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(Thèse partie 1)

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116<br />

Chapitre 1 : Résultats et discussion<br />

6. 2. Amplification et séquençage du gène d’ARN ribosomal 16S<br />

Les ADN codant pour les ARN ribosomaux 16S des souches archéennes ont d’abord<br />

été amplifiés par la technique de la PCR. Une électrophorèse des produits de la PCR est<br />

effectuée sur gel d’agarose-TAE. Après migration, le gel est photographié sur table UV<br />

(Figure 28).<br />

Les bandes d’ADN ont migré dans la région 1 500 paires de bases du gel d´agarose à<br />

1 %. Les produits de la PCR purifiés des quatorze ont été séquencés et les séquences<br />

obtenues (Annexe 8) ont été comparées avec celles d’autres organismes de la base de<br />

données GenBank (www.ncbi.nlm.nih.gov) (Benson et al., 1999).<br />

2000<br />

1500<br />

1000<br />

700<br />

600<br />

400<br />

300<br />

200<br />

150<br />

50<br />

1 2 3 4 5 6 7<br />

Figure 28. Résultats de l’amplification de l’ADN ribosomal 16S des souches archéennes.<br />

Ladder (canal 1) ; souche 1’2 (canal 2) ; souche 2a (canal 3) ; souche 4’1 (canal 4) ; souche<br />

5.1 (canal 5) ; souche B1 (canal 6) et souche S1 (canal 7).

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