(Thèse partie 1)

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130 Chapitre 1 : Résultats et discussion Tableau 30. Matrice de distances génétiques archéennes calculées selon Tamura-Nei du programme Mega 3 (suite). S 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 15 16 0,162 17 0,174 0,092 18 0,148 0,150 0,154 19 0,165 0,009 0,094 0,151 20 0,010 0,167 0,174 0,150 0,171 21 0,159 0,003 0,088 0,146 0,005 0,164 22 0,154 0,149 0,168 0,118 0,151 0,156 0,148 23 0,143 0,146 0,150 0,139 0,145 0,143 0,142 0,117 24 0,162 0,010 0,081 0,149 0,012 0,166 0,006 0,148 0,145 25 0,157 0,004 0,089 0,147 0,006 0,163 0,001 0,149 0,141 0,007 26 0,113 0,161 0,171 0,128 0,163 0,113 0,157 0,117 0,111 0,157 0,159 27 0,162 0,005 0,090 0,148 0,007 0,167 0,002 0,151 0,145 0,009 0,003 0,160 28 0,160 0,011 0,083 0,150 0,013 0,164 0,007 0,147 0,147 0,001 0,009 0,156 0,010 29 0,160 0,004 0,089 0,144 0,006 0,166 0,001 0,149 0,143 0,007 0,002 0,159 0,003 0,009 S, souche ; 15, Haloarcula argentinensis Arg-1 T ; 16, Souche 5.1 ; 17, Souche 1’2 ; 18, Souche 4’1 ; 19, Souche S7 ; 20, Souche S1 ; 21, Souche S2 ; 22, Souche B3 ; 23, Souche 2a ; 24, Souche 5-1 ; 25, souche 5’RB ; 26, Souche S3 ; 27, Souche S6 ; 28, Souche 5-2 ; 29, Souche B1.
131 Chapitre 1 : Résultats et discussion Figure 30. Arbre phylogénétique basé sur le gène codant l’ARNr 16S montrant la position des souches affiliées au genre Halorubrum. La barre représente 5 substitutions par 100 nucléotides. 0,05 79 73 60 93 68 55 Souche 5.1 Souche B1 Souche S6 89 Souche 5’RB Souche S2 26 Souche S7 26 30 Halorubrum sodomense ATCC 33755 T (X82169) Halorubrum tebenquichense CECT 5317 T (AJ276887) Halorubrum coriense DSM 10284 T (S70839) Halorubrum distributum JCM 9100 T (D63572). Souche 5-1 Souche 5-2 Halorubrum trapanicum NRC 34021 T (X82168) Halorubrum xinjiangense AS 1.3527 T 38 56 93 94 77 100 (AY510707) Halorubrum terrestre JCM 10247 T (AB090169) Halorubrum lacusprofundi ACAM 34 T (X82170) Souche 1’2 Halorubrum saccharovorum JCM 8865 T (U U17364) Halorubrum vacuolatum JCM 9060 T (D87972) Halorubrum alkaliphilum DZ-1 T (AY510708) Halorubrum tibetense ZB49 T (AF435111) Methanospirillum hungatei DSM 864 T (M60880)
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