(Thèse partie 1)

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6. 3. Discussion 122 Chapitre 1 : Résultats et discussion Toutes les souches archéennes isolées ap<strong>partie</strong>nnent au groupe d’archaea halophiles extrême aérobie de la famille des Halobacteriaceae. La caractérisation phénétique réalisée a permis d’avoir accès aux propriétés physiologiques et biochimiques de ces microorganismes. Toutes les souches donnent des colonies pigmentées en rouge, en orange ou en saumon sur milieu solide due à la présence de bactériorubérine, caractérisée par les valeurs maximales du spectre d’absorption de l’extrait cellulaire. Les photomicrographies électroniques réalisées ont mis en évidence l’existence d’un réel pléomorphisme, qui est un trait fréquent chez ce type de procaryotes. Aucune des souches isolées n’était capable de croître au dessous d’une concentration de 10 % (p/v) de NaCl et toutes exigent la présence de magnésium. Elles sont, par ailleurs, toutes neutrophiles mais capables de croître sur une large gamme de pH (Tableau 29). L’utilisation de substrats carbonés comme source unique de carbone, d’énergie et/ou d’azote par les isolats est faible ou encore absente et c’est le cas de la plupart des halobactéries (Tableau 27-Annexe 9). L’acétate et le glycérol sont les deux composés les plus assimilés qui selon Oren (1994) et Oren (1999b) sont les plus fréquemment disponibles dans les environnements hypersalins. Une telle physiologie est largement répandue dans ce groupe. Ce sont des isolats hétérotrophes aérobies à Gram négatif et quelques souches réduisent le nitrate en anaérobiose et/ou fermentent l’arginine. Elles sont toutes sensibles à la bacitracine et à la novobiocine mais résistantes aux antibiotiques inhibant la croissance des bactéries. La détermination de la composition des lipides polaires membranaires a été d’une grande utilité dans la classification des différentes souches. Elle a permis de générer environ sept genres : Halobacterium, Haloarcula, Halococcus, Haloferax, Halobaculum, Halorubrum et Haloterrigena. Une majorité des souches isolées est retrouvée dans le genre Halorubrum. Ce dernier a d’ailleurs été retrouvé dans les lacs hypersalins de différents continents (McGenity & Grant, 2001; Lizama et al., 2002 ; Fan et al., 2004 ; Feng et al., 2004, 2005 ; Kharroub et al., 2006 ; Cui et al., 2006).
123 Chapitre 1 : Résultats et discussion Tableau 29. Caractérisation morphologique, physiologique, biochimique et génétique des souches d’halobactéries isolées de la sebkha Ezzemoul. Propriétés 1’2 2a 4’1 5’RB 5.1 5-1 5-2 Pigmentation Orange Rouge Pourpre Rouge Rouge Orange Rouge Morphologie cellulaire Gamme de NaCl (M) Optimum (M) Pléomo. Bàt. flagellé 3,0-5,2 3,4-5,2 Pléomo. Pléomo. Bât. flagellé 1,7-5,2 4,3 4,3 3,4 4,3 1,7-5,2 2,5-4,3 3,4 Pléomo. Bàt. ou cocci flagellé 1,7-5,2 1,7-5,2 3,4 3,4 Exige Mg 2+ + + + + + + + Gamme de temp. (°C) Optimum (°C) Gamme de pH 30-55 30-50 30-50 30-50 40 40 40 40 7,0-9,0 6,5-9,0 22-50 6,5-9,0 6,5-9,0 6,5-9,0 22-50 30-50 37-40 37-40 40 6,5-9,0 6,5-9,0 Optimum 7,5 7,5 7,5 7,5 7,0-7,5 6,5-7,0 7,5-8,0 Utilisation des acides aminés Prod. d’acide à partir du glucose Hydr.: amidon gélatine Esculine T 40 T 60 T 80 + - - - + - + + + + + + + - - - - - - - - - + - + - - - Catalase + + + + + + + Oxydase + + + + + + + Réd. N03 - + - - - + - - Prod. d’indole - - - - - - - nd, non déterminé ; +, réaction positive ; -, réaction négative. Pléom. Pléomorphe ; bât, bâtonnet ; T, Tween. + - - - - - - - - - - - - - + + - - - - - + + - + - - -
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N° d’ordre : 79 / T.E / 2007 Sé
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Résultats et discussion 1. Analyse
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