(Thèse partie 1)

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Tableau 20. Utilisation des acides organiques. Souches Propionate Oxalate Acétate Succinate Malonate 98 Benzoate Chapitre 1 : Résultats et discussion 1’1 - - + - - - - - - - - 1’2 + - + + - - + - - - - 1’3 - - + - - - + - - - - 2a - - + - - - - - - - - 2b - - - - - - - - - - - 2c - - + - - - - - - - - B1 - - + - - - - - - - - B3 - - - - - - - - - - - B4 - - + - - - - - - - - B5 - - + - - - - - - - - B6 - - + - - - + - - - - B7 - - - - - - - - - - - B8 - - - - - - + - - - - 4’1 - - + + - - - - - - - 4’2 - - + + - - + - - - - 4’3 - - - + - - + - - - - 5.1 - + + - - - + - - - + 5.2 - - + + - - - - - - - 5.3 - - - - - - - - - - - 5RB - - + + + - - - - - - 5-1 - + + + + - - + - - + 5-2 - - + + + - - + + - - 5-4 - - + - - - - - - - - 5-5 - + + - - - - - - - - 5-6 - - + - - - - - - - - 5-7 - - + - - - - + - - - 5-8 + - - + - - - - - - + 5-9 - - + - - - - - - - - S1 + - + - - - - - - - - S2 + - + + - - - - - - - S3 + - + + - - - - - - - S4 - - - - - - - - - - - S5 + - + - - - - - - - - S6 - - - - - - - - - - - S7 - - - - - - - - - - - S8 + + - - - - - - - - + S9 - - + - - - - - - - - S10 - - + - - - - - - - - Malate Formiate Fumarate Lactate Citrate
99 Chapitre 1 : Résultats et discussion La capacité de certaines souches à utiliser des acides organiques tels que le citrate, le propionate et les intermédiaires du cycle de Krebs (le malate et le succinate) ainsi que l’acétate a été observée (Tableau 20). Ce résultat a été rapporté par d’autres auteurs et notamment pour l’acétate qui est utilisé par les espèces des genres Haloarcula et Haloferax via le cycle Shunt du glyoxylate (Tindall, 1992 ; Bräsen & Schönheit, 2001 ; Oren, 2002). Chez Halobacterium salinarum, les enzymes du cycle du glyoxylate et du cycle tricarboxylique ne sont détectées qu’après croissance de l’organisme sur l’acétate (Hochstein, 1988). Ce dernier peut être obtenu à partir du glycérol qui est la principale source de carbone disponible pour les communautés microbiennes halophiles dans les lacs hypersalés (Oren, 1995). Malgré qu’il soit connu que les halobactéries préfèrent utiliser les acides aminés aux sucres, ils sembleraient qu’ils soient peu utilisés par nos souches. Néanmoins, la souche 1’2 est capable de se développer sur l’arginine, l’alanine, l’asparagine, l’histidine et la tyrosine comme unique source de carbone, d’azote et d’énergie (Tableau 21). Par ailleurs, elle possède plus de capacités à utiliser les sucres, les alcools, les acides organiques et les acides aminés que les autres souches. Contrairement aux espèces d’halobactéries décrites comme étant incapables d’utiliser les acides aminés comme seule source de carbone et d’énergie (Wainø et al., 2000 ; Vreeland et al., 2002 ; Ventosa et al., 2004). Elles exigent la présence de facteurs de croissances dans le milieu de culture.
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