(Thèse partie 1)

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82 Résultats et discussion dans une telle étude. Nous avons utilisé des techniques moléculaires basées sur l’analyse des gènes codant pour les 16S ARN ribosomaux archéens et bactériens. Deux souches ont réagi avec les amorces spécifiques au domaine Bacteria (la souche B2 et 5-3). Seize souches (deux souches bactériennes et quatorze souches archéennes) ont été sélectionnées pour déterminer la séquence du gène d’ARNr 16S et de préciser ainsi leur affiliation respective. La composition des lipides polaires des souches archéennes, ou de celles des acides gras membranaires bactérienne a aussi été effectuée. De même, des études d’homologies ADN-ADN ont été entreprises pour quelques souches trouvées taxinomiquement intéressantes.
1. Morphologie des souches d’haloarchaea 83 Chapitre 1 : Résultats et discussion Les colonies produites sont généralement rondes d’un diamètre d’environ 1 à 2 mm, convexes, entières et bombées après 5 à 7 jours d’incubation à 37 °C. Elles sont toutes pigmentées en rouge, en pourpre ou en orange. La pigmentation est un trait qui caractérise en général, les Archaea halophiles extrêmes due à la présence de la bactériorubérine (Grant et al., 2001 ; Oren & Rodriguez-Valera, 2001). On a noté que la pigmentation des colonies variait selon la salinité, elle devient moins intense lorsque la salinité augmentait. De même, la culture sur milieu liquide réalisée à différentes concentrations de NaCl a montré que la production de pigment diminue lorsque la salinité augmente (Figure 16). Ces observations rejoignent celles rapportées par Rodriguez et al. (1980). Figure 16. Effet de la concentration de NaCl sur la production du pigment par la La coloration de Gram réalisée selon la technique de Dussault (1955) a donné un résultat négatif pour toutes les souches étudiées. Même si les haloarchaea sont dépourvues de réelle paroi, réagissent à la coloration en général comme les bactéries à Gram négatif, à l‘exception du genre haloalcalophile, Natronococcus dont la coloration de Gram est variable (Tindall et al., 1984 ; Grant et al., 2001).
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