(Thèse partie 1)

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Avant-propos Le présent ouvrage est consacré à l’étude de la communauté microbienne halophile isolée d’un type d’environnement extrême, la sebkha ezzemoul située à Ain M’Lila. La présentation des résultats décrit en premier lieu l’isolement des souches halophiles. Par la suite, chacune des souches archéennes et bactériennes est caractérisée à l’intérieur d’un chapitre. Les souches appartenant au domaine des Archaea ont été étudiées en premier, suivi des isolats du domaine des Bacteria. De plus une conclusion a été ajoutée après ces deux chapitres. La présente étude a contribué à la découverte de deux nouvelles espèces publiées dans une revue internationale : Kharroub, K., Quesada, T., Ferrer, R., Fuentes, S., Aguilera, M., Boulahrouf, A. Ramos-Cormenzana, A. & Monteoliva-Sanchez, M. (2006). Halorubrum ezzemoulense sp; nov., a halophilic archaeon isolated from Ezzemoul sabkha, Algeria. Int J Syst Evol Microbiol 56, 1583-1588. Karima Kharroub, Margarita Aguilera, Terresa Quesada, José Antonio Morillo, Alberto Ramos-Cormenzana, Abderrahmane Boulahrouf & Mercedes Monteoliva- Sanchez. (2007). Salicola salis sp. nov., an extremely halophilic bacterium isolated from Ezzemoul sabkha in Algeria. Int J Syst Evol Microbiol 56, 2647-2652. Communication : Kharroub, K., Monteoliva-Sanchez, M., Quesada, T., Fuentes, S., Boulahrouf, A. & Ramos-Cormenzana, A. (2005). Halorubrum ezzemoulense sp. nov., una nueba arquea halófila extrema aislada de la laguna Ezzemoul, Argelia. XX Congreso de la Sociedad Espanóla de Microbiologia.
Listes des figures Figure 1. Habitats thalassohalins. Marais salants de Costa Blanca en Espagne (à droite) et à San Francisco au USA (à gauche) (Falb et al., 2005) Figure 2. Localisation d’anciens dépôts d’évaporites sur la Terre (Grant, 2004) Figure 3. Habitats athalassohalins. Le Grand Lac Salé Utah au USA (à gauche en haut), le Lac Magadi au Kenya (à gauche en bas) et le Lac Rose Salé au Sénégal (à droite) (Falb et al., 2005). Figure 4. Arbre phylogénétique universel issu d’une analyse comparative des séquences de gènes ribosomaux (Oren, 2002a) Figure 5. Les différents groupes de microorganismes halophiles (Larsen, 1962) Figure 6. Comparaison des charges de surface de protéines. TFBe de Halobacterium NRC-1 (protéine halophile) et Facteur d’initiation de transcription humain TFIIB (non halophile) (Kennedy et al., 2001) Figure 7. Structure du « core » des lipides membranaires des haloarchaea (Kates, 1996) Figure 8. Structures des phospholipides des haloarchaea et comparaison à ceux des non-Archaea (Kates, 1996) Figure 9. Structures des glycolipides caractéristiques des genres d’haloarchaea (Kates, 1996) Figure 10. Dégradation du glucose et du fructose chez les Archaea halophiles extrêmes (Johnsen et al., 2001) Figure 11. Les sept hélices de la protéine et le rétinal (Kimura et al., 1997) Figure 12. Position phylogénétique des différents phyla bactérien (a) et archéeen (b) d’après l’analyse des séquences d’ADNr 16S (méthode de Neighbor-Joining) (Hugenholtz, 2002) Figure 13. Localisation de la sebkha Ezzemoul Figure 14. Photo satellitaire prise par Europa Technologie en 2007 Figure 15. Photographies in situ de la sebkha Ezzemoul Figure 16. Effet de la concentration de NaCl sur la production du pigment par la souche B1 Figure 17. Photomicrographies électroniques de la souche 1’2 Figure 18. Photomicrographies électroniques de la souche 5.1 Figure 19. Photomicrographies électroniques de la souche B3 Pages 4 5 5 8 9 16 21 21 23 26 29 57 58 59 61 83 83 84 86
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