(Thèse partie 1)

159
Chapitre 2 : Résultats et discussion
Tableau 38. Matrice de distances génétiques bactériennes calculées selon Tamura-Nei du
programme Mega 3.
S 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11
1
2 0,0248
3 0,0407 0,0389
4 0,0025 0,0240 0,0434
5 0,0398 0,0318 0,0292 0,0425
6 0,1365 0,1324 0,1324 0,1374 0,1333
7 0,1218 0,1227 0,1051 0,1247 0,1129 0,1295
8 0,0887 0,0925 0,0740 0,0916 0,0802 0,1433 0,1219
9 0,1227 0,1238 0,1002 0,1257 0,1100 0,1257 0,0451 0,1139
10 0,1355 0,1314 0,1283 0,1364 0,1333 0,0051 0,1265 0,1443 0,1236
11 0,1323 0,1304 0,1202 0,1332 0,1313 0,0222 0,1235 0,1433 0,1196 0,0170
12 0,1124 0,1104 0,0946 0,1154 0,0947 0,0878 0,0904 0,1051 0,0791 0,0849 0,0848
13 0,1160 0,1090 0,1022 0,1169 0,1138 0,1098 0,1002 0,1257 0,1060 0,1079 0,1129
14 0,1179 0,1140 0,0972 0,1209 0,1011 0,0955 0,1077 0,1170 0,0963 0,0918 0,0877
15 0,1343 0,1293 0,1211 0,1352 0,1302 0,0328 0,1275 0,1483 0,1236 0,0328 0,0398
16 0,1300 0,1209 0,1101 0,1309 0,1209 0,1039 0,1041 0,1298 0,1121 0,1030 0,1059
17 0,0381 0,0371 0,0025 0,0407 0,0275 0,1334 0,1052 0,0736 0,0993 0,1293 0,1212
18 0,0579 0,0524 0,0469 0,0570 0,0597 0,1281 0,1219 0,0934 0,1208 0,1240 0,1230
19 0,0580 0,0543 0,0451 0,0571 0,0579 0,1312 0,1129 0,0839 0,1089 0,1292 0,1240
20 0,0580 0,0543 0,0451 0,0571 0,0590 0,1312 0,1129 0,0839 0,1089 0,1292 0,1240
21 0,9877 0,9798 1,0019 0,9847 0,9847 1,0194 1,0037 1,0098 1,0449 1,0141 1,0342
22 0,1333 0,1283 0,1191 0,1342 0,1292 0,0319 0,1265 0,1451 0,1227 0,0319 0,0390
S, souche; 1, Souche 5-3 ; 2, Halomonas eurihalina ATCC 49336 T ; 3, Halomonas salina
ATCC 49509 T ; 4, Halomonas halmophila ATCC 19717 T ; 5, Halomonas organivorans G-
16.1 T ; 6, Pseudomonas halophila DSM 3050 T ; 7, Microbulbifer maritimus TF-17 T ; 8,
Zymobacter palmae T109T ; 9, Microbulbifer elongata DSM 6810T ; 10, Halovibrio
denitrificans DSM 15503T ; 11, Halospina denitrificans DSM 155507 T .
Tableau 38. Matrice de distances génétiques bactérienne calculée selon Tamura-Nei du
programme Mega 3 (suite).
S 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21
12
13 0,1120
14 0,0461 0,1173
15 0,1976 0,1040 0,1033
16 0,1059 0,0562 0,1112 0,1101
17 0,0937 0,1013 0,0972 0,1222 0,1091
18 0,1132 0,1110 0,1208 0,1189 0,1279 0,0442
19 0,1104 0,1131 0,1210 0,1260 0,1199 0,0424 0,0223
20 0,1104 0,1131 0,1210 0,1260 0,1199 0,0424 0,0223 0,0000
21 1,0141 1,0152 1,0393 1,0216 0,9684 0,9958 1,0110 1,0334 1,0334
22 0,1021 0,1021 0,1024 0,0025 1,0216 0,9684 0,9958 1,0110 1,0334 1,0334
12, Marinobacter lutaoensis JCM 11179 T ; 13, Alcanivorax venustensis 13974 T ; 14,
Marinobacter sedimentalis DSM 15400 T ; 15, souche B2 ; 16, Alcanivorax borkumensis DSM
11573 T ; 17, Halomonas ventosae DSM 15911 T ; 18, Chromohalobacter canadensis ATCC
43984 T ; 19, Chromohalobacter israelensis ATCC 43985 T ; 20, Halomonas elongata ATCC
33174 T ; 21, Bacillus subtilis ATCC 6633 T ; 22, Salicola marasensis CECT 7107 T .