(Thèse partie 1)

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126 Chapitre 1 : Résultats et discussion Tableau 29. Caractérisation morphologique, physiologique, biochimique et génétique des souches d’halobactéries isolées de la sebkha Ezzemoul (suite). Propriétés B1 B3 S1 S2 S3 S6 S7 Gamme de pH 7,0-9,0 6,5-9,0 5,0-9,0 6,5-9,0 6,5-9,0 6,5-9,0 6,5-9,0 Optimum 7,5-8,0 7,0 7,5-8,0 7,0 6,5-7,0 7,0-7,5 7,0-7,5 Utilisation des acides aminés Prod. d’acide à partir du glucose Hydr.: amidon gélatine Esculine T 40 T 60 T 80 - - + + + + - - - - - - - - + + + + - + + - - - - - + + + - - - Catalase + + + + + + + Oxydase + + + + + + + Réd. N03 - - + - - + - - Prod. d’indole Lip.pol : Phosph. Glyco. GC mol% Similitude ADNr 16S + - - - - - - - - - - - - PG, PGP- Me PGS SDGD3 59,0 PG, PGP- Me S2DGD1 PG, PGP- Me PGS TGD2, DGD2 PG, PGP- Me PGS SDGD3 - + + + + + PG, PGP- Me SDGD1, DGD1 - - - - - - PG, PGP- Me PGS 60,2 61,5 56,5 52,9 53,4 Gl - - - - - - PG, PGP- Me SDGD3 55,4 Hrr. Ht. Ha. Hrr. nd Hrr. Hrr. Gl, glycolipide ; nd, non déterminé ; +, réaction positive ; -, réaction négative. Hrr.., Halorubrum ; Hb., Halobacterium ; Hf., Haloferax; Ha., Haloarcula; Ht., Haloterrigena.
0,02 26 37 31 85 55 100 127 Chapitre 1 : Résultats et discussion Figure 29. Arbre phylogénétique basé sur le gène codant l’ARNr 16S montrant la position des souches archéennes isolées. La séquence du gène codant l’ARNr 16S de Methanospirillum hungatei DSM 864 T est utilisée comme outgroup. Les valeurs au niveau des nœuds indiquent les probabilités calculées par bootstrap ; les numéros d’accession dans la base de données GenBank sont reportés en face de chaque souche. La barre représente 2 substitutions par 100 nucléotides. 100 100 100 Souche 5.1 Souche S6 97 Souche S7 Souche S2 Souche B1 Souche 5’RB Halorubrum coriense DSM 10284 T (S70839) Halorubrum distributum JCM 9100 T 35 (D63572) 42 92 Souche 5-1 31 64 Souche 5-2 Halorubrum sodomense ATCC 33755 T (X82169) Halorubrum trapanicum NRC 34021 T (X82168) Halorubrum xinjiangense AS 1.3527 T (AY510707) Halorubrum lacusprofundi ACAM 34 T (X82170) Halorubrum saccharovorum JCM 8865 T (U17364) Souche 1’2 Haloferax volcanii NCIMB 2012 T (AY425724) Souche 4’1 Haloterrigena thermotolerans PR 5 T (AF115478) Souche B3 Halobacterium noricense DSM 15987 T (AJ548827) Halobacterium salinarum DSM 3754 T (AJ496185) 100 Souche 2a 100 68 97 55 100 35 Souche S3 Halomicrobium mukohataei Arg-2 T (D50850) Souche S1 Haloarcula hispanica ATCC 33960 T (AB090167) Haloarcula argentinensis Arg-1 T (D50849) Methanospirillum hungatei DSM 864 T (M60880)
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N° d’ordre : 79 / T.E / 2007 Sé
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