(Thèse partie 1)

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Chapitre 1 : Résultats et discussion
La sonde a été hybridée avec les ADN des souches types de Haloarcula marismortui DSM
3752 T , Haloarcula vallismortis DSM 3756 T , Haloarcula hispanica ATCC 33960 T et
Haloarcula argentinensis JCM 9737 T .
La courbe étalon est représentée par la figure 34 en Annexe 10. D’après cette
représentation,
Y = 0,0002 x + 0,1996. Les résultats d’homologie ADN-ADN sont rassemblés dans le
tableau 33.
Les pourcentages d’homologies obtenus entre la sonde et les ADN de Haloarcula
marismortui DSM 3752 T , Haloarcula vallismortis DSM 3756 T , Haloarcula hispanica
ATCC 33960 T et Haloarcula argentinensis JCM 9737 T varient de 28,32 à 59,0. Le
pourcentage le plus élevé a été obtenu avec la dernière espèce mais il reste inférieur à 70
%. En accord avec les recommandations du comité Ad Hoc, la souche S1 ne peut être
incluse dans aucune des espèces déjà décrites de Haloarcula.
6. 4. 3. Hybridation de la souche S3
L a séquence 16S de l’ADNr de la souche S3 présente 96 % de similitude avec la
séquence la plus proche celle de Haloalcaliphilum atacamensis, une haloarchaea non
décrite et moins de 93 % d’identité avec les autres membres de la famille des
Halobacteriaceae. Comme il a été mis en évidence que des séquences d’ADN ribosomaux
16S ayant des similarités inférieures à 97 % ne correspondent jamais à des pourcentages de
réassociations ADN-ADN supérieures à 60 % (Devereux et al., 1990). Pour cette raison le
test d’homologie ADN-ADN a été réalisé uniquement avec la souche Haloalcaliphilum
atacamensis Alt-5 T . La position phylogénétique de la souche S3 est indiquée par l’arbre
(Figure 35) qui a montré une relation de parenté très proche entre la souche S3 et
Haloalcalophilium atacamensis ALT-5 T .