(Thèse partie 1)

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120 Chapitre 1 : Résultats et discussion Tableau 28. Affiliation phylogénétique des souches archéennes étudiées (suite). Souche Groupe Identité 5.1 1 (%)* Halorubrum 97 97 96 96 96 95 94 93 93 5-1 1 Halorubrum 98 5-2 1 S2 1 *, Résultats du BLAST. 98 98 98 97 97 Halorubrum 98 98 98 98 97 Halorubrum 98 97 97 97 97 97 97 96 Espèces proches Numéro Halorubrum coriense Halorubrum sodomense Halorubrum trapanicum Halorubrum distributum Halorubrum xinjiangense Halorubrum terrestre Halorubrum tebenquichense Halorubrum saccharovorum Halorubrum lacusprofundi Halorubrum coriense Halorubrum trapanicum Halorubrum distributum Haolrubrum xinjiangense Halorubrum sodomense Halorubrum terrestre Halorubrum coriense Halorubrum trapanicum Halorubrum distributum Haolrubrum xinjiangense Halorubrum sodomense Halorubrum ezzemoulense Halorubrum coriense Halorubrum distributum Halorubrum sodomense Halorubrum trapanicum Halorubrum terrestre Halorubrum xinjiangense Halorubrum tebenquichense d’accession S70839 X82169 X82168 D63572 AY510707 AB090169 AJ276887 U17364 X82170 S70839 X82168 D63572 AY510707 X82169 AB090169 S70839 X82168 D63572 AY510707 X82169 DQ118426 S70839 D63572 X82169 X82168 AB090169 AY510707 AJ276887
121 Chapitre 1 : Résultats et discussion Tableau 28. Affiliation phylogénétique des souches archéennes étudiées (suite). Souche Groupe Identité S6 1 S7 2 B3 2 S3 1 (%)* Halorubrum 97 97 97 97 97 96 Halorubrum 97 Haloterrigena *, Résultats du BLAST. 97 96 96 96 96 96 98 97 95 95 96 93 92 92 90 91 Souches proches Numéro Halorubrum coriense Halorubrum trapanicum Halorubrum xinjiangense Halorubrum sodomense Halorubrum distributum Halorubrum tebenquichense Halorubrum coriense Halorubrum ezzemoulense Halorubrum sodomense Halorubrum tebenquichense Halorubrum terrestre Halorubrum trapanicum Halorubrum xinjiangense Haloterrigena thermotolerans Haloterrigena saccharevitans Halotrrigena turkmenica Natrinema versiforme Haloalcaliphilum atacamensis Halorhabdus utahensis Haloarcula marismortui Haloferax volcanii Halomicrobium mukohataei Halosimplex carlsbadense d’accession S70839 X82168 AY510707 X82169 D63572 AJ276887 S70839 DQ118426 X82169 AJ276887 AB090169 X82168 AY510707 AF115478 AY820137 AB004878 AB023426 AJ277204 AF071880 AY596227 K00421 D50850 AJ586107 1 , sequences obtenues avec amorces F8/R1462, 2 , séquences obtenues avec amorces 21F/1525R.
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N° d’ordre : 79 / T.E / 2007 Sé
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Annexe 10. Courbes de quantificatio
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