B2 2s 0,537 137 685 B2 2d 0,644 672 1344 1 1s 0,635 627 3135 1 1d 0,551 206 414 1 2s 0,686 882 4410 1 2d 0,542 162 324 2 1s 0,570 302 1510 2 1d 0,589 397 794 2 2s 0,558 242 1210 2 2d 0,550 202 404 3 1s 0,605 477 2385 3 1d 0,575 327 654 3 2s 0,561 257 1285 3 2d 0,543 167 334 4 1s 0,619 547 2735 4 1d 0,552 212 424 4 2s 0,637 637 3185 4 2d 0,565 277 554 S + D BR (%) RBR (%) 1989 55,50 2029 66,24 100 3549 11,66 17,60 4734 6,84 10,32 2304 34,52 52,11 1614 25,03 37,78 3039 25,03 32,48 1619 20,63 31,14 3359 13,42 20,25 3739 14,81 22,35 1, Pseudomonas halophila DSM 3050 T ; 2, Salicola marasensis CECT 7107 T ; 3, Halovibrio denitrificans DSM 15503 T ; 4, Halospina denitrificans DSM 15505 T . s, simple brin ; d, double brin. BR % = (D/ S + D) × 100 et RBR % = valeur × 100/BR %.
Page 1 and 2:
N° d’ordre : 79 / T.E / 2007 Sé
Page 3 and 4:
3. 3. 8. Gènes et biologie molécu
Page 5 and 6:
Résultats et discussion 1. Analyse
Page 7 and 8:
Nom : KHARROUB Date de soutenanace
Page 9 and 10:
Remerciements Avant toute chose, je
Page 11 and 12:
Listes des figures Figure 1. Habita
Page 13 and 14:
Figure 36. Photomicrographies élec
Page 15 and 16:
Tableau 31. Taux d’hybridations A
Page 17 and 18:
A ADN ADNr 16S ARN ARNr ARNt ATP Aw
Page 19 and 20:
1 Introduction générale En dehors
Page 21 and 22:
3 Introduction générale position
Page 23 and 24:
5 Revue bibliographique Figure 2. L
Page 25 and 26:
7 Revue bibliographique majorité d
Page 27 and 28:
9 Revue bibliographique De nombreus
Page 29 and 30:
11 Revue bibliographique Au sein de
Page 31 and 32:
13 Revue bibliographique Antón et
Page 33 and 34:
15 Revue bibliographique La seconde
Page 35 and 36:
17 Revue bibliographique C’est un
Page 37 and 38:
19 Revue bibliographique L’organi
Page 39 and 40:
21 Revue bibliographique essentiell
Page 41 and 42:
23 Revue bibliographique mannosyl-6
Page 43 and 44:
25 Revue bibliographique tandis que
Page 45 and 46:
27 Revue bibliographique La présen
Page 47 and 48:
29 Revue bibliographique c’est la
Page 49 and 50:
3. 3. 8. Gènes et biologie molécu
Page 51 and 52:
33 Revue bibliographique génome d
Page 53 and 54:
35 Revue bibliographique de transpo
Page 55 and 56:
4. 3. Physiologie 37 Revue bibliogr
Page 57 and 58:
39 Revue bibliographique A l’exce
Page 59 and 60:
41 Revue bibliographique nucléotid
Page 61 and 62:
43 Revue bibliographique famille de
Page 63 and 64:
5. Biotechnologies des procaryotes
Page 65 and 66:
47 Revue bibliographique trouvé un
Page 67 and 68:
49 Revue bibliographique siècle po
Page 69 and 70:
51 Revue bibliographique classifica
Page 71 and 72:
53 Revue bibliographique culture re
Page 73 and 74:
55 Revue bibliographique hypothèse
Page 75 and 76:
57 Revue bibliographique Figure 12.
Page 77 and 78:
1. Echantillonnage 59 Matériel et
Page 79 and 80:
Figure 15. Photographies in situ de
Page 81 and 82:
Tableau 6. Souches de référence u
Page 83 and 84:
65 Matériel et Méthodes Les milie
Page 85 and 86:
67 Matériel et Méthodes 20 ml de
Page 87 and 88:
Technique 1 (Marmur, 1961) 69 Maté
Page 89 and 90:
3. 7. 3. Détermination du contenu
Page 91 and 92:
Tableau 9. Cycles employés. Paires
Page 93 and 94:
75 Matériel et Méthodes Les align
Page 95 and 96:
77 Matériel et Méthodes * : la so
Page 97 and 98:
79 Matériel et Méthodes doubles b
Page 99 and 100:
81 Résultats et discussion Le but
Page 101 and 102:
1. Morphologie des souches d’halo
Page 103 and 104:
85 Chapitre 1 : Résultats et discu
Page 105 and 106:
Page 107 and 108:
Tableau 14. Croissance à différen
Page 109 and 110:
Tableau 15. Croissance à différen
Page 111 and 112:
Tableau 16. Spectre de température
Page 113 and 114:
Tableau 18. Utilisation des sucres.
Page 115 and 116:
Tableau 19. Utilisation des alcools
Page 117 and 118:
Page 119 and 120:
Tableau 22. Production d’acides
Page 121 and 122:
Tableau 23. Caractérisation biochi
Page 123 and 124:
Tableau 24. Résultats de la sensib
Page 125 and 126:
5. Chimiotaxinomie 5. 1. Analyse de
Page 127 and 128: 109 Chapitre 1 : Résultats et disc
Page 131 and 132: Absorbance (D.O.) 0,095 0,085 0,075
Page 137 and 138: Tableau 28. Affiliation phylogéné
Page 145 and 146: 0,02 26 37 31 85 55 100 127 Chapitr
Page 157 and 158: Description de Halorubrum ezzemoule
Page 163 and 164: 0,02 145 Chapitre 1 : Résultats et
Page 177: 159 Chapitre 2 : Résultats et disc
Page 183 and 184: 165 Conclusion générale et Perspe
Page 185 and 186: 167 Conclusion générale et Perspe
Page 187 and 188: 169 Références bibliographiques A
Page 189 and 190: 171 Références bibliographiques C
Page 191 and 192: 173 Références bibliographiques g
Page 193 and 194: 175 Références bibliographiques G
Page 195 and 196: 177 Références bibliographiques I
Page 197 and 198: 179 Références bibliographiques K
Page 199 and 200: 181 Références bibliographiques L
Page 201 and 202: 183 Références bibliographiques M
Page 203 and 204: 185 Références bibliographiques O
Page 205 and 206: 187 Références bibliographiques R
Page 207 and 208: 189 Références bibliographiques g
Page 209 and 210: 191 Références bibliographiques V
Page 211 and 212: 193 Références bibliographiques X
Page 213 and 214: Annexe2 : Tableau 4. Bactéries hal
Page 215 and 216: Tableau 4. Bactéries halophiles as
Page 217 and 218: 80 ml de la solution A 40 ml d’ac
Page 219 and 220: Tableau 10. Origine des séquences
Page 221 and 222: Annexes CGTCCGGTGAAAACCACGTGGCTTGGG
Page 223 and 224: Séquence de l’ADNr 16S de la sou
Page 225 and 226: Annexes CATCGGGAAATCCGCGCGCTTATCTCT
Page 227 and 228: Tableau 27. Caractéristiques diff
Page 229:
Annexe 10. Courbes de quantificatio
show all

(Thèse partie 1)

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

Delete template?

Save as template?