(Thèse partie 1)

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146 Chapitre 1 : Résultats et discussion Alt-5 T , souche type de Haloalcaliphilum atacamensis, s, simple brin ; d, double brin. BR % = (D/ S + D) × 100 et RBR % = valeur × 100/BR %. L’étude d’homologie ADN-ADN a été effectuée avec la souche Alt-5 T de Haloalcaliphilum atacamensis. D’après la courbe étalon, la fonction de la droite est : Y = 0,00006 x + 0,2117. D’après les résultats du test d’homologie ADN-ADN (Tableau 34), le taux d’hybridation de la sonde avec l’ADN de l’haloarchaea Haloalcaliphilum atacamensis est relativement élevé (supérieur à 70 %). En accord avec le comité Ad Hoc, les deux souches devraient appartenir à la même espèce. Mais si on considère le pourcentage de similitude des séquences nucléiques, les deux souches ne peuvent appartenir à la même espèce. Tout ceci peut s’expliquer par un mauvais séquençage du 16S de l’ADNr de l’haloarchaea. En effet, la séquence du gène de l’ARNr de Haloalcaliphilum atacamensis envoyée à GenBank comprend énormément de nucléotides ambigus. Par ailleurs, les résultats de l’analyse des lipides polaires de Haloalcaliphilum atacamensis ont indique la même composition que celle de la souche S3. En outre, toutes deux présentent le même pourcentage de similitude aux séquences d’ADNr 16S d’espèces proches.
147 Chapitre 2 : Résultats et discussion Figure 36. Photomicrographies électroniques de la souche B2 (A) et (B) Photomicrographies électronique en transmission par coloration négative montrant la forme bacillaire et la présence de flagelles polaire, barre 0,6 et 1,0 µm respectivement (C) Photomicrographie électronique en transmission sur des sections, barre 1,0 µm (D) Photomicrographie électronique à balayage, barre 1,0 µm.
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N° d’ordre : 79 / T.E / 2007 Sé
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Nom : KHARROUB Date de soutenanace
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Annexe 10. Courbes de quantificatio
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