THÈSE - Université de Franche-Comté
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SOMMAIRE SOMMAIRE ...............................................................................................................................1 ABRÉVIATIONS .......................................................................................................................5 1. INTRODUCTION ..................................................................................................................7 1.1. Dynamiques de population de micromammifères.................................................................... 7 1.1.1. Typologies de dynamique et hypothèses explicatives....................................................................... 8 1.1.2. Influence de l’évolution de l’agriculture sur les dynamiques de population de micromammifère en Europe tempérée.................................................................................................................................... 11 1.1.3. Dynamique de population de campagnol terrestre en France...................................................... 13 1.1.3.1. Caractéristiques reproductives................................................................................................ 13 1.1.3.2. Vague de pullulation................................................................................................................. 13 1.1.3.3. Contexte agronomique franc-comtois ..................................................................................... 15 1.1.3.4. Conséquences socio-économiques des pullulations de campagnol terrestre en Franche- Comté...................................................................................................................................................... 15 1.1.3.5. Facteurs de régulation des populations : état des connaissances.......................................... 16 1.2. Interactions entre micromammifères et Système Sol – Végétation – Pratiques agricoles (SSVP) ............................................................................................................................................... 18 1.2.1. Interactions entre micromammifères et végétation ....................................................................... 18 1.2.1.1. Quantité et disponibilité de la ressource nutritive végétale................................................... 19 1.2.1.2. Qualité de la ressource nutritive végétale ............................................................................... 19 1.2.1.3. Structure du couvert végétal.................................................................................................... 20 1.2.2. Interactions entre micromammifères et sol.................................................................................... 20 1.2.3. Interactions entre micromammifères et pratiques agricoles ........................................................ 21 1.2.4. Interactions entre campagnol terrestre et SSVP dans les prairies franc-comtoises ................... 22 1.3. Problématique et objectifs........................................................................................................ 24 1.4. Organisation du mémoire......................................................................................................... 27 2. PREMIÈRE PARTIE : suivi des populations de campagnol terrestre à l’échelle parcellaire .................................................................................................................................28 2.1. Sélection des parcelles d’étude................................................................................................. 28 2.2. Méthode indiciaire d’estimation des densités relatives de campagnol terrestre ................. 31 3. DEUXIÈME PARTIE : influence des populations de taupe et de campagnol des champs sur les dynamiques de population du campagnol terrestre à l’échelle parcellaire................34 3.1. Questions.................................................................................................................................... 34 3.2. Matériel et Méthodes ................................................................................................................ 34 3.2.1. Sélection des parcelles d’étude ........................................................................................................ 34 3.2.2. Estimation des densités relatives de micromammifère.................................................................. 34 3.2.3. Analyse des données ......................................................................................................................... 35 3.3. Résultats..................................................................................................................................... 36 3.3.1. Typologie des cinétiques de croissance des populations de A. terrestris....................................... 36 3.3.2. Typologie des cinétiques des populations de T. europaeae et de M. arvalis ................................. 37 3.3.3. Relation entre les densités relatives de T. europaeae et de M. arvalis et les cinétiques de croissance des populations de A. terrestris................................................................................................ 39 3.4. Discussion................................................................................................................................... 40 Thèse C. Morilhat 2005 1
4. TROISIÈME PARTIE : influence du contexte paysager sur les dynamiques de population du campagnol terrestre à l’échelle parcellaire .....................................................45 4.1. Questions.................................................................................................................................... 45 4.2. Matériel et Méthodes ................................................................................................................ 45 4.2.1. Sélection des sites d’étude ................................................................................................................ 45 4.2.2. Caractérisation du contexte paysager............................................................................................. 45 4.2.3. Analyse des données ......................................................................................................................... 46 4.3. Résultats..................................................................................................................................... 