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(Thèse partie 1)

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6. 4. 2. Hybridation de la souche S1<br />

142<br />

Chapitre 1 : Résultats et discussion<br />

D’après les résultats du séquençage de l’ADNr 16S, la souche S1 est liée aux<br />

membres du genre Haloarcula (Tableau 28). La comparaison phylogénétique par analyse<br />

de Neighbor-Joining de l’acide nucléique a produit un arbre phylogénétique (Figure 33)<br />

montrant un embranchement formé par la souche S1 et le cluster formé par les espèces<br />

Haloarcula vallismortis DSM 3756 T , Haloarcula sinaiiensis ATCC 33800 T et Haloarcula<br />

argentinensis JCM 9737 T .<br />

0,02<br />

Figure 33. Arbre phylogénétique basé sur le gène codant l’ARNr 16S montrant la position<br />

de la souche S1. La séquence du gène codant l’ARNr 16S de Methanospirillum hungatei<br />

DSM 864 T est utilisée comme outgroup. La barre représente 2 substitutions par 100<br />

nucléotides.<br />

45<br />

82<br />

54<br />

99<br />

59<br />

100<br />

96<br />

100<br />

65<br />

100<br />

Haloarcula vallismortis DSM 3756 T (U17593)<br />

Haloarcula sinaiiensis ATCC 33800 T (D14129)<br />

Haloarcula argentinensis JCM 9737 T (D50849)<br />

Souche S1<br />

Haloarcula hispanica ATCC 33960 T (U68541)<br />

Haloarcula marismortui HC8 (X61688 S93627)<br />

Halomicrobium mukohataei Arg-2 T (D50850)<br />

Halosimplex carlsbadense ATCC BAA-75 T (AF320478)<br />

Halobacterium salinarum DSM 3754 T (AJ496185)<br />

Haloterrigena thermotolerans PR 5 T (AF115478)<br />

Halorubrum saccharovorum JCM 8865 T (U17364)<br />

Haloferax volcanii NCIMB 2012 T (AY425724)<br />

Methanospirillum hungatei DSM 864 T (M60880)

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