(Thèse partie 1)

6. 3. Discussion
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Chapitre 1 : Résultats et discussion
Toutes les souches archéennes isolées appartiennent au groupe d’archaea halophiles
extrême aérobie de la famille des Halobacteriaceae. La caractérisation phénétique réalisée
a permis d’avoir accès aux propriétés physiologiques et biochimiques de ces
microorganismes. Toutes les souches donnent des colonies pigmentées en rouge, en orange
ou en saumon sur milieu solide due à la présence de bactériorubérine, caractérisée par les
valeurs maximales du spectre d’absorption de l’extrait cellulaire. Les photomicrographies
électroniques réalisées ont mis en évidence l’existence d’un réel pléomorphisme, qui est un
trait fréquent chez ce type de procaryotes. Aucune des souches isolées n’était capable de
croître au dessous d’une concentration de 10 % (p/v) de NaCl et toutes exigent la présence
de magnésium. Elles sont, par ailleurs, toutes neutrophiles mais capables de croître sur une
large gamme de pH (Tableau 29).
L’utilisation de substrats carbonés comme source unique de carbone, d’énergie et/ou
d’azote par les isolats est faible ou encore absente et c’est le cas de la plupart des
halobactéries (Tableau 27-Annexe 9). L’acétate et le glycérol sont les deux composés les
plus assimilés qui selon Oren (1994) et Oren (1999b) sont les plus fréquemment
disponibles dans les environnements hypersalins. Une telle physiologie est largement
répandue dans ce groupe.
Ce sont des isolats hétérotrophes aérobies à Gram négatif et quelques souches réduisent le
nitrate en anaérobiose et/ou fermentent l’arginine. Elles sont toutes sensibles à la
bacitracine et à la novobiocine mais résistantes aux antibiotiques inhibant la croissance des
bactéries.
La détermination de la composition des lipides polaires membranaires a été d’une grande
utilité dans la classification des différentes souches. Elle a permis de générer environ sept
genres : Halobacterium, Haloarcula, Halococcus, Haloferax, Halobaculum, Halorubrum
et Haloterrigena. Une majorité des souches isolées est retrouvée dans le genre
Halorubrum. Ce dernier a d’ailleurs été retrouvé dans les lacs hypersalins de différents
continents (McGenity & Grant, 2001; Lizama et al., 2002 ; Fan et al., 2004 ; Feng et al.,
2004, 2005 ; Kharroub et al., 2006 ; Cui et al., 2006).