(Thèse partie 1)

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2. 3. Utilisation de substances organiques 96 Chapitre 1 : Résultats et discussion Le glucose est le monosaccharide le plus assimilé par l’ensemble des souches étudiées. D’après les résultats présentés dans le tableau 18, les souches 1’2 et 5-1 sont les plus utilisatrices de sucres (mono et disaccharides) comme source unique de carbone et d’énergie. Par contre les souches 1’1, 2a, 2b et 2c sont incapables de les assimiler. Cette propriété est largement répandue chez ce groupe (Mormile et al., 2003 ; Oren & Mana, 2003 ; Grüber et al., 2004 ; Litchfield et al., 2006) et ceci en dépit du fait que les gènes responsables du catabolisme des sucres soient identifiés dans le génome de Halobacterium NRC-1 (Ng et al., 2000). L’assimilation des sucres a été observée principalement avec quelques membres des genres Haloarcula, Haloferax et Halorubrum (Oren, 1999b ; Grant et al., 2001). Il faudra noter que même si les sucres soient peu métabolisés par ce groupe de procaryotes, ils stimulent cependant leur croissance (Oren, 2002). L’amidon et la cellulose sont utilisés lors de la croissance de certaines souches en absence de tout autre substrat carboné. La croissance sur l’amidon comme seule source de carbone et d‘énergie a été souvent observée (Grant et al., 2001). La dépendance de nombreuses souches isolées de la Mer Morte à l’amidon a été mise en évidence par Oren (1983b). Mais peu de travaux ont rapporté l’utilisation de la cellulose par les archaea halophiles extrêmes (Birbir et al., 2004 ; Elevi et al., 2004). Le glycérol est largement assimilé et le mannitol l’est faiblement par les isolats (Tableau 19). En effet, une affinité des haloarchaea isolées de la Mer Morte pour le glycérol produit par Dunaliella a été observée par Oren (1994, 1995). Quand au mannitol, il est probablement transformé en fructose par une mannitol déshydrogénase présente chez de nombreuses haloarchaea (Altekar & Rangaswamy, 1992).
Tableau 19. Utilisation des alcools. Souches Adonitol Dulcitol Glycérol 97 Chapitre 1 : Résultats et discussion 1’1 - - - - - - 1’2 - - + + - - 1’3 - - + - - - 2a - - - - - - 2b - - - - - - 2c - - - - - - B1 - - + - - - B3 - - + - - - B4 - - - - - - B5 - - - + - - B6 - - - - - - B7 - - + - - - B8 - - - - - - 4’1 - - - - - - 4’2 - - + - - - 4’3 - - + - - - 5.1 - - + + - - 5.2 - - - - - - 5.3 - - - - - - 5RB - - - - - - 5-1 - - + - - - 5-2 - - + - - - 5-4 - - - - - - 5-5 - - + - - - 5-6 - - + - - - 5-7 - - - - - - 5-8 - - - - - - 5-9 - - + - - - S1 - - + + - - S2 - - + - - - S3 - - - - - - S4 - - - - - - S5 - - + - - - S6 - - - - - - S7 - - - - - - S8 - - - - - - S9 - - - + - - S10 - - - - - - Mannitol Sorbitol Inositol
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