47 4.3.1. Typologie des cinétiques de croissance des populations de A. terrestris....................................... 47 4.3.2. Influence du contexte paysager immédiat (rayon 1 km) ............................................................... 48 4.3.2.1. Ordination des parcelles d’étude en fonction des métriques paysagères calculées dans un rayon de 1 km......................................................................................................................................... 48 4.3.2.2. Relation entre dynamique de population de A. terrestris et métriques paysagères 1 km.... 49 4.3.2.3. Relation entre populations de T. europaea et M. arvalis et métriques paysagères 1 km..... 51 4.3.3. Influence du contexte paysager sectoriel (rayon 5 km) ................................................................. 52 4.3.3.1. Ordination des parcelles d’étude en fonction des métriques paysagères calculées dans un rayon de 5 km......................................................................................................................................... 52 4.3.3.2. Relation entre dynamique de population de A. terrestris et métriques paysagères 5 km.... 53 4.3.3.3. Relation entre populations de T. europaea et M. arvalis et métriques paysagères 5 km..... 55 4.4. Discussion................................................................................................................................... 56 5. QUATRIÈME PARTIE : influence des caractéristiques de la végétation sur les dynamiques de population du campagnol terrestre à l’échelle parcellaire............................61 5.1. Questions.................................................................................................................................... 61 5.2. Détermination de la composition en espèces végétales .......................................................... 61 5.2.1. Matériel et Méthodes........................................................................................................................ 61 5.2.1.1. Sélection des parcelles d’étude................................................................................................. 61 5.2.1.2. Détermination des Fréquences d’Occurrence d’Espèces végétales par Placette................. 62 5.2.1.3. Analyse des données.................................................................................................................. 63 5.2.2. Résultats ............................................................................................................................................ 63 5.2.3. Discussion .......................................................................................................................................... 64 5.3. Détermination de la composition en Groupes Fonctionnels Végétaux (GFV).................... 65 5.3.1. Matériel et Méthodes........................................................................................................................ 65 5.3.1.1. Sélection des parcelles d’étude................................................................................................. 65 5.3.1.2. Caractérisation des Traits d’Histoire de Vie des espèces végétales...................................... 65 5.3.1.3. Analyse des données.................................................................................................................. 67 5.3.2. Résultats ............................................................................................................................................ 68 5.3.2.1. Typologie des cinétiques de croissance des populations de A. terrestris ............................... 68 5.3.2.2. Ordination des parcelles d’étude en fonction des variables végétation................................ 69 5.3.2.3. Relation entre dynamique de population de A. terrestris et variables végétation................ 70 5.3.2.4. Relation entre populations de T. europaea et M. arvalis et variables végétation ................ 72 5.3.3. Discussion .......................................................................................................................................... 72 5.4. Mesures de Hauteur - Compacité du couvert Végétal (HCV) .............................................. 76 5.4.1. Suivi saisonnier de 2003 : étude de l’influence de la dynamique de croissance de l’herbe ........ 77 5.4.1.1. Matériel et Méthodes ................................................................................................................ 77 5.4.1.1.1. Sélection des sites d’étude................................................................................................. 77 5.4.1.1.2. Estimation des densités relatives saisonnières de micromammifère............................. 77 5.4.1.1.3. Mesures de Hauteur - Compacité du couvert Végétal (HCV)....................................... 77 5.4.1.1.4. Analyse des données......................................................................................................... 79 5.4.1.2. Résultats..................................................................................................................................... 81 Thèse C. Morilhat 2005 2
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4. TROISIÈME PARTIE : influence du contexte paysager sur les dynamiques <strong>de</strong><br />
population du campagnol terrestre à l’échelle parcellaire .....................................................45<br />
4.1. Questions.................................................................................................................................... 45<br />
4.2. Matériel et Métho<strong>de</strong>s ................................................................................................................ 45<br />
4.2.1. Sélection <strong>de</strong>s sites d’étu<strong>de</strong> ................................................................................................................ 45<br />
4.2.2. Caractérisation du contexte paysager............................................................................................. 45<br />
4.2.3. Analyse <strong>de</strong>s données ......................................................................................................................... 46<br />
4.3. Résultats..................................................................................................................................... 47<br />
