Diagnostic partiel de la flore et de la végétation des Niayes et du ...

Flore et végétation des Niayes et du Bassin arachidier
2.3.4.2. Indice de similarité
Le calcul d’un coefficient de similitude permet de quantifier le degré de ressemblance entre deux
groupements, ou encore le niveau de similitude entre deux sites compte tenu de leur flore.
Les indices de similarité sont utilisés pour des données binaires présence/absence ou réponse
positive/négative. Une question importante pour choisir un indice de similarité adéquat est de savoir
si le fait qu’une espèce soit absente de deux stations particulières contribue ou non à augmenter leur
similarité. Certains indices (Simple matching coefficient, Coefficient de Yule et Coefficient de
Baroni-Urbani Buser) utilise la double présence mais aussi la double absence (tableau 2.1).
Tableau 2.1. Modèle d’encodage : a espèce présente dans le groupement i et j, b espèce présente dans le
groupement i et absente dans le groupement j, c espèce absente dans le groupement i et présente dans le groupement j,
et d espèce absente dans les groupements i et j.
Groupement j
Groupement i Présence Absence
Présence a b
Absence c d
Les indices de SØrensen comme de Jaccard et de Nei et Li ne tiennent pas compte de la double
absence. Ils privilégient la double présence pour mesurer la similarité entre deux entités. L’indice de
SØrensen (1948) se distingue de l’indice de Jaccard (1908) uniquement par la multiplication par
deux de la valeur de la double présence. C’est pourquoi nous l’avons choisi dans le cadre de ce
travail. Il mesure l’existence d’une communauté entre deux groupements floristiques (Csij). Dérivé
de cet indice, l’indice de dissimilarité de SØrensen mesure la dissemblance entre les communautés
(Dsij). Ces deux indices complémentaires sont retrouvés par la relation :
Csij = 2a (2.1)
(2a+b+c)
2.3.4.3. Caractérisation des groupements
Les groupements sont d’abord caractérisés par la combinaison d’espèces caractéristiques qui
relèvent d’une classe synsystématique. Ensuite, nous distinguons les espèces de la même classe que
les espèces caractéristiques et enfin, nous faisons suivre les espèces des autres classes par ordre
d’affinité à la première classe. Nous fermons la liste par les espèces introduites et/ou cultivées
rencontrées dans les groupements. Ces informations floristiques sont complétées, d’une part, par
des caractéristiques biologiques et écosociologiques (types biologiques, phytogéographiques, types
de diaspores et types écosociologiques), et d’autre part, par des critères quantitatifs (fréquences
relatives, classes de présence et recouvrement moyen).
Ces différents éléments caractérisent respectivement les strates qui composent la structure verticale
des végétations étudiées, l’histoire et l’origine des différents taxons qui les colonisent, les types de
fruits qui sont produits dans ces formations et qui renseignent sur la distribution latitudinale et/ou
écologique de la biodiversité et enfin l’appartenance aux grands types de végétation terrestres
(annexes 2.5 à 2.15). Ces éléments sont importants pour la caractérisation des groupements. C’est
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