(Thèse partie 1)

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Chapitre 1 : Résultats et discussion
Les analyses phylogénétiques ont indiqué l’affiliation de neuf souches au genre
Halorubrum. L’arbre phylogénétique construit avec les séquences des ADNr 16S de ces
souches et espèces proches possède une topologie avec deux clades (Figure 30). Le
premier clade regroupe les séquences de Halorubrum saccharovorum JCM 8865 T ,
Halorubrum lacusprofundi ACAM34 T et la souche 1’2, tandis que le deuxième clade
regroupe les séquences des autres souches affilées au genre Halorubrum avec celles de
Halorubrum coriense DSM 10284 T , Halorubrum distributum JCM 9100 T , Halorubrum
sodomense ATCC 33755 T , Halorubrum trapanicum NRC 34021 T et Halorubrum
xinjiangense AS 1.3527 T .
Les résultats de l’analyse des lipides polaires obtenus concordent dans l’ensemble avec
ceux de l’étude phylogénétique basée sur la comparaison des séquences de l’ADNr 16S à
celles de la base de données (Tableau 28). Ainsi, la souche 2a possède les glycolipides, S-
TGD-1 et S-TeGD-1, caractéristiques du genre Halobacterium. De même, le séquençage a
confirmé son apparenté aux deux seules espèces décrites du genre Halobacterium
(Halobacterium salinarum et Halobacterium noricense). Il en ait de même des autres
souches où le résultat du type de glycolipide corrobore avec celui du séquençage. La seule
exception à cette règle est représentée par la souche S3 dont la composition des lipides
polaires membranaires est similaire à celle des membres du genre Haloferax. Mais, malgré
cette similitude, l’analyse phylogénétique a démontré que la souche S3 est apparentée à un
degré moindre aux séquences du gène d’ADNr des espèces du genre Haloferax (92 %) et
ne présente que 96 % d’identité avec la séquence la plus proche en banque celle de
Haloalcaliphilum atacamensis, une haloarchaea non décrite. En outre, toute deux
possèdent la même composition de lipides polaires.