(Thèse partie 1)
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0,02<br />
145<br />
Chapitre 1 : Résultats et discussion<br />
Figure 35. Arbre phylogénétique basé sur le gène codant l’ARNr 16S montrant la position<br />
de la souche S3. La séquence du gène codant l’ARNr 16S de Methanospirillum hungatei<br />
DSM 864 T est utilisée comme outgroup. La barre représente 2 substitutions par 100<br />
nucléotides.<br />
Tableau 34. Taux d’hybridations ADN-ADN de la souche S3 avec Haloalcaliphilum<br />
atacamensis.<br />
30<br />
18<br />
16<br />
80<br />
Souche S3<br />
Souches Absorbance ADN (pg) S = s × 5<br />
D = d × 2<br />
S3 1s 0,323 2226 11130<br />
S3 1d 0,590 7566 15131<br />
S3 2s 0,308 3006 15030<br />
S3 2d 0,562 7006 14012<br />
Alt-5 1s 0,350 2766 13830<br />
Alt-5 1d 0,493 5626 11252<br />
Alt-5 2s 0,360 2966 14830<br />
Alt-5 2d 0,511 5986 11972<br />
70<br />
77<br />
95<br />
84<br />
100<br />
100<br />
Haloalcalophilium atacamensis ALT-5 T (AJ277204)<br />
Halomicrobium mukohataei Arg-2 T (D50850)<br />
Haloarcula marismortui HC8 (X61688)<br />
Halosimplex carlsbadense ATCC BAA-75 T (AF320480)<br />
Halorhabdus utahensis AX-2 T (AF071880)<br />
100<br />
Halobacterium salinarum DSM 3754 T (AJ496185)<br />
Haloterrigena thermotolerans PR 5 T (AF115478)<br />
Halorubrum saccharovorum JCM 8865 T (U17364)<br />
Halogeometricum borinquense PR 3 T (AF002984)<br />
Haloferax volcanii NCIMB 2012 T (AY425724)<br />
Haloferax mediterranei ATCC 33500 T (D11107)<br />
Halococcus morrhuae NRC 16008 T (D11106)<br />
Methanospirillum hungatei DSM 864 T (M60880)<br />
S + D BR (%) RBR (%)<br />
26261 57,6 100<br />
29042 48,25<br />
25082 44,86 77,88<br />
26802 44,66 77,53