Denis LE PASLIER - CNRS

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Digesteur anaérobie Evry Library sequence # reads average in assembly fraction assembled size bp RI>=99 & RZ >= 0,9 Arachne Fosmid FES 1,7 M 645.3 40.1% 47.6 Plasmid PES 1 M 665.6 41.7% 46.8 GS-FLX 342 K 231.5 11.5% 26.2 7495 contigs organisés en 2827 scaffolds (75 Mb total) 40 -50 % FES dans assemblage Arachne Sondes choisies 50% FES dans assemblage Arachne
SC_Id Mb GC% Organism 0 5,7 0,62 Methanomicrobiales xxx Archaea 1 4,6 0,49 Bacteroidetes xxx 16S rDNA 2 3,7 0,64 Betaproteobacteria xxx protéines ribosomales 3 3,0 0,62 Verruvomicrobiales inconnus 4 2,8 0,40 Bacteroidetes 5 2,8 0,52 Methanosarcinales 6 2,2 0,38 Cloacamonas 7 2,2 0,66 Actinobacteria 8 2,1 0,66 Actinobacteria 9 2,2 0,56 Deltaproteobacteria 10 1,9 0,57 Synergistetes 11 2,0 0,58 Methanomicrobiales 12 1,6 0,55 Deltaproteobacteria 13 1,1 0,55 14 1,7 0,42 Methanomicrobiales 15 1,3 0,40 WWE1 16 0,9 0,57 17 0,7 0,39 OD1 18 0,7 0,35 WWE3 19 0,9 0,49 20 0,6 0,35 WS6 21 0,6 0,47 22 0,5 0,49 23 0,6 0,40 ZB2 25 0,5 0,35 26 0,7 0,50 Betaproteobacteria 28 0,6 0,58 33 0,6 0,44 36 0,7 0,56 41 0,6 0,48 4 Archaea 6 divisions candidates 10 affiliation inconnue ! Annotation MaGe
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