(Thèse partie 1)

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Chapitre 1 : Résultats et discussion
Alt-5 T , souche type de Haloalcaliphilum atacamensis, s, simple brin ; d, double brin.
BR % = (D/ S + D) × 100 et RBR % = valeur × 100/BR %.
L’étude d’homologie ADN-ADN a été effectuée avec la souche Alt-5 T de
Haloalcaliphilum atacamensis. D’après la courbe étalon, la fonction de la droite est : Y =
0,00006 x + 0,2117.
D’après les résultats du test d’homologie ADN-ADN (Tableau 34), le taux d’hybridation
de la sonde avec l’ADN de l’haloarchaea Haloalcaliphilum atacamensis est relativement
élevé (supérieur à 70 %). En accord avec le comité Ad Hoc, les deux souches devraient
appartenir à la même espèce. Mais si on considère le pourcentage de similitude des
séquences nucléiques, les deux souches ne peuvent appartenir à la même espèce. Tout ceci
peut s’expliquer par un mauvais séquençage du 16S de l’ADNr de l’haloarchaea. En effet,
la séquence du gène de l’ARNr de Haloalcaliphilum atacamensis envoyée à GenBank
comprend énormément de nucléotides ambigus. Par ailleurs, les résultats de l’analyse des
lipides polaires de Haloalcaliphilum atacamensis ont indique la même composition que
celle de la souche S3. En outre, toutes deux présentent le même pourcentage de similitude
aux séquences d’ADNr 16S d’espèces proches.