THÈSE - Université de Franche-Comté

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1.4. Organisation du mémoire Les travaux de thèse seront présentées en 6 parties, restituant les méthodes employées et la discussion des résultats obtenus par l’étude de l’influence de chacune des composantes du SSVP sur la dynamique de population du campagnol terrestre. Dans un premier temps, nous situerons dans les départements du Doubs (25) et du Jura (39) les parcelles d’étude, où ont été suivies les populations de campagnol terrestre, ainsi que la méthode indiciaire d’estimation de densité utilisée pour ce suivi. Les populations de campagnol des champs et de taupe seront également prises en compte. La seconde partie concernera l’influence des populations de taupe et de campagnol des champs sur la dynamique de population du campagnol terrestre à l’échelle parcellaire. Cette partie constituera la réponse à la question 5. La troisième partie présentera l’influence du contexte paysager des parcelles sur la dynamique des populations de campagnols et de taupe (réponse aux questions 1, 1’ et 1’’ et éléments de réponse pour la question 5). La quatrième partie présentera les effets des caractéristiques de la végétation des parcelles, étudiés par trois méthodes distinctes utilisant respectivement les Fréquences d’Occurrence d’Espèce végétale par Placette, les Groupes Fonctionnels Végétaux et la Hauteur - Compacité du couvert Végétal. Nous apporterons ici la réponse aux questions 2, 2’et 2’’et des éléments de réponse à la question 5. Une cinquième partie présentera l’influence du mode d’exploitation agricole des parcelles sur la dynamique des populations de campagnols et de taupe, par des études à court terme et des études à long terme (réponse aux questions 3, 3’ et 3’’ et éléments de réponse pour la question 5). Enfin, il sera question de l’impact des caractéristiques pédologiques sur la dynamique de population de campagnols et de taupe (réponse aux questions 4, 4’ et 4’’ et éléments de réponse à la question 5). La dernière partie consistera en une discussion générale de l’ensemble des résultats, qui conduira à une synthèse et à des propositions de perspectives de recherche. Thèse C. Morilhat 2005 27

2. PREMIÈRE PARTIE : suivi des populations de campagnol terrestre à l’échelle parcellaire 2.1. Sélection des parcelles d’étude Les sites d’étude sont situés dans les communes de démarrage et de diffusion des pullulations de campagnol terrestre (A. terrestris), dans les départements du Doubs (25) et du Jura (39). Dans ces communes, le Service Régional de la Protection des Végétaux (SRPV) et la Fédération Régionale de Défense contre les Organismes Nuisibles (FREDON) évaluent les abondances relatives saisonnières annuelles des populations de A. terrestris. Au printemps et à l’automne de chaque année, un des scores suivants est attribué à chaque commune (Giraudoux et al. 1995, 1997) : 0 : aucune colonie observée dans les pâtures et prairies, 1 : quelques colonies isolées, 2 : nombre moyen de colonies, 3 : très nombreuses colonies et risque important de dégâts aux récoltes agricoles. Ces scores permettent de situer chaque parcelle dans le contexte démographique général de la commune à laquelle elle appartient. La sélection des parcelles a été réalisée de la manière suivante : - Quarante-neuf parcelles ont été sélectionnées dans 22 communes où, deux ans après le pic de densité de 1998 (score 3), les populations de A. terrestris étaient à basse densité (score 0-1) en 2001 et ne présentaient pas de colonies de taupe (T. europaea) et de campagnol des champs (M. arvalis). Les parcelles se trouvaient ainsi au démarrage d'un nouveau cycle de pullulation. Elles ont été suivies de 2001 à 2004, c'est-à-dire pendant une phase de croissance s’étendant de 2002 à 2004. Ce jeu de données a permis de tester l’influence du contexte paysager (question 1), du Système Sol - Végétation - Pratiques agricoles (SSVP) et des populations de T. europaea et de M. arvalis sur la dynamique de population de A. terrestris (questions 2 à 5). Thèse C. Morilhat 2005 28

2. PREMIÈRE PARTIE : suivi <strong>de</strong>s populations <strong>de</strong> campagnol terrestre à<br />

l’échelle parcellaire<br />

2.1. Sélection <strong>de</strong>s parcelles d’étu<strong>de</strong><br />

Les sites d’étu<strong>de</strong> sont situés dans les communes <strong>de</strong> démarrage et <strong>de</strong> diffusion <strong>de</strong>s<br />

pullulations <strong>de</strong> campagnol terrestre (A. terrestris), dans les départements du Doubs (25) et du<br />

Jura (39). Dans ces communes, le Service Régional <strong>de</strong> la Protection <strong>de</strong>s Végétaux (SRPV) et<br />

la Fédération Régionale <strong>de</strong> Défense contre les Organismes Nuisibles (FREDON) évaluent les<br />

abondances relatives saisonnières annuelles <strong>de</strong>s populations <strong>de</strong> A. terrestris. Au printemps et à<br />

l’automne <strong>de</strong> chaque année, un <strong>de</strong>s scores suivants est attribué à chaque commune (Giraudoux<br />

et al. 1995, 1997) :<br />

0 : aucune colonie observée dans les pâtures et prairies,<br />

1 : quelques colonies isolées,<br />

2 : nombre moyen <strong>de</strong> colonies,<br />

3 : très nombreuses colonies et risque important <strong>de</strong> dégâts aux récoltes<br />

agricoles.<br />

Ces scores permettent <strong>de</strong> situer chaque parcelle dans le contexte démographique général <strong>de</strong><br />

la commune à laquelle elle appartient.<br />

La sélection <strong>de</strong>s parcelles a été réalisée <strong>de</strong> la manière suivante :<br />

- Quarante-neuf parcelles ont été sélectionnées dans 22 communes où, <strong>de</strong>ux ans après<br />

le pic <strong>de</strong> <strong>de</strong>nsité <strong>de</strong> 1998 (score 3), les populations <strong>de</strong> A. terrestris étaient à basse<br />

<strong>de</strong>nsité (score 0-1) en 2001 et ne présentaient pas <strong>de</strong> colonies <strong>de</strong> taupe (T. europaea) et<br />

<strong>de</strong> campagnol <strong>de</strong>s champs (M. arvalis). Les parcelles se trouvaient ainsi au démarrage<br />

d'un nouveau cycle <strong>de</strong> pullulation. Elles ont été suivies <strong>de</strong> 2001 à 2004, c'est-à-dire<br />

pendant une phase <strong>de</strong> croissance s’étendant <strong>de</strong> 2002 à 2004. Ce jeu <strong>de</strong> données a<br />

permis <strong>de</strong> tester l’influence du contexte paysager (question 1), du Système Sol -<br />

Végétation - Pratiques agricoles (SSVP) et <strong>de</strong>s populations <strong>de</strong> T. europaea et <strong>de</strong> M.<br />

arvalis sur la dynamique <strong>de</strong> population <strong>de</strong> A. terrestris (questions 2 à 5).<br />

Thèse C. Morilhat 2005 28

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