4.3.1. Typologie <strong>de</strong>s cinétiques <strong>de</strong> croissance <strong>de</strong>s populations <strong>de</strong> A. terrestris....................................... 47<br />
4.3.2. Influence du contexte paysager immédiat (rayon 1 km) ............................................................... 48<br />
4.3.2.1. Ordination <strong>de</strong>s parcelles d’étu<strong>de</strong> en fonction <strong>de</strong>s métriques paysagères calculées dans un<br />
rayon <strong>de</strong> 1 km......................................................................................................................................... 48<br />
4.3.2.2. Relation entre dynamique <strong>de</strong> population <strong>de</strong> A. terrestris et métriques paysagères 1 km.... 49<br />
4.3.2.3. Relation entre populations <strong>de</strong> T. europaea et M. arvalis et métriques paysagères 1 km..... 51<br />
4.3.3. Influence du contexte paysager sectoriel (rayon 5 km) ................................................................. 52<br />
4.3.3.1. Ordination <strong>de</strong>s parcelles d’étu<strong>de</strong> en fonction <strong>de</strong>s métriques paysagères calculées dans un<br />
rayon <strong>de</strong> 5 km......................................................................................................................................... 52<br />
4.3.3.2. Relation entre dynamique <strong>de</strong> population <strong>de</strong> A. terrestris et métriques paysagères 5 km.... 53<br />
4.3.3.3. Relation entre populations <strong>de</strong> T. europaea et M. arvalis et métriques paysagères 5 km..... 55<br />
4.4. Discussion................................................................................................................................... 56<br />
5. QUATRIÈME PARTIE : influence <strong>de</strong>s caractéristiques <strong>de</strong> la végétation sur les<br />
dynamiques <strong>de</strong> population du campagnol terrestre à l’échelle parcellaire............................61<br />
5.1. Questions.................................................................................................................................... 61<br />
5.2. Détermination <strong>de</strong> la composition en espèces végétales .......................................................... 61<br />
5.2.1. Matériel et Métho<strong>de</strong>s........................................................................................................................ 61<br />
5.2.1.1. Sélection <strong>de</strong>s parcelles d’étu<strong>de</strong>................................................................................................. 61<br />
5.2.1.2. Détermination <strong>de</strong>s Fréquences d’Occurrence d’Espèces végétales par Placette................. 62<br />
5.2.1.3. Analyse <strong>de</strong>s données.................................................................................................................. 63<br />
5.2.2. Résultats ............................................................................................................................................ 63<br />
5.2.3. Discussion .......................................................................................................................................... 64<br />
5.3. Détermination <strong>de</strong> la composition en Groupes Fonctionnels Végétaux (GFV).................... 65<br />
5.3.1. Matériel et Métho<strong>de</strong>s........................................................................................................................ 65<br />
5.3.1.1. Sélection <strong>de</strong>s parcelles d’étu<strong>de</strong>................................................................................................. 65<br />
5.3.1.2. Caractérisation <strong>de</strong>s Traits d’Histoire <strong>de</strong> Vie <strong>de</strong>s espèces végétales...................................... 65<br />
5.3.1.3. Analyse <strong>de</strong>s données.................................................................................................................. 67<br />
5.3.2. Résultats ............................................................................................................................................ 68<br />
5.3.2.1. Typologie <strong>de</strong>s cinétiques <strong>de</strong> croissance <strong>de</strong>s populations <strong>de</strong> A. terrestris ............................... 68<br />
5.3.2.2. Ordination <strong>de</strong>s parcelles d’étu<strong>de</strong> en fonction <strong>de</strong>s variables végétation................................ 69<br />
5.3.2.3. Relation entre dynamique <strong>de</strong> population <strong>de</strong> A. terrestris et variables végétation................ 70<br />
5.3.2.4. Relation entre populations <strong>de</strong> T. europaea et M. arvalis et variables végétation ................ 72<br />
5.3.3. Discussion .......................................................................................................................................... 72<br />
5.4. Mesures <strong>de</strong> Hauteur - Compacité du couvert Végétal (HCV) .............................................. 76<br />
5.4.1. Suivi saisonnier <strong>de</strong> 2003 : étu<strong>de</strong> <strong>de</strong> l’influence <strong>de</strong> la dynamique <strong>de</strong> croissance <strong>de</strong> l’herbe ........ 77<br />
5.4.1.1. Matériel et Métho<strong>de</strong>s ................................................................................................................ 77<br />
5.4.1.1.1. Sélection <strong>de</strong>s sites d’étu<strong>de</strong>................................................................................................. 77<br />
5.4.1.1.2. Estimation <strong>de</strong>s <strong>de</strong>nsités relatives saisonnières <strong>de</strong> micromammifère............................. 77<br />
5.4.1.1.3. Mesures <strong>de</strong> Hauteur - Compacité du couvert Végétal (HCV)....................................... 77<br />
5.4.1.1.4. Analyse <strong>de</strong>s données......................................................................................................... 79<br />
5.4.1.2. Résultats..................................................................................................................................... 81<br />
Thèse C. Morilhat 2005 2